Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PTX5

Protein Details
Accession D8PTX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-82DDGATTSKPPARKRRKTKASTNEIKAPRPRKRGKLSALPDMPHydrophilic
597-620DLEAHLRHSHQRKRITKKDFVMGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-74KPPARKRRKTKASTNEIKAPRPRKRGK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Pfam View protein in Pfam  
PF00646  F-box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd09917  F-box_SF  
Amino Acid Sequences MRRSSRLSKPAVEAAMADDAATDDHDEVVASPLPEEPDSEDDGATTSKPPARKRRKTKASTNEIKAPRPRKRGKLSALPDMPMDILYEIFRSLHPSDLLHLARTTKAFRSLLMNRSSAWLWKDGYAAYADDLPPIPGDLTIPQFMSLAYDRICHFCNAPSGVTTIVWDARVRTCKKCLNVFVTETSRDQIFKSLAECLPVVTVRTGNRSVERLYPAHLVKQLAHEYASDAKDQGWQWKETSAWFRERSKQHMAKVQHAKSCEKWHAAREKERGDELKQSRDSRQADILRRMTDLGWGDEIQMLGVDKFGKYKHVRKSQKLTEKMWLQIKDELVEYMEEVKRTRLEEEKRETRWARYRLLVEVYTEYRVAQPLDTILPNVGDIAIIDEVSHIIEGTPWDQELTKTDLRAVLDAIPKSFFDDWLHRCETALVQVLNTARRKKRATRADLKLAATAFGIKNYSRELHYPSLLVDDTMTKVYMSEKDKQRGEVHILCGHKPWSAERLIPSYHYIAKKVVTLAGLDPSRATGEDMDKRDPWSWRNMVACTDRGTRFELLGDDETALARAEVAKTKGIPIFHGDNGEKGMCAHCEKCFANFKDLEAHLRHSHQRKRITKKDFVMGMLYNIRGHCVELPKSSTTKTTM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.3
3 0.24
4 0.19
5 0.12
6 0.11
7 0.11
8 0.11
9 0.09
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.08
15 0.11
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.13
20 0.16
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.18
25 0.22
26 0.22
27 0.2
28 0.18
29 0.19
30 0.19
31 0.16
32 0.14
33 0.16
34 0.19
35 0.25
36 0.35
37 0.45
38 0.56
39 0.66
40 0.75
41 0.82
42 0.89
43 0.92
44 0.93
45 0.93
46 0.92
47 0.92
48 0.88
49 0.86
50 0.8
51 0.79
52 0.77
53 0.77
54 0.76
55 0.76
56 0.78
57 0.79
58 0.83
59 0.85
60 0.84
61 0.85
62 0.81
63 0.81
64 0.74
65 0.65
66 0.55
67 0.46
68 0.38
69 0.27
70 0.22
71 0.12
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.14
79 0.14
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.2
84 0.26
85 0.27
86 0.23
87 0.24
88 0.22
89 0.23
90 0.25
91 0.26
92 0.22
93 0.28
94 0.26
95 0.26
96 0.33
97 0.37
98 0.42
99 0.43
100 0.41
101 0.35
102 0.37
103 0.37
104 0.32
105 0.27
106 0.24
107 0.21
108 0.21
109 0.22
110 0.19
111 0.19
112 0.16
113 0.15
114 0.12
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.15
133 0.13
134 0.13
135 0.12
136 0.14
137 0.15
138 0.17
139 0.19
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.21
144 0.21
145 0.21
146 0.19
147 0.18
148 0.18
149 0.17
150 0.15
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.17
157 0.25
158 0.28
159 0.31
160 0.38
161 0.42
162 0.48
163 0.53
164 0.54
165 0.52
166 0.52
167 0.51
168 0.49
169 0.47
170 0.43
171 0.37
172 0.32
173 0.26
174 0.23
175 0.2
176 0.19
177 0.16
178 0.14
179 0.15
180 0.18
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.1
189 0.12
190 0.12
191 0.16
192 0.18
193 0.19
194 0.21
195 0.22
196 0.23
197 0.25
198 0.27
199 0.24
200 0.24
201 0.28
202 0.27
203 0.28
204 0.28
205 0.25
206 0.22
207 0.27
208 0.26
209 0.21
210 0.21
211 0.18
212 0.17
213 0.21
214 0.21
215 0.16
216 0.14
217 0.14
218 0.18
219 0.18
220 0.24
221 0.22
222 0.22
223 0.22
224 0.24
225 0.24
226 0.23
227 0.29
228 0.26
229 0.29
230 0.32
231 0.35
232 0.42
233 0.45
234 0.47
235 0.51
236 0.52
237 0.5
238 0.54
239 0.53
240 0.54
241 0.6
242 0.59
243 0.51
244 0.49
245 0.48
246 0.44
247 0.48
248 0.43
249 0.38
250 0.36
251 0.4
252 0.45
253 0.48
254 0.52
255 0.52
256 0.51
257 0.48
258 0.49
259 0.45
260 0.38
261 0.42
262 0.37
263 0.38
264 0.39
265 0.4
266 0.39
267 0.45
268 0.45
269 0.37
270 0.42
271 0.41
272 0.4
273 0.45
274 0.45
275 0.38
276 0.36
277 0.35
278 0.27
279 0.24
280 0.2
281 0.14
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.06
295 0.06
296 0.13
297 0.18
298 0.26
299 0.35
300 0.45
301 0.53
302 0.59
303 0.68
304 0.7
305 0.75
306 0.73
307 0.66
308 0.62
309 0.57
310 0.55
311 0.51
312 0.44
313 0.36
314 0.33
315 0.31
316 0.25
317 0.22
318 0.17
319 0.12
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.16
330 0.19
331 0.23
332 0.31
333 0.39
334 0.45
335 0.45
336 0.52
337 0.51
338 0.51
339 0.54
340 0.51
341 0.45
342 0.43
343 0.42
344 0.37
345 0.38
346 0.32
347 0.24
348 0.23
349 0.21
350 0.17
351 0.16
352 0.14
353 0.11
354 0.12
355 0.11
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.04
368 0.03
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.04
377 0.03
378 0.03
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.09
388 0.15
389 0.15
390 0.15
391 0.16
392 0.18
393 0.18
394 0.18
395 0.16
396 0.15
397 0.18
398 0.18
399 0.18
400 0.16
401 0.16
402 0.18
403 0.18
404 0.15
405 0.14
406 0.21
407 0.23
408 0.28
409 0.3
410 0.26
411 0.26
412 0.26
413 0.23
414 0.19
415 0.21
416 0.15
417 0.13
418 0.16
419 0.17
420 0.22
421 0.26
422 0.31
423 0.31
424 0.38
425 0.44
426 0.5
427 0.59
428 0.63
429 0.69
430 0.71
431 0.75
432 0.77
433 0.76
434 0.69
435 0.61
436 0.51
437 0.41
438 0.31
439 0.26
440 0.17
441 0.13
442 0.14
443 0.11
444 0.13
445 0.15
446 0.16
447 0.15
448 0.17
449 0.22
450 0.24
451 0.25
452 0.24
453 0.22
454 0.23
455 0.21
456 0.18
457 0.13
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.08
463 0.08
464 0.1
465 0.16
466 0.19
467 0.27
468 0.34
469 0.42
470 0.44
471 0.48
472 0.49
473 0.47
474 0.51
475 0.47
476 0.43
477 0.41
478 0.4
479 0.36
480 0.36
481 0.33
482 0.27
483 0.23
484 0.21
485 0.21
486 0.22
487 0.24
488 0.25
489 0.28
490 0.27
491 0.28
492 0.29
493 0.27
494 0.31
495 0.3
496 0.28
497 0.26
498 0.26
499 0.27
500 0.25
501 0.23
502 0.17
503 0.17
504 0.16
505 0.21
506 0.2
507 0.17
508 0.16
509 0.15
510 0.16
511 0.15
512 0.15
513 0.11
514 0.18
515 0.25
516 0.29
517 0.32
518 0.32
519 0.35
520 0.39
521 0.4
522 0.36
523 0.38
524 0.37
525 0.39
526 0.41
527 0.4
528 0.41
529 0.41
530 0.41
531 0.36
532 0.4
533 0.36
534 0.34
535 0.36
536 0.31
537 0.28
538 0.27
539 0.23
540 0.21
541 0.21
542 0.2
543 0.17
544 0.15
545 0.15
546 0.14
547 0.13
548 0.08
549 0.07
550 0.07
551 0.09
552 0.14
553 0.16
554 0.18
555 0.19
556 0.23
557 0.26
558 0.25
559 0.25
560 0.26
561 0.29
562 0.27
563 0.33
564 0.3
565 0.28
566 0.31
567 0.29
568 0.23
569 0.2
570 0.2
571 0.17
572 0.21
573 0.21
574 0.2
575 0.26
576 0.27
577 0.33
578 0.41
579 0.41
580 0.45
581 0.44
582 0.44
583 0.45
584 0.46
585 0.46
586 0.39
587 0.42
588 0.38
589 0.42
590 0.5
591 0.51
592 0.59
593 0.6
594 0.68
595 0.72
596 0.78
597 0.83
598 0.83
599 0.83
600 0.8
601 0.81
602 0.74
603 0.66
604 0.6
605 0.51
606 0.47
607 0.41
608 0.36
609 0.3
610 0.26
611 0.26
612 0.22
613 0.22
614 0.23
615 0.26
616 0.29
617 0.32
618 0.36
619 0.38
620 0.41
621 0.41