Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XXH7

Protein Details
Accession C4XXH7    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-46AYQQGHRRSNSRHNTHHRESPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-436KAKEKKDLKP
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 12.833, cyto 4, cyto_nucl 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG clu:CLUG_00650  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MKGQVFTPGKSPAAAGNTSSNSSAAYQQGHRRSNSRHNTHHRESPTSGSSTGVGSAQLVDLVAKSCGKTVVATVSSGARYKGLLSSVDIPPSGNGMSVSLVGPRLVTRALLDEKSNSDSDLPETLLIQAKDLIDVEIVLSRHGDDQAKNGGDQNKTASGEKKSKQTPPPVAEPAVPTPQSRFKTDSDISSGFHFRERELQKWVPDDNSKALSLEDDSAPWDQFKVNEEKFGVESSYDEHLYTTKIDTSAHDYAQRLERAEKLAREIEGNASGDRHVLEERGLAVDDSGLDEEDKYSGVHNAVDTRGQELMAALRIGNGSKPQLPPSHEQPIVTHAAKDAPAKQTKPEEKPAPEKPAQTGKPVHSEAGSSSETSKSSENGGFRSAQSEFNALREFSANFKVPHKLPNDLLPILAKDKEKQEEILKQQKAKEKKDLKPFKLNPKAASFTPNKATSPVPPKASFKSPGTASPRMNTSRPYGPGSSGSATTKRHHQISAADFFGGADKVPTAEGQKEKISRMRQSFSLFTHAKQQAQKTEENAGKETVKGPVLQKPFYTPPTWDSTVDETYEELLASQTSKSNRAPMMAPVPGMPYLGNPLMMPAGGPQLAAGGFPGPAVASKYPVSPQMQSPATMAAQFQQQQQLQAMLYQQFQGGGPPGQPHLMYAPPDSQFIPPGFMIPGFANPGSPVNAAAGFTPGHNNYNGHPHHNRRYNGQGKRGNHHS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.27
4 0.28
5 0.3
6 0.3
7 0.25
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.2
12 0.22
13 0.26
14 0.34
15 0.43
16 0.48
17 0.51
18 0.55
19 0.59
20 0.66
21 0.7
22 0.71
23 0.72
24 0.77
25 0.83
26 0.83
27 0.83
28 0.78
29 0.74
30 0.68
31 0.64
32 0.58
33 0.51
34 0.44
35 0.37
36 0.32
37 0.26
38 0.24
39 0.17
40 0.13
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.19
58 0.19
59 0.19
60 0.19
61 0.21
62 0.22
63 0.23
64 0.21
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.15
71 0.17
72 0.22
73 0.23
74 0.25
75 0.23
76 0.21
77 0.19
78 0.2
79 0.17
80 0.12
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.14
96 0.18
97 0.2
98 0.21
99 0.22
100 0.24
101 0.27
102 0.27
103 0.22
104 0.19
105 0.18
106 0.19
107 0.18
108 0.16
109 0.13
110 0.13
111 0.15
112 0.18
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.15
117 0.16
118 0.16
119 0.14
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.11
129 0.14
130 0.17
131 0.14
132 0.18
133 0.25
134 0.25
135 0.25
136 0.29
137 0.32
138 0.3
139 0.3
140 0.3
141 0.27
142 0.29
143 0.31
144 0.31
145 0.32
146 0.4
147 0.42
148 0.47
149 0.49
150 0.55
151 0.6
152 0.65
153 0.67
154 0.64
155 0.67
156 0.63
157 0.59
158 0.52
159 0.48
160 0.42
161 0.39
162 0.34
163 0.28
164 0.27
165 0.34
166 0.35
167 0.35
168 0.35
169 0.31
170 0.38
171 0.39
172 0.38
173 0.36
174 0.35
175 0.32
176 0.31
177 0.31
178 0.23
179 0.25
180 0.23
181 0.17
182 0.26
183 0.29
184 0.29
185 0.34
186 0.38
187 0.37
188 0.4
189 0.41
190 0.36
191 0.36
192 0.36
193 0.32
194 0.3
195 0.27
196 0.24
197 0.22
198 0.18
199 0.16
200 0.15
201 0.12
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.09
209 0.1
210 0.14
211 0.21
212 0.2
213 0.23
214 0.24
215 0.25
216 0.25
217 0.24
218 0.2
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.18
235 0.2
236 0.2
237 0.22
238 0.21
239 0.23
240 0.28
241 0.28
242 0.23
243 0.22
244 0.23
245 0.25
246 0.27
247 0.25
248 0.23
249 0.24
250 0.23
251 0.22
252 0.21
253 0.18
254 0.17
255 0.17
256 0.14
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.08
306 0.11
307 0.13
308 0.15
309 0.19
310 0.23
311 0.26
312 0.31
313 0.36
314 0.33
315 0.33
316 0.3
317 0.3
318 0.31
319 0.27
320 0.22
321 0.15
322 0.15
323 0.16
324 0.17
325 0.17
326 0.18
327 0.22
328 0.22
329 0.25
330 0.32
331 0.38
332 0.41
333 0.45
334 0.45
335 0.45
336 0.52
337 0.54
338 0.53
339 0.49
340 0.46
341 0.41
342 0.44
343 0.41
344 0.39
345 0.38
346 0.32
347 0.35
348 0.35
349 0.32
350 0.23
351 0.22
352 0.18
353 0.18
354 0.17
355 0.11
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.09
362 0.12
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.16
367 0.15
368 0.15
369 0.16
370 0.15
371 0.14
372 0.14
373 0.16
374 0.15
375 0.15
376 0.17
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.12
381 0.11
382 0.15
383 0.15
384 0.16
385 0.18
386 0.21
387 0.21
388 0.26
389 0.27
390 0.26
391 0.24
392 0.29
393 0.32
394 0.28
395 0.27
396 0.21
397 0.2
398 0.19
399 0.21
400 0.16
401 0.14
402 0.17
403 0.2
404 0.2
405 0.22
406 0.25
407 0.29
408 0.35
409 0.43
410 0.42
411 0.42
412 0.46
413 0.51
414 0.55
415 0.53
416 0.56
417 0.56
418 0.61
419 0.69
420 0.74
421 0.73
422 0.75
423 0.77
424 0.78
425 0.78
426 0.74
427 0.66
428 0.61
429 0.58
430 0.48
431 0.48
432 0.4
433 0.34
434 0.36
435 0.35
436 0.3
437 0.29
438 0.29
439 0.29
440 0.34
441 0.35
442 0.34
443 0.34
444 0.38
445 0.39
446 0.43
447 0.41
448 0.35
449 0.36
450 0.32
451 0.37
452 0.4
453 0.42
454 0.39
455 0.36
456 0.4
457 0.38
458 0.38
459 0.34
460 0.31
461 0.31
462 0.32
463 0.34
464 0.3
465 0.28
466 0.29
467 0.29
468 0.26
469 0.22
470 0.21
471 0.21
472 0.23
473 0.24
474 0.3
475 0.31
476 0.33
477 0.31
478 0.31
479 0.34
480 0.37
481 0.39
482 0.32
483 0.27
484 0.24
485 0.24
486 0.22
487 0.16
488 0.1
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.07
494 0.08
495 0.13
496 0.15
497 0.17
498 0.23
499 0.25
500 0.28
501 0.34
502 0.38
503 0.41
504 0.45
505 0.45
506 0.44
507 0.46
508 0.46
509 0.41
510 0.44
511 0.37
512 0.32
513 0.38
514 0.37
515 0.38
516 0.39
517 0.42
518 0.41
519 0.44
520 0.46
521 0.39
522 0.44
523 0.42
524 0.4
525 0.37
526 0.32
527 0.28
528 0.27
529 0.25
530 0.2
531 0.18
532 0.19
533 0.19
534 0.24
535 0.28
536 0.29
537 0.28
538 0.31
539 0.35
540 0.36
541 0.35
542 0.3
543 0.29
544 0.35
545 0.37
546 0.32
547 0.3
548 0.31
549 0.31
550 0.3
551 0.26
552 0.19
553 0.18
554 0.17
555 0.13
556 0.09
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.11
562 0.13
563 0.18
564 0.19
565 0.25
566 0.25
567 0.27
568 0.28
569 0.29
570 0.32
571 0.29
572 0.28
573 0.22
574 0.23
575 0.21
576 0.2
577 0.15
578 0.1
579 0.13
580 0.13
581 0.13
582 0.11
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.1
587 0.07
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.07
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.07
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.05
601 0.06
602 0.09
603 0.1
604 0.12
605 0.13
606 0.16
607 0.17
608 0.23
609 0.25
610 0.25
611 0.27
612 0.32
613 0.32
614 0.32
615 0.31
616 0.28
617 0.26
618 0.24
619 0.21
620 0.15
621 0.19
622 0.21
623 0.23
624 0.27
625 0.28
626 0.29
627 0.3
628 0.3
629 0.25
630 0.24
631 0.25
632 0.2
633 0.2
634 0.18
635 0.17
636 0.16
637 0.15
638 0.16
639 0.15
640 0.14
641 0.15
642 0.16
643 0.17
644 0.19
645 0.18
646 0.18
647 0.18
648 0.2
649 0.21
650 0.22
651 0.25
652 0.25
653 0.27
654 0.27
655 0.25
656 0.26
657 0.24
658 0.25
659 0.19
660 0.2
661 0.19
662 0.17
663 0.18
664 0.15
665 0.16
666 0.17
667 0.17
668 0.16
669 0.16
670 0.18
671 0.19
672 0.18
673 0.16
674 0.14
675 0.15
676 0.15
677 0.14
678 0.14
679 0.11
680 0.12
681 0.17
682 0.18
683 0.2
684 0.22
685 0.23
686 0.23
687 0.33
688 0.35
689 0.37
690 0.44
691 0.51
692 0.6
693 0.67
694 0.68
695 0.65
696 0.73
697 0.75
698 0.74
699 0.75
700 0.73
701 0.7