Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PWT3

Protein Details
Accession D8PWT3    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-54GGGHTRRRSSRSRSPRRDDRDRDRRGABasic
195-214AVDIKKMRTWRQYMNRRGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-93DRDRDRDRYSRGGGGGHTRRRSSRSRSPRRDDRDRDRRGALPSHRDRRDYERKYDEPPHRERDRGTGRDADRRYDRRDR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSRGDYRRRDDRGDRDRDRDRYSRGGGGGHTRRRSSRSRSPRRDDRDRDRRGALPSHRDRRDYERKYDEPPHRERDRGTGRDADRRYDRRDRDDRRDDYRPLPPRRPEDRDDRRGRYTDEAPPRGAGSVSGRSDHEAPTHHADGRPNLDPDAPDGPKDEPMEEMDEEAAMMQMMGLSGFGSTKNKHVEGNQEGAVDIKKMRTWRQYMNRRGGFNRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.76
3 0.75
4 0.78
5 0.77
6 0.75
7 0.71
8 0.67
9 0.64
10 0.61
11 0.57
12 0.5
13 0.45
14 0.4
15 0.43
16 0.46
17 0.47
18 0.48
19 0.47
20 0.5
21 0.53
22 0.59
23 0.58
24 0.6
25 0.63
26 0.69
27 0.76
28 0.82
29 0.87
30 0.88
31 0.9
32 0.89
33 0.88
34 0.88
35 0.85
36 0.8
37 0.74
38 0.69
39 0.62
40 0.61
41 0.56
42 0.56
43 0.59
44 0.64
45 0.63
46 0.61
47 0.6
48 0.62
49 0.66
50 0.61
51 0.6
52 0.59
53 0.58
54 0.61
55 0.67
56 0.66
57 0.63
58 0.64
59 0.64
60 0.59
61 0.59
62 0.54
63 0.54
64 0.54
65 0.49
66 0.46
67 0.44
68 0.44
69 0.5
70 0.5
71 0.45
72 0.44
73 0.46
74 0.49
75 0.51
76 0.52
77 0.53
78 0.62
79 0.64
80 0.66
81 0.71
82 0.69
83 0.67
84 0.68
85 0.62
86 0.56
87 0.57
88 0.57
89 0.54
90 0.56
91 0.55
92 0.58
93 0.62
94 0.63
95 0.58
96 0.59
97 0.63
98 0.65
99 0.67
100 0.63
101 0.59
102 0.56
103 0.54
104 0.48
105 0.42
106 0.4
107 0.41
108 0.38
109 0.35
110 0.34
111 0.32
112 0.28
113 0.24
114 0.17
115 0.12
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.16
120 0.17
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.13
125 0.17
126 0.21
127 0.23
128 0.22
129 0.23
130 0.24
131 0.26
132 0.29
133 0.28
134 0.23
135 0.22
136 0.22
137 0.2
138 0.21
139 0.24
140 0.2
141 0.18
142 0.19
143 0.19
144 0.22
145 0.23
146 0.2
147 0.15
148 0.16
149 0.19
150 0.17
151 0.16
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.07
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.05
168 0.09
169 0.1
170 0.16
171 0.21
172 0.22
173 0.25
174 0.27
175 0.35
176 0.36
177 0.4
178 0.36
179 0.31
180 0.3
181 0.29
182 0.27
183 0.19
184 0.16
185 0.13
186 0.15
187 0.2
188 0.27
189 0.35
190 0.4
191 0.49
192 0.59
193 0.68
194 0.74
195 0.8
196 0.79
197 0.76
198 0.74
199 0.73
200 0.69
201 0.68
202 0.66