Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8Q0T4

Protein Details
Accession D8Q0T4    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22HPSSQDQKKSQPAIRRIRRISHydrophilic
108-132REDLGMPKPKPKPTRKPVLRDLSDDBasic
204-229DLTNSPRKRRSPSPSRRPLRHQSTNAHydrophilic
431-452TYVAPKSKPKPIRKAQPPPFSQHydrophilic
775-798EAANARARPRPKPRPVRKEATGSSHydrophilic
941-973KPSSQRSCPPSKPPSQQSKPSSHRQPSSRPASRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-123RGRDGREDLGMPKPKPKPTRK
209-299PRKRRSPSPSRRPLRHