Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PMR0

Protein Details
Accession D8PMR0    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23PSKPQFWLRCEKKPFEKRAALTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10pero 10cyto_pero 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007886  AlaDH/PNT_N  
IPR007698  AlaDH/PNT_NAD(H)-bd  
IPR027281  Lys1  
IPR036291  NAD(P)-bd_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004754  F:saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming) activity  
GO:0019878  P:lysine biosynthetic process via aminoadipic acid  
KEGG scm:SCHCO_02612998  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05222  AlaDh_PNT_N  
CDD cd12188  SDH  
Amino Acid Sequences MPSKPQFWLRCEKKPFEKRAALTPTTAKKLIDQGFEIFVERDEQRIFDDKEYEAVGCKLVDNNTWPNAPKDIPIIGLKELEESTDPLPHTHIQFAHCYKNQAGWSKVLDRFHRGGGKLYDLEFLIDATGRRVAAFGYHAGFAGAAAGALALAANKKGQQLGLLTPYPNEDEMVKAVRAALPGGSGKGVRALVIGALGRCGRGAVDLFRKIGLEENDIVKWDMAETAKGGPFQEILDVDIFVNCIYLSSSIPPFLTQEFIQKAGKNRRLSVVVDVSCDTTNPHNPIPIYNINTTFSHPTVPVETGAGNPPLSVISIDHLPTLLPREASEQFSHDLLPSLLEFPNRDKARVWTDAEKLFREKLSAAVQAERQAKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.81
4 0.82
5 0.75
6 0.76
7 0.76
8 0.67
9 0.61
10 0.6
11 0.57
12 0.54
13 0.53
14 0.44
15 0.38
16 0.45
17 0.46
18 0.42
19 0.37
20 0.33
21 0.34
22 0.34
23 0.32
24 0.23
25 0.19
26 0.19
27 0.17
28 0.18
29 0.16
30 0.16
31 0.18
32 0.25
33 0.27
34 0.26
35 0.28
36 0.25
37 0.27
38 0.27
39 0.24
40 0.19
41 0.17
42 0.15
43 0.13
44 0.13
45 0.14
46 0.14
47 0.16
48 0.19
49 0.23
50 0.25
51 0.28
52 0.29
53 0.28
54 0.3
55 0.29
56 0.26
57 0.24
58 0.22
59 0.22
60 0.23
61 0.22
62 0.2
63 0.2
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.15
72 0.16
73 0.14
74 0.18
75 0.19
76 0.2
77 0.21
78 0.23
79 0.21
80 0.28
81 0.31
82 0.36
83 0.35
84 0.37
85 0.34
86 0.37
87 0.4
88 0.39
89 0.37
90 0.32
91 0.34
92 0.37
93 0.4
94 0.4
95 0.38
96 0.38
97 0.38
98 0.39
99 0.4
100 0.35
101 0.36
102 0.32
103 0.33
104 0.28
105 0.27
106 0.24
107 0.19
108 0.18
109 0.13
110 0.11
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.07
129 0.06
130 0.04
131 0.03
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.11
148 0.14
149 0.15
150 0.14
151 0.14
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.08
157 0.07
158 0.09
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.04
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.05
189 0.06
190 0.08
191 0.14
192 0.15
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.19
198 0.17
199 0.14
200 0.14
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.12
206 0.11
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.13
242 0.11
243 0.16
244 0.17
245 0.2
246 0.22
247 0.24
248 0.32
249 0.4
250 0.47
251 0.45
252 0.45
253 0.47
254 0.47
255 0.46
256 0.43
257 0.41
258 0.34
259 0.32
260 0.31
261 0.28
262 0.25
263 0.23
264 0.19
265 0.16
266 0.21
267 0.23
268 0.23
269 0.25
270 0.25
271 0.27
272 0.31
273 0.33
274 0.32
275 0.31
276 0.32
277 0.31
278 0.32
279 0.33
280 0.3
281 0.25
282 0.23
283 0.2
284 0.2
285 0.2
286 0.2
287 0.18
288 0.15
289 0.15
290 0.14
291 0.17
292 0.17
293 0.14
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.08
300 0.08
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.11
307 0.16
308 0.16
309 0.14
310 0.14
311 0.2
312 0.22
313 0.26
314 0.27
315 0.25
316 0.25
317 0.25
318 0.25
319 0.2
320 0.19
321 0.15
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.14
326 0.16
327 0.17
328 0.19
329 0.3
330 0.3
331 0.31
332 0.3
333 0.35
334 0.4
335 0.45
336 0.47
337 0.43
338 0.48
339 0.53
340 0.55
341 0.52
342 0.49
343 0.46
344 0.41
345 0.37
346 0.32
347 0.3
348 0.31
349 0.33
350 0.31
351 0.32
352 0.34
353 0.39