FuNGI

Q0U9M6

Protein Details

Accession

Q0U9M6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
80-103	IADKELPKSRRQQRLEKSAPQNDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 14, cyto 12.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0016607 C:nuclear speck GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0003723 F:RNA binding GO:0042134 F:rRNA primary transcript binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0034462 P:small-subunit processome assembly
KEGG	pno:SNOG_11538 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12320 RRM6_RBM19_RRM5_MRD1

Amino Acid Sequences

MTTAMESSRIFVRGLPPRFTEDDVRKHFAKFPVTDVKFFPHRRIGYVGYKSPEDAAKAVKYFNKTFINLTKIYAEIARPIADKELPKSRRQQRLEKSAPQNDEYIAPLQENALKRKREQAELEQDPKLKEFLQVYQAPSKTNIWTNGDTQPDVAVASGEEIVPAVVVPEDESDDDYQVIAKKPKTAVDNATFVEANVASKPTVEAKSVDSTKDVSAQLDEDMEGVEPSGGPVTDDDWLRSRTNRVLDLVEDDELPAPTDRSQVSEAPQKRQPEVIEQPDEAEAVEEQAPEADHTKVPSSDEVEKIRETGRLYLRNLHFEVTEDELRQHFAKYGSLEEVHVPLKKSDGKGKGFAFIQFKEPEQAVVAYDDTDGTIFQGRLLHIISAKAKKDTSLNEFEISKLPLKKQKEIRRKQDATRATFNWNSLYLNADAVMSTIANRMGISKAELLDPTSSDAAVKQAHAETHIIQETKSYFAQHGVDLEAFQRSAKGDLAILVKNVPHGVTPDELRKMFEEHGTVTKFLMPPTGMTAIVEFSNIAQAKTAFMSLSYRKMKDSILYLEKAPKDLFKEGAVIDVPRTSTSGGPAAKLSATDLLEEAPEPEAANTATLYVRNLNFTTTTERLTEAFKPLSGFRSAKVKTKVDPKRGVLSMGFGFVEFNSAETASAALRTMDGHDLEGHKLQIKASHKGADAAEERRKEDAAKKAASTKIIIKNLPFEAGKKDVRALFTPYGQLRSVRVPKKFDASSRGFGFAEFTTKRDAVNAMNALKNTHLLGRRLVLAFAETESDDPEAELEKMQQKVGAQANKVALQRLTEGGRKKFNVAGTDDLDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.41
3	0.41
4	0.45
5	0.48
6	0.5
7	0.51
8	0.49
9	0.54
10	0.57
11	0.6
12	0.55
13	0.55
14	0.57
15	0.54
16	0.54
17	0.46
18	0.46
19	0.51
20	0.53
21	0.53
22	0.48
23	0.49
24	0.5
25	0.51
26	0.5
27	0.49
28	0.47
29	0.48
30	0.51
31	0.51
32	0.51
33	0.55
34	0.55
35	0.49
36	0.48
37	0.45
38	0.43
39	0.39
40	0.32
41	0.27
42	0.26
43	0.27
44	0.27
45	0.31
46	0.33
47	0.37
48	0.37
49	0.42
50	0.43
51	0.4
52	0.45
53	0.47
54	0.48
55	0.43
56	0.43
57	0.37
58	0.31
59	0.31
60	0.27
61	0.21
62	0.19
63	0.2
64	0.2
65	0.18
66	0.19
67	0.21
68	0.23
69	0.25
70	0.28
71	0.36
72	0.38
73	0.44
74	0.53
75	0.59
76	0.65
77	0.7
78	0.74
79	0.74
80	0.81
81	0.84
82	0.83
83	0.84
84	0.82
85	0.79
86	0.7
87	0.61
88	0.51
89	0.44
90	0.36
91	0.29
92	0.21
93	0.17
94	0.15
95	0.15
96	0.19
97	0.22
98	0.27
99	0.33
100	0.35
101	0.37
102	0.47
103	0.5
104	0.53
105	0.55
106	0.57
107	0.6
108	0.65
109	0.68
110	0.62
111	0.61
112	0.54
113	0.49
114	0.4
115	0.3
116	0.26
117	0.24
118	0.24
119	0.28
120	0.31
121	0.34
122	0.4
123	0.4
124	0.37
125	0.37
126	0.36
127	0.32
128	0.33
129	0.34
130	0.33
131	0.34
132	0.36
133	0.39
134	0.4
135	0.36
136	0.31
137	0.26
138	0.2
139	0.18
140	0.14
141	0.09
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.05
147	0.05
148	0.05
149	0.05
150	0.04
151	0.04
152	0.03
153	0.03
154	0.04
155	0.05
156	0.06
157	0.07
158	0.09
159	0.1
160	0.1
161	0.11
162	0.1
163	0.11
164	0.13
165	0.17
166	0.21
167	0.21
168	0.25
169	0.27
170	0.32
