Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y005

Protein Details
Accession C4Y005    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-69EAEAKKKKAEEEKKKAELKKKQEEAKAKKLABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-73AKKKKAEEEKKKAELKKKQEEAKAKKLAAKSG
233-238GKKKAK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023194  eIF3-like_dom_sf  
IPR013906  eIF3j  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
KEGG clu:CLUG_01537  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08597  eIF3_subunit  
Amino Acid Sequences MSWDDEDFDIPTSSKPAANSWEEEVEDEPLMDSWDVDEEAEAKKKKAEEEKKKAELKKKQEEAKAKKLAAKSGAPKLMEIDMVDEETRKELLRQAELEADLNNAADLFGGLGVADDVNAHPREKLTIPVKKSSGFNKDTPLTEHPLFQPTNKQEFEKLRKTLGPILSGLAEDSLMNYSSSLAIDLIRDLVQPLSVENVRKVISTLNVTLKDKERQERQARLQKSGGTATGGAGKKKAKPLVKTNVNNTAFKKDVYDDMDANYDDFGDDDFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.19
4 0.24
5 0.27
6 0.29
7 0.3
8 0.32
9 0.3
10 0.3
11 0.28
12 0.24
13 0.2
14 0.17
15 0.13
16 0.1
17 0.11
18 0.1
19 0.08
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.11
27 0.19
28 0.2
29 0.19
30 0.22
31 0.25
32 0.32
33 0.41
34 0.49
35 0.53
36 0.62
37 0.71
38 0.77
39 0.83
40 0.83
41 0.82
42 0.81
43 0.8
44 0.8
45 0.78
46 0.77
47 0.78
48 0.82
49 0.8
50 0.81
51 0.78
52 0.69
53 0.66
54 0.6
55 0.56
56 0.5
57 0.48
58 0.43
59 0.43
60 0.45
61 0.4
62 0.38
63 0.35
64 0.31
65 0.26
66 0.2
67 0.14
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.08
76 0.08
77 0.12
78 0.15
79 0.18
80 0.18
81 0.18
82 0.2
83 0.2
84 0.2
85 0.16
86 0.13
87 0.1
88 0.09
89 0.07
90 0.05
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.02
96 0.02
97 0.02
98 0.02
99 0.02
100 0.02
101 0.02
102 0.02
103 0.03
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.11
110 0.12
111 0.18
112 0.22
113 0.27
114 0.29
115 0.34
116 0.35
117 0.35
118 0.37
119 0.36
120 0.36
121 0.34
122 0.33
123 0.33
124 0.34
125 0.32
126 0.33
127 0.3
128 0.28
129 0.25
130 0.25
131 0.21
132 0.24
133 0.23
134 0.2
135 0.26
136 0.25
137 0.3
138 0.3
139 0.3
140 0.31
141 0.38
142 0.45
143 0.45
144 0.42
145 0.39
146 0.39
147 0.41
148 0.42
149 0.36
150 0.29
151 0.22
152 0.21
153 0.19
154 0.18
155 0.15
156 0.09
157 0.07
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.1
181 0.11
182 0.13
183 0.13
184 0.16
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.14
189 0.15
190 0.17
191 0.2
192 0.23
193 0.27
194 0.29
195 0.32
196 0.34
197 0.37
198 0.4
199 0.44
200 0.46
201 0.52
202 0.59
203 0.65
204 0.71
205 0.74
206 0.71
207 0.69
208 0.65
209 0.57
210 0.52
211 0.45
212 0.36
213 0.28
214 0.25
215 0.21
216 0.25
217 0.24
218 0.22
219 0.24
220 0.27
221 0.3
222 0.37
223 0.44
224 0.44
225 0.49
226 0.58
227 0.65
228 0.72
229 0.74
230 0.74
231 0.76
232 0.73
233 0.7
234 0.63
235 0.6
236 0.51
237 0.44
238 0.4
239 0.32
240 0.34
241 0.34
242 0.35
243 0.28
244 0.28
245 0.31
246 0.28
247 0.26
248 0.2
249 0.16
250 0.12
251 0.11