Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PML1

Protein Details
Accession D8PML1    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
525-565AVKAERQARRVEKKATKEQFDAEMKNAKRRLTTKERKTKKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-284KKRRRK
517-565EEKKARKAAVKAERQARRVEKKATKEQFDAEMKNAKRRLTTKERKTKKL
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG scm:SCHCO_02697286  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPKSKSIYRQPGAKHFQLVHRSQRDPLIHDPDASQHVLRPFVRENEKKGKSRAELEEILTPAETNQRPNIGEAALYGIYYDDTEYDYMQHLRQAGVEEEGVDSILIEAPAAAKKKVKDKDNIGIQLKDLPEGVLASTTELPRNYESQQAIPESLAGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDDDLEDDFFGELVAEGERADPDEVNFEFAEEGLEEETPAAQEEDEDVAEEDLRWEERFSRFKKAQKQADVDDDLMSTDDFRSEGGDTIGTLPAMSVIGAKKRRRKGTSDASGYSMSSSSLHRTDTLQTLDSQYDQVMAKEYNDEDDEDEDEDEDDIDEVPDLILSRPDFEDMMDEFLNDFELLGRKMQHKLEGDTGVEKLDTFRRALGTVREVDLRETPDRDPNDNELSLDSEDEKEDQWDCESILSTYSNLENHPRLIRARESATRRTKKAAVPHIALDPKTGLPIVTPPSSNPNTKSAPHSRPTKPPFDDGSSGSDTETEATHRQTIARPKNETAEEKKARKAAVKAERQARRVEKKATKEQFDAEMKNAKRRLTTKERKTKKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.66
3 0.59
4 0.62
5 0.63
6 0.64
7 0.64
8 0.63
9 0.62
10 0.59
11 0.62
12 0.58
13 0.54
14 0.56
15 0.54
16 0.47
17 0.46
18 0.44
19 0.4
20 0.4
21 0.37
22 0.29
23 0.24
24 0.25
25 0.3
26 0.3
27 0.32
28 0.32
29 0.38
30 0.48
31 0.5
32 0.56
33 0.6
34 0.68
35 0.69
36 0.7
37 0.7
38 0.66
39 0.68
40 0.66
41 0.63
42 0.58
43 0.54
44 0.53
45 0.45
46 0.4
47 0.32
48 0.25
49 0.18
50 0.23
51 0.22
52 0.21
53 0.23
54 0.27
55 0.28
56 0.29
57 0.3
58 0.22
59 0.21
60 0.17
61 0.18
62 0.14
63 0.13
64 0.11
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.05
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.12
75 0.14
76 0.14
77 0.16
78 0.15
79 0.15
80 0.16
81 0.18
82 0.16
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.08
90 0.07
91 0.05
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.1
98 0.12
99 0.13
100 0.16
101 0.2
102 0.3
103 0.37
104 0.43
105 0.48
106 0.54
107 0.62
108 0.67
109 0.71
110 0.66
111 0.59
112 0.53
113 0.49
114 0.42
115 0.33
116 0.24
117 0.16
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.11
125 0.12
126 0.14
127 0.14
128 0.16
129 0.17
130 0.2
131 0.2
132 0.24
133 0.24
134 0.24
135 0.26
136 0.26
137 0.24
138 0.21
139 0.21
140 0.15
141 0.14
142 0.12
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.09
147 0.08
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.17
153 0.16
154 0.15
155 0.16
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.1
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.09
222 0.15
223 0.23
224 0.25
225 0.33
226 0.38
227 0.44
228 0.54
229 0.61
230 0.63
231 0.63
232 0.65
233 0.59
234 0.59
235 0.54
236 0.44
237 0.35
238 0.27
239 0.2
240 0.16
241 0.12
242 0.07
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.11
264 0.18
265 0.24
266 0.31
267 0.39
268 0.47
269 0.49
270 0.54
271 0.57
272 0.61
273 0.65
274 0.62
275 0.56
276 0.5
277 0.47
278 0.41
279 0.33
280 0.22
281 0.14
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.14
290 0.16
291 0.17
292 0.15
293 0.15
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.03
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.06
330 0.06
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.11
337 0.09
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.07
345 0.07
346 0.05
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.11
351 0.13
352 0.17
353 0.18
354 0.23
355 0.24
356 0.26
357 0.29
358 0.29
359 0.27
360 0.25
361 0.24
362 0.18
363 0.16
364 0.13
365 0.11
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.18
373 0.19
374 0.19
375 0.2
376 0.2
377 0.22
378 0.21
379 0.22
380 0.22
381 0.23
382 0.22
383 0.22
384 0.23
385 0.27
386 0.3
387 0.31
388 0.32
389 0.32
390 0.34
391 0.32
392 0.31
393 0.25
394 0.24
395 0.21
396 0.18
397 0.15
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.12
410 0.1
411 0.11
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.18
419 0.18
420 0.21
421 0.23
422 0.24
423 0.25
424 0.29
425 0.31
426 0.3
427 0.34
428 0.38
429 0.42
430 0.49
431 0.58
432 0.61
433 0.6
434 0.62
435 0.62
436 0.6
437 0.63
438 0.63
439 0.6
440 0.55
441 0.55
442 0.55
443 0.53
444 0.48
445 0.4
446 0.32
447 0.25
448 0.23
449 0.2
450 0.13
451 0.1
452 0.14
453 0.17
454 0.18
455 0.18
456 0.18
457 0.27
458 0.31
459 0.34
460 0.33
461 0.35
462 0.36
463 0.39
464 0.46
465 0.47
466 0.51
467 0.54
468 0.6
469 0.6
470 0.66
471 0.7
472 0.72
473 0.66
474 0.65
475 0.63
476 0.6
477 0.58
478 0.49
479 0.49
480 0.42
481 0.38
482 0.32
483 0.26
484 0.2
485 0.17
486 0.16
487 0.14
488 0.14
489 0.16
490 0.18
491 0.19
492 0.21
493 0.27
494 0.37
495 0.43
496 0.48
497 0.51
498 0.52
499 0.58
500 0.62
501 0.63
502 0.6
503 0.61
504 0.63
505 0.62
506 0.66
507 0.63
508 0.6
509 0.59
510 0.57
511 0.57
512 0.58
513 0.63
514 0.65
515 0.71
516 0.75
517 0.71
518 0.74
519 0.74
520 0.73
521 0.71
522 0.73
523 0.72
524 0.74
525 0.82
526 0.82
527 0.78
528 0.72
529 0.68
530 0.67
531 0.65
532 0.58
533 0.52
534 0.52
535 0.49
536 0.54
537 0.54
538 0.48
539 0.5
540 0.51
541 0.56
542 0.59
543 0.67
544 0.69
545 0.76