Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PSS1

Protein Details
Accession D8PSS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
355-383ALLSRTQRIRHTWKERQARPKPPVARPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
370-380RQARPKPPVAR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, pero 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR001339  mRNA_cap_enzyme_adenylation  
IPR017075  mRNA_cap_enzyme_alpha  
IPR013846  mRNA_cap_enzyme_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0031533  C:mRNA cap methyltransferase complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0004484  F:mRNA guanylyltransferase activity  
GO:0006370  P:7-methylguanosine mRNA capping  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG scm:SCHCO_02015055  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03919  mRNA_cap_C  
PF01331  mRNA_cap_enzyme  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd07895  Adenylation_mRNA_capping  
Amino Acid Sequences SPIPDIPGELVHPNSDQGLWLKAQVARLCHLDNDRFPGSQPISFGERNLADLENDDFWVCEKSDGIRVLLLILTNPETQEQITCLIDRHNTYRKVEGFYFPHFEKLAIPIRSTLLDGELVLDVDPVTKTETLRYLAFDCMVVDDQYIMNKPLDKRYGRLSDWFYKPYATMLSDHPDQANLQPFHIQVKKMHAAYQVSQVFDEDIPKLQHGNDGLIYTKVEAPYTPNTDRNILKWKPPSENSIDFKLVVRFPPSPSNPGLPDFFAKPVFALHAWYGDERGMSKYELYDQLYVTDEEWESLKESGVQVDDRIVEVHWDSELQKWRMMRFRDDKPNGNHISVVENIIRSIADGVEKDALLSRTQRIRHTWKERQARPKPPVARPAAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.16
4 0.15
5 0.17
6 0.15
7 0.16
8 0.19
9 0.2
10 0.26
11 0.27
12 0.28
13 0.28
14 0.31
15 0.31
16 0.32
17 0.36
18 0.36
19 0.36
20 0.4
21 0.4
22 0.36
23 0.36
24 0.4
25 0.36
26 0.32
27 0.3
28 0.27
29 0.3
30 0.3
31 0.3
32 0.27
33 0.25
34 0.25
35 0.25
36 0.22
37 0.16
38 0.18
39 0.2
40 0.15
41 0.15
42 0.13
43 0.11
44 0.11
45 0.14
46 0.12
47 0.1
48 0.1
49 0.12
50 0.18
51 0.2
52 0.2
53 0.18
54 0.17
55 0.17
56 0.17
57 0.15
58 0.09
59 0.09
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.14
73 0.17
74 0.19
75 0.25
76 0.31
77 0.35
78 0.37
79 0.43
80 0.44
81 0.45
82 0.45
83 0.44
84 0.4
85 0.39
86 0.42
87 0.35
88 0.35
89 0.3
90 0.28
91 0.23
92 0.25
93 0.29
94 0.25
95 0.25
96 0.23
97 0.24
98 0.24
99 0.24
100 0.18
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.1
117 0.13
118 0.15
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.09
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.12
137 0.14
138 0.19
139 0.26
140 0.26
141 0.27
142 0.33
143 0.39
144 0.36
145 0.4
146 0.41
147 0.41
148 0.44
149 0.44
150 0.36
151 0.31
152 0.3
153 0.25
154 0.21
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.16
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.15
165 0.21
166 0.17
167 0.17
168 0.18
169 0.18
170 0.22
171 0.24
172 0.23
173 0.17
174 0.23
175 0.26
176 0.25
177 0.27
178 0.26
179 0.25
180 0.25
181 0.31
182 0.27
183 0.23
184 0.23
185 0.2
186 0.18
187 0.16
188 0.16
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.11
209 0.15
210 0.21
211 0.22
212 0.24
213 0.26
214 0.3
215 0.3
216 0.3
217 0.35
218 0.31
219 0.35
220 0.39
221 0.41
222 0.43
223 0.45
224 0.46
225 0.44
226 0.5
227 0.47
228 0.44
229 0.41
230 0.35
231 0.34
232 0.32
233 0.27
234 0.2
235 0.21
236 0.18
237 0.2
238 0.28
239 0.29
240 0.3
241 0.3
242 0.33
243 0.31
244 0.31
245 0.3
246 0.23
247 0.23
248 0.21
249 0.2
250 0.18
251 0.16
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.11
256 0.12
257 0.1
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.11
263 0.12
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.15
271 0.18
272 0.2
273 0.2
274 0.18
275 0.19
276 0.2
277 0.2
278 0.17
279 0.15
280 0.12
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.13
291 0.13
292 0.11
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.16
305 0.25
306 0.25
307 0.28
308 0.3
309 0.35
310 0.42
311 0.45
312 0.48
313 0.47
314 0.55
315 0.63
316 0.67
317 0.7
318 0.69
319 0.75
320 0.69
321 0.62
322 0.54
323 0.44
324 0.41
325 0.33
326 0.3
327 0.22
328 0.18
329 0.17
330 0.16
331 0.15
332 0.12
333 0.12
334 0.09
335 0.1
336 0.1
337 0.12
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.17
342 0.18
343 0.18
344 0.21
345 0.25
346 0.3
347 0.34
348 0.39
349 0.44
350 0.52
351 0.61
352 0.68
353 0.72
354 0.75
355 0.82
356 0.86
357 0.88
358 0.89
359 0.88
360 0.85
361 0.85
362 0.84
363 0.82
364 0.83