FuNGI

C4R601

Protein Details

Accession

C4R601

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-32	LPEPKNAPKRSIPHRSQNKNQILIP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
237-243	KKIKEKE
259-259	R
289-295	AERRRRA

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0000974 C:Prp19 complex GO:0060090 F:molecular adaptor activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome
KEGG	ppa:PAS_chr3_1240 -
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MQSISSFLPEPKNAPKRSIPHRSQNKNQILIPLEAKELSTVNYQQASYGDLIPLRHTTKNIDLSRPSEEEIASCTERTKRALERIINDKLHAANPSSIGKPSNGPQFVKYTPASLDGNAQQRTIKIVERQKDPMLPSSVRHRKVPPGPPPPPPPVLHTSSKKASNEEQKKWHIPPAVSNWKNPKGFTIAVDKRMAAMADDPDRTNVNQVGFSNLAEALEKADKSARENIKLRNEVQKKIKEKERLEQEEKLRLMAVKAREARLAKSQRGRESTDDSKLAGLSEREAIRAERRRRAERELKLTRNQDESQIAAFTKDRDISNEVVLGQSSKGTQSMESRFDSRLFLKASGTNAKSSEDQIYNEPLFAAQEVISSIYRPKQLETLQDDVNSDEELRKINKNAKFEVLGKAKLGFSGSDGLQPSTGGPIRFEKESGKRPASEDEVQDKHSEEAYKRTKQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.56
3	0.59
4	0.67
5	0.73
6	0.71
7	0.72
8	0.8
9	0.84
10	0.86
11	0.88
12	0.86
13	0.81
14	0.75
15	0.7
16	0.63
17	0.57
18	0.5
19	0.41
20	0.33
21	0.28
22	0.26
23	0.21
24	0.18
25	0.16
26	0.18
27	0.18
28	0.2
29	0.22
30	0.22
31	0.22
32	0.22
33	0.22
34	0.19
35	0.18
36	0.16
37	0.16
38	0.16
39	0.18
40	0.22
41	0.23
42	0.24
43	0.24
44	0.28
45	0.34
46	0.43
47	0.44
48	0.46
49	0.46
50	0.47
51	0.51
52	0.48
53	0.41
54	0.33
55	0.3
56	0.24
57	0.23
58	0.25
59	0.2
60	0.19
61	0.2
62	0.22
63	0.25
64	0.28
65	0.31
66	0.32
67	0.39
68	0.47
69	0.5
70	0.52
71	0.57
72	0.62
73	0.58
74	0.52
75	0.46
76	0.39
77	0.36
78	0.31
79	0.26
80	0.19
81	0.21
82	0.24
83	0.22
84	0.22
85	0.21
86	0.2
87	0.21
88	0.24
89	0.3
90	0.32
91	0.32
92	0.32
93	0.36
94	0.36
95	0.38
96	0.33
97	0.26
98	0.23
99	0.25
100	0.24
101	0.19
102	0.23
103	0.23
104	0.29
105	0.28
106	0.28
107	0.25
108	0.24
109	0.27
110	0.25
111	0.23
112	0.24
113	0.3
114	0.36
115	0.4
116	0.44
117	0.44
118	0.46
119	0.45
120	0.42
121	0.4
122	0.35
123	0.32
124	0.39
125	0.45
126	0.44
127	0.46
128	0.43
129	0.47
130	0.55
131	0.62
132	0.61
133	0.62
134	0.64
135	0.67
136	0.7
137	0.66
138	0.62
139	0.54
140	0.49
141	0.44
142	0.44
143	0.44
144	0.42
145	0.43
146	0.43
147	0.48
148	0.44
149	0.42
150	0.44
151	0.48
152	0.53
153	0.53
154	0.56
155	0.57
156	0.61
157	0.59
158	0.57
159	0.51
160	0.43
161	0.42
162	0.44
163	0.49
164	0.45
165	0.48
166	0.5
167	0.53
168	0.54
169	0.48
170	0.4
171	0.34
172	0.33
173	0.31
174	0.33
175	0.29
176	0.32
177	0.32
