Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PTC5

Protein Details
Accession D8PTC5    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-108EEAVRREEARRPKKKPAERHQILPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-102RREEARRPKKKPAER
125-136KAGKDGEKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
KEGG scm:SCHCO_02482735  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MAALDAIWDDDAELASTSRPGASEDNVGKSSEPLFIYGDESDTDKDTRAPNAAGGGMDDAELEAMFDEGALEMIDARAIQAKAEEAVRREEARRPKKKPAERHQILPSSSPPPEGFDDHDAGGAKAGKDGEKKRRKPIVLDESRLISPIGFPQLIEDTKNFKIKGKGHEATDLNRLLNIYQFWAHRMYPRTQFNDTVERIEKLCHSRRMHNQLGMMRDAAFGKAPKEDAIDLSDSDNDDARERPQNGITLPSSSSPRSSPPARSRASSSRPPSLPPDSSDPGDAVMTDGTRSSAAPDNDEDAELWAAIEEDNNAMLSAKAPAPRRPPTNDFDDDMDDAFAVFDEVHGAGGPPPAPPPPPEFDMDDDFAMMDEIEAEQRAAPQSSSAPAKADDQSAKPAASQNGAAATAPNSSPPKPRTTSDVEDEWNDDDMYADD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.11
8 0.14
9 0.16
10 0.24
11 0.27
12 0.32
13 0.32
14 0.33
15 0.3
16 0.29
17 0.28
18 0.24
19 0.21
20 0.17
21 0.17
22 0.17
23 0.2
24 0.18
25 0.18
26 0.14
27 0.16
28 0.15
29 0.16
30 0.17
31 0.15
32 0.18
33 0.2
34 0.22
35 0.24
36 0.23
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.19
41 0.17
42 0.15
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.05
50 0.04
51 0.04
52 0.03
53 0.03
54 0.04
55 0.03
56 0.04
57 0.04
58 0.03
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.16
71 0.19
72 0.16
73 0.2
74 0.23
75 0.26
76 0.28
77 0.34
78 0.41
79 0.49
80 0.57
81 0.6
82 0.68
83 0.75
84 0.82
85 0.86
86 0.86
87 0.86
88 0.81
89 0.82
90 0.79
91 0.75
92 0.67
93 0.59
94 0.52
95 0.45
96 0.41
97 0.36
98 0.28
99 0.25
100 0.26
101 0.25
102 0.25
103 0.23
104 0.25
105 0.22
106 0.24
107 0.21
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.21
116 0.29
117 0.38
118 0.47
119 0.52
120 0.61
121 0.69
122 0.69
123 0.68
124 0.7
125 0.71
126 0.68
127 0.66
128 0.58
129 0.52
130 0.49
131 0.43
132 0.33
133 0.21
134 0.14
135 0.12
136 0.14
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.14
141 0.15
142 0.16
143 0.15
144 0.17
145 0.2
146 0.25
147 0.24
148 0.24
149 0.31
150 0.35
151 0.42
152 0.46
153 0.46
154 0.43
155 0.49
156 0.47
157 0.43
158 0.43
159 0.37
160 0.27
161 0.24
162 0.23
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.14
171 0.15
172 0.18
173 0.21
174 0.24
175 0.29
176 0.35
177 0.38
178 0.38
179 0.4
180 0.38
181 0.42
182 0.38
183 0.35
184 0.31
185 0.27
186 0.25
187 0.23
188 0.23
189 0.23
190 0.28
191 0.32
192 0.34
193 0.4
194 0.48
195 0.56
196 0.57
197 0.52
198 0.5
199 0.44
200 0.44
201 0.37
202 0.29
203 0.21
204 0.17
205 0.15
206 0.11
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.16
229 0.17
230 0.19
231 0.19
232 0.21
233 0.2
234 0.23
235 0.21
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.17
240 0.15
241 0.17
242 0.14
243 0.16
244 0.2
245 0.23
246 0.3
247 0.35
248 0.43
249 0.43
250 0.44
251 0.48
252 0.5
253 0.54
254 0.54
255 0.5
256 0.5
257 0.49
258 0.49
259 0.49
260 0.46
261 0.42
262 0.36
263 0.38
264 0.33
265 0.33
266 0.31
267 0.26
268 0.21
269 0.19
270 0.16
271 0.09
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.08
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.17
284 0.19
285 0.19
286 0.19
287 0.17
288 0.12
289 0.12
290 0.1
291 0.08
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.07
305 0.1
306 0.14
307 0.18
308 0.24
309 0.31
310 0.38
311 0.43
312 0.49
313 0.52
314 0.51
315 0.56
316 0.53
317 0.48
318 0.44
319 0.41
320 0.34
321 0.29
322 0.25
323 0.17
324 0.13
325 0.11
326 0.08
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.1
340 0.12
341 0.13
342 0.15
343 0.2
344 0.23
345 0.25
346 0.27
347 0.29
348 0.31
349 0.34
350 0.33
351 0.28
352 0.24
353 0.21
354 0.18
355 0.15
356 0.11
357 0.06
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.08
365 0.11
366 0.12
367 0.11
368 0.12
369 0.14
370 0.18
371 0.22
372 0.21
373 0.21
374 0.21
375 0.25
376 0.26
377 0.3
378 0.29
379 0.28
380 0.34
381 0.34
382 0.33
383 0.31
384 0.34
385 0.3
386 0.29
387 0.27
388 0.22
389 0.21
390 0.22
391 0.2
392 0.16
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.18
397 0.2
398 0.23
399 0.32
400 0.34
401 0.42
402 0.43
403 0.46
404 0.47
405 0.52
406 0.56
407 0.53
408 0.55
409 0.5
410 0.48
411 0.48
412 0.42
413 0.36
414 0.28
415 0.22