Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8Q5B3

Protein Details
Accession D8Q5B3    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-40WKGARKCPLGRGAKRKCANYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 7.5cyto_nucl 7.5, cyto 6.5, mito 5, plas 2, pero 2, extr 1, E.R. 1, golg 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
Amino Acid Sequences MHSVVGGEPEAGAVQHASAAWKGARKCPLGRGAKRKCANYGARVQNERNRSVTLQKRKAGLLKKAYELGVLCSVDIAVIIFEERPNHRVKLYQYASSNIDRIVQRQTKYRGETDTLGPADFGGAEYVQDDDEDEDDAHEEDVRPAKRARRVAGPRDDQDDEDDSQDNRERKGSTGHGDSKHGPPSFDFLRALAGDAAYNNLAGFNPSAAGSFGSSSPPGFNAAQYAALAHQAALARQAAMLPSSSYRPGPSRGATHPTSSERGGIPNISDRALLNAERMALASERERHAALTSERERASSDARFQIPSPVSRPGTAGPDLDWALLAARAGGGGGLGGSGGSGPGGGGGALGLGSTPTPLSVFNNLPSLPFGVGAFDGDTFDGRGGGAVRASSLSDARAFPGPLGGGGDGFKPGIPPFEWPPASGGSNSRRNSARDGDGGGGGGDPHGEGKDDWLNFLSGGGWPVKQEAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.06
3 0.07
4 0.08
5 0.08
6 0.12
7 0.14
8 0.2
9 0.23
10 0.29
11 0.36
12 0.4
13 0.44
14 0.49
15 0.56
16 0.61
17 0.68
18 0.72
19 0.74
20 0.79
21 0.82
22 0.78
23 0.74
24 0.73
25 0.71
26 0.68
27 0.68
28 0.67
29 0.68
30 0.71
31 0.72
32 0.69
33 0.69
34 0.64
35 0.57
36 0.51
37 0.46
38 0.49
39 0.53
40 0.57
41 0.59
42 0.6
43 0.61
44 0.61
45 0.66
46 0.65
47 0.64
48 0.63
49 0.58
50 0.57
51 0.57
52 0.52
53 0.47
54 0.39
55 0.33
56 0.28
57 0.24
58 0.2
59 0.17
60 0.16
61 0.13
62 0.12
63 0.09
64 0.03
65 0.03
66 0.04
67 0.05
68 0.06
69 0.11
70 0.13
71 0.16
72 0.2
73 0.22
74 0.22
75 0.27
76 0.3
77 0.36
78 0.38
79 0.4
80 0.38
81 0.41
82 0.44
83 0.41
84 0.38
85 0.28
86 0.3
87 0.24
88 0.25
89 0.31
90 0.32
91 0.32
92 0.39
93 0.46
94 0.47
95 0.51
96 0.53
97 0.47
98 0.45
99 0.46
100 0.41
101 0.41
102 0.34
103 0.29
104 0.26
105 0.21
106 0.17
107 0.14
108 0.11
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.16
129 0.16
130 0.18
131 0.22
132 0.28
133 0.34
134 0.4
135 0.4
136 0.44
137 0.52
138 0.59
139 0.65
140 0.65
141 0.6
142 0.6
143 0.58
144 0.48
145 0.42
146 0.36
147 0.27
148 0.23
149 0.22
150 0.17
151 0.18
152 0.23
153 0.21
154 0.19
155 0.21
156 0.2
157 0.2
158 0.25
159 0.26
160 0.25
161 0.31
162 0.37
163 0.35
164 0.38
165 0.4
166 0.39
167 0.41
168 0.37
169 0.31
170 0.24
171 0.28
172 0.26
173 0.25
174 0.22
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.11
180 0.1
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.06
185 0.06
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.1
234 0.12
235 0.15
236 0.17
237 0.18
238 0.21
239 0.23
240 0.29
241 0.28
242 0.28
243 0.28
244 0.28
245 0.28
246 0.24
247 0.23
248 0.18
249 0.18
250 0.17
251 0.15
252 0.13
253 0.15
254 0.15
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.06
268 0.07
269 0.09
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.15
276 0.17
277 0.16
278 0.22
279 0.23
280 0.27
281 0.27
282 0.27
283 0.27
284 0.25
285 0.28
286 0.22
287 0.23
288 0.24
289 0.25
290 0.26
291 0.25
292 0.3
293 0.28
294 0.28
295 0.27
296 0.28
297 0.28
298 0.27
299 0.29
300 0.23
301 0.25
302 0.24
303 0.22
304 0.16
305 0.17
306 0.17
307 0.16
308 0.14
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.02
324 0.02
325 0.02
326 0.02
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.02
336 0.02
337 0.02
338 0.02
339 0.02
340 0.02
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.05
346 0.08
347 0.13
348 0.15
349 0.16
350 0.19
351 0.19
352 0.19
353 0.2
354 0.19
355 0.15
356 0.13
357 0.12
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.09
380 0.1
381 0.12
382 0.13
383 0.14
384 0.17
385 0.17
386 0.15
387 0.17
388 0.15
389 0.13
390 0.14
391 0.12
392 0.1
393 0.1
394 0.11
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.12
401 0.12
402 0.16
403 0.21
404 0.3
405 0.3
406 0.29
407 0.31
408 0.31
409 0.32
410 0.3
411 0.32
412 0.31
413 0.39
414 0.4
415 0.43
416 0.44
417 0.45
418 0.5
419 0.49
420 0.46
421 0.4
422 0.41
423 0.37
424 0.34
425 0.31
426 0.25
427 0.19
428 0.13
429 0.1
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.13
437 0.2
438 0.2
439 0.22
440 0.22
441 0.22
442 0.21
443 0.21
444 0.17
445 0.11
446 0.13
447 0.13
448 0.12
449 0.12