178	0.3
179	0.26
180	0.25
181	0.23
182	0.13
183	0.11
184	0.1
185	0.12
186	0.13
187	0.13
188	0.13
189	0.14
190	0.14
191	0.15
192	0.14
193	0.12
194	0.13
195	0.13
196	0.14
197	0.14
198	0.14
199	0.12
200	0.1
201	0.09
202	0.08
203	0.07
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.1
209	0.1
210	0.12
211	0.21
212	0.22
213	0.26
214	0.31
215	0.36
216	0.42
217	0.44
218	0.44
219	0.46
220	0.47
221	0.47
222	0.51
223	0.52
224	0.51
225	0.54
226	0.59
227	0.58
228	0.57
229	0.59
230	0.61
231	0.62
232	0.61
233	0.6
234	0.56
235	0.54
236	0.52
237	0.44
238	0.34
239	0.26
240	0.22
241	0.2
242	0.19
243	0.18
244	0.21
245	0.22
246	0.25
247	0.26
248	0.27
249	0.32
250	0.36
251	0.35
252	0.4
253	0.45
254	0.46
255	0.49
256	0.5
257	0.44
258	0.46
259	0.45
260	0.41
261	0.37
262	0.31
263	0.27
264	0.24
265	0.21
266	0.16
267	0.12
268	0.09
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.13
273	0.14
274	0.21
275	0.3
276	0.35
277	0.38
278	0.45
279	0.52
280	0.56
281	0.64
282	0.66
283	0.64
284	0.69
285	0.7
286	0.69
287	0.69
288	0.7
289	0.63
290	0.6
291	0.53
292	0.46
293	0.38
294	0.33
295	0.27
296	0.23
297	0.2
298	0.15
299	0.15
300	0.12
301	0.14
302	0.15
303	0.15
304	0.17
305	0.2
306	0.2
307	0.2
308	0.2
309	0.18
310	0.15
311	0.15
312	0.12
313	0.09
314	0.08
315	0.08
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.1
320	0.16
321	0.2
322	0.24
323	0.26
324	0.28
325	0.28
326	0.29
327	0.3
328	0.25
329	0.26
330	0.24
331	0.23
332	0.23
333	0.24
334	0.27
335	0.32
336	0.32
337	0.29
338	0.28
339	0.29
340	0.28
341	0.28
342	0.29
343	0.23
344	0.24
345	0.24
346	0.29
347	0.27
348	0.25
349	0.23
350	0.17
351	0.16
352	0.14
353	0.12
354	0.06
355	0.07
356	0.07
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.12
361	0.15
362	0.2
363	0.21
364	0.22
365	0.26
366	0.29
367	0.37
368	0.4
369	0.4
370	0.38
371	0.38
372	0.37
373	0.31
374	0.29
375	0.21
376	0.16
377	0.14
378	0.12
379	0.15
380	0.18
381	0.22
382	0.27
383	0.34
384	0.39
385	0.43
386	0.46
387	0.46
388	0.48
389	0.46
390	0.5
391	0.47
392	0.44
393	0.39
394	0.38
395	0.33
396	0.3
397	0.28
398	0.19
399	0.15
400	0.17
401	0.17
402	0.19
403	0.2
404	0.2
405	0.19
406	0.19
407	0.17
408	0.19
409	0.22
410	0.18
411	0.19
412	0.25
413	0.28
414	0.29
415	0.31
416	0.33
417	0.38
418	0.47
419	0.54
420	0.53
421	0.52
422	0.54
423	0.58
424	0.57
425	0.54
426	0.52
427	0.51
428	0.49
429	0.48
430	0.47
431	0.42
432	0.37
433	0.35
434	0.34
435	0.27
436	0.35

C4R601

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer