Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C4XX71

Protein Details
Accession C4XX71    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-374PPQKPAPKAAPGKKKKPAPPTKKELQMQRRKAREEKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
341-373KPAPKAAPGKKKKPAPPTKKELQMQRRKAREEK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG clu:CLUG_00544  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MSDDEENIRSLEDDNVEEALPDWGLVSGKSTWKHDEQLPKRSEKYFDHDGSETQSSDLNRARGQMYDALSCIRGHLVRQILVAVWIPQRKMALVPHAKGAFFKDMGTAHVFKRKTKLSGMWLTPIETVYLTERGSLITYLSNEDFARFIEDDSLTFDYNSLRQLPMSYLYSLAFGGDPDLIDKYQVFALLKRLGYIVLEFQQYWPQLESWHDIHKEKTSLFSRAQSFFSSLGFHMRNSLSSTSFYSKHTHYFNYTKIFESLRLIPTYTAFETLESRPPIADPKYALHFNVWKPTPSFSKKHPPPPDFQIVIANVAKTPFPSLSAIQSLWNQLNFSFVPPQKPAPKAAPGKKKKPAPPTKKELQMQRRKAREEKLDPRIVQRNNYLKLRDTKLKNGSTGRCVVLATIDSGIITFNSLNETEFSLKSQHSLKDLNAITTKPSHGVVWNEPIKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.17
4 0.16
5 0.15
6 0.13
7 0.1
8 0.09
9 0.07
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.1
14 0.13
15 0.18
16 0.22
17 0.26
18 0.3
19 0.34
20 0.39
21 0.44
22 0.51
23 0.54
24 0.61
25 0.64
26 0.65
27 0.65
28 0.64
29 0.64
30 0.58
31 0.57
32 0.57
33 0.53
34 0.51
35 0.48
36 0.45
37 0.44
38 0.41
39 0.34
40 0.25
41 0.25
42 0.21
43 0.25
44 0.28
45 0.26
46 0.24
47 0.27
48 0.27
49 0.25
50 0.27
51 0.26
52 0.25
53 0.23
54 0.22
55 0.21
56 0.22
57 0.2
58 0.18
59 0.16
60 0.14
61 0.14
62 0.19
63 0.21
64 0.21
65 0.22
66 0.21
67 0.18
68 0.19
69 0.19
70 0.16
71 0.17
72 0.19
73 0.19
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.22
78 0.22
79 0.27
80 0.31
81 0.32
82 0.37
83 0.38
84 0.38
85 0.36
86 0.36
87 0.3
88 0.23
89 0.22
90 0.18
91 0.17
92 0.2
93 0.23
94 0.22
95 0.2
96 0.27
97 0.28
98 0.28
99 0.34
100 0.37
101 0.36
102 0.39
103 0.42
104 0.44
105 0.51
106 0.5
107 0.48
108 0.44
109 0.42
110 0.37
111 0.31
112 0.23
113 0.15
114 0.14
115 0.11
116 0.13
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.13
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.15
140 0.16
141 0.13
142 0.12
143 0.13
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.08
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.13
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.13
189 0.13
190 0.14
191 0.13
192 0.11
193 0.11
194 0.13
195 0.16
196 0.14
197 0.19
198 0.2
199 0.21
200 0.22
201 0.24
202 0.24
203 0.2
204 0.25
205 0.22
206 0.24
207 0.24
208 0.27
209 0.28
210 0.28
211 0.3
212 0.24
213 0.23
214 0.2
215 0.19
216 0.15
217 0.12
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.15
222 0.14
223 0.15
224 0.16
225 0.17
226 0.13
227 0.14
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.23
235 0.24
236 0.23
237 0.26
238 0.28
239 0.3
240 0.33
241 0.33
242 0.3
243 0.29
244 0.28
245 0.24
246 0.23
247 0.23
248 0.2
249 0.19
250 0.18
251 0.16
252 0.17
253 0.18
254 0.16
255 0.14
256 0.11
257 0.11
258 0.14
259 0.15
260 0.2
261 0.18
262 0.18
263 0.16
264 0.17
265 0.21
266 0.2
267 0.2
268 0.16
269 0.18
270 0.22
271 0.23
272 0.23
273 0.21
274 0.25
275 0.24
276 0.31
277 0.29
278 0.27
279 0.27
280 0.3
281 0.36
282 0.36
283 0.38
284 0.37
285 0.47
286 0.52
287 0.61
288 0.68
289 0.63
290 0.63
291 0.67
292 0.68
293 0.58
294 0.51
295 0.46
296 0.36
297 0.36
298 0.31
299 0.24
300 0.16
301 0.16
302 0.15
303 0.11
304 0.12
305 0.09
306 0.1
307 0.12
308 0.13
309 0.15
310 0.18
311 0.18
312 0.18
313 0.19
314 0.2
315 0.2
316 0.19
317 0.17
318 0.14
319 0.17
320 0.16
321 0.16
322 0.21
323 0.21
324 0.25
325 0.27
326 0.34
327 0.37
328 0.39
329 0.41
330 0.38
331 0.45
332 0.51
333 0.58
334 0.62
335 0.65
336 0.73
337 0.77
338 0.81
339 0.8
340 0.82
341 0.84
342 0.83
343 0.83
344 0.82
345 0.82
346 0.82
347 0.8
348 0.8
349 0.8
350 0.8
351 0.81
352 0.82
353 0.81
354 0.79
355 0.8
356 0.78
357 0.78
358 0.77
359 0.76
360 0.76
361 0.77
362 0.72
363 0.72
364 0.72
365 0.65
366 0.6
367 0.6
368 0.59
369 0.57
370 0.61
371 0.57
372 0.54
373 0.59
374 0.6
375 0.61
376 0.57
377 0.6
378 0.63
379 0.65
380 0.65
381 0.65
382 0.63
383 0.59
384 0.58
385 0.5
386 0.41
387 0.37
388 0.31
389 0.25
390 0.2
391 0.16
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.07
398 0.08
399 0.07
400 0.06
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.15
406 0.17
407 0.17
408 0.19
409 0.2
410 0.2
411 0.23
412 0.27
413 0.27
414 0.29
415 0.32
416 0.31
417 0.36
418 0.38
419 0.4
420 0.37
421 0.35
422 0.33
423 0.33
424 0.34
425 0.27
426 0.27
427 0.24
428 0.25
429 0.31
430 0.32
431 0.39