171	0.34
172	0.36
173	0.4
174	0.39
175	0.42
176	0.37
177	0.38
178	0.33
179	0.28
180	0.26
181	0.18
182	0.14
183	0.11
184	0.12
185	0.09
186	0.09
187	0.11
188	0.13
189	0.15
190	0.15
191	0.16
192	0.18
193	0.25
194	0.27
195	0.26
196	0.23
197	0.23
198	0.22
199	0.25
200	0.23
201	0.16
202	0.16
203	0.16
204	0.15
205	0.13
206	0.12
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.05
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.05
219	0.06
220	0.09
221	0.09
222	0.11
223	0.14
224	0.17
225	0.18
226	0.2
227	0.23
228	0.25
229	0.28
230	0.29
231	0.27
232	0.26
233	0.25
234	0.27
235	0.24
236	0.2
237	0.16
238	0.14
239	0.13
240	0.12
241	0.12
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.11
246	0.11
247	0.13
248	0.15
249	0.16
250	0.19
251	0.28
252	0.3
253	0.33
254	0.38
255	0.37
256	0.36
257	0.38
258	0.36
259	0.35
260	0.39
261	0.41
262	0.39
263	0.36
264	0.36
265	0.32
266	0.31
267	0.22
268	0.16
269	0.09
270	0.07
271	0.08
272	0.07
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.09
278	0.08
279	0.08
280	0.1
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.14
285	0.16
286	0.19
287	0.22
288	0.23
289	0.24
290	0.24
291	0.23
292	0.23
293	0.22
294	0.19
295	0.22
296	0.26
297	0.29
298	0.3
299	0.37
300	0.38
301	0.4
302	0.39
303	0.34
304	0.27
305	0.23
306	0.24
307	0.2
308	0.19
309	0.15
310	0.16
311	0.15
312	0.17
313	0.16
314	0.14
315	0.12
316	0.11
317	0.13
318	0.13
319	0.14
320	0.14
321	0.14
322	0.15
323	0.13
324	0.14
325	0.14
326	0.15
327	0.14
328	0.13
329	0.16
330	0.18
331	0.2
332	0.25
333	0.31
334	0.31
335	0.36
336	0.37
337	0.36
338	0.34
339	0.36
340	0.32
341	0.25
342	0.27
343	0.23
344	0.22
345	0.21
346	0.2
347	0.16
348	0.13
349	0.13
350	0.09
351	0.09
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.06
361	0.05
362	0.06
363	0.08
364	0.08
365	0.09
366	0.1
367	0.1
368	0.08
369	0.1
370	0.14
371	0.17
372	0.18
373	0.19
374	0.18
375	0.19
376	0.22
377	0.23
378	0.25
379	0.26
380	0.27
381	0.26
382	0.27
383	0.26
384	0.25
385	0.23
386	0.21
387	0.17
388	0.19
389	0.23
390	0.27
391	0.33
392	0.41
393	0.49
394	0.57
395	0.64
396	0.71
397	0.75
398	0.77
399	0.74
400	0.74
401	0.7
402	0.65
403	0.61
404	0.53
405	0.47
406	0.43
407	0.4
408	0.32
409	0.26
410	0.2
411	0.15
412	0.15
413	0.11
414	0.09
415	0.09
416	0.07
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.05
427	0.06
428	0.06
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.08
439	0.08
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.09
448	0.1
449	0.11
450	0.09
451	0.12
452	0.14
453	0.13
454	0.12
455	0.14
456	0.13
457	0.15
458	0.14
459	0.12
460	0.1
461	0.12
462	0.14
463	0.12
464	0.12
465	0.11
466	0.1
467	0.1
468	0.1
469	0.08
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.06
474	0.08
475	0.08
476	0.07
477	0.07
478	0.1
479	0.12
480	0.12
481	0.12
482	0.11
483	0.11
484	0.11
485	0.11
486	0.08
487	0.06
488	0.07
489	0.08
490	0.09
491	0.11
492	0.15
493	0.18
494	0.18
495	0.19
496	0.19
497	0.2
498	0.19
499	0.19
500	0.16
501	0.15
502	0.2
503	0.2
504	0.19
505	0.17
506	0.19
507	0.18
508	0.16
509	0.17
510	0.12
511	0.11
512	0.14
513	0.15
514	0.12
515	0.11
516	0.11
517	0.1
518	0.1
519	0.09
520	0.06
521	0.05
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.11
528	0.11
529	0.12
530	0.06
531	0.07
532	0.11
533	0.12
534	0.21
535	0.25
536	0.25
537	0.26
538	0.27
539	0.28
540	0.26
541	0.28
542	0.26
543	0.26
544	0.27
545	0.27
546	0.32
547	0.31
548	0.31
549	0.27
550	0.23
551	0.22
552	0.23
553	0.23
554	0.18
555	0.2
556	0.18
557	0.19
558	0.17
559	0.14
560	0.12
561	0.12
562	0.12
563	0.09
564	0.1
565	0.1
566	0.09
567	0.11
568	0.16
569	0.15
570	0.15
571	0.15
572	0.15
573	0.14
574	0.14
575	0.13
576	0.11
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.1
581	0.1
582	0.1
583	0.1
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.06
588	0.07
589	0.07
590	0.08
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.08
595	0.09
596	0.12
597	0.12
598	0.15
599	0.15
600	0.15
601	0.16
602	0.17
603	0.23
604	0.2
605	0.21
606	0.19
607	0.2
608	0.2
609	0.22
610	0.23
611	0.21
612	0.2
613	0.19
614	0.2
615	0.21
616	0.23
617	0.25
618	0.23
619	0.2
620	0.29
621	0.3
622	0.37
623	0.43
624	0.43
625	0.43
626	0.53
627	0.61
628	0.61
629	0.67
630	0.63
631	0.63
632	0.61
633	0.58
634	0.48
635	0.42
636	0.33
637	0.26
638	0.22
639	0.14
640	0.14
641	0.11
642	0.13
643	0.08
644	0.08
645	0.08
646	0.08
647	0.08
648	0.08
649	0.08
650	0.06
651	0.07
652	0.07
653	0.06
654	0.06
655	0.06
656	0.08
657	0.1
658	0.11
659	0.11
660	0.14
661	0.15
662	0.17
663	0.19
664	0.18
665	0.19
666	0.19
667	0.19
668	0.23
669	0.26
670	0.3
671	0.32
672	0.35
673	0.32
674	0.35
675	0.35
676	0.35
677	0.34
678	0.35
679	0.39
680	0.36
681	0.37
682	0.35
683	0.36
684	0.33
685	0.36
686	0.39
687	0.4
688	0.4
689	0.41
690	0.46
691	0.49
692	0.47
693	0.43
694	0.42
695	0.43
696	0.45
697	0.45
698	0.4
699	0.43
700	0.41
701	0.43
702	0.35
703	0.28
704	0.28
705	0.32
706	0.33
707	0.29
708	0.33
709	0.32
710	0.35
711	0.36
712	0.37
713	0.34
714	0.33
715	0.38
716	0.35
717	0.35
718	0.33
719	0.32
720	0.28
721	0.34
722	0.42
723	0.43
724	0.47
725	0.5
726	0.52
727	0.58
728	0.6
729	0.56
730	0.55
731	0.54
732	0.55
733	0.52
734	0.52
735	0.44
736	0.39
737	0.37
738	0.29
739	0.3
740	0.23
741	0.22
742	0.24
743	0.25
744	0.25
745	0.24
746	0.26
747	0.2
748	0.27
749	0.32
750	0.29
751	0.32
752	0.32
753	0.31
754	0.3
755	0.28
756	0.22
757	0.23
758	0.25
759	0.24
760	0.27
761	0.28
762	0.32
763	0.32
764	0.31
765	0.25
766	0.2
767	0.19
768	0.16
769	0.16
770	0.11
771	0.11
772	0.12
773	0.12
774	0.11
775	0.1
776	0.1
777	0.1
778	0.11
779	0.11
780	0.15
781	0.2
782	0.22
783	0.22
784	0.23
785	0.22
786	0.29
787	0.36
788	0.37
789	0.33
790	0.37
791	0.41
792	0.44
793	0.45
794	0.41
795	0.34
796	0.29
797	0.3
798	0.29
799	0.3
800	0.31
801	0.37
802	0.41
803	0.48
804	0.48
805	0.49
806	0.49
807	0.5
808	0.49
809	0.46
810	0.45

Q0U9M6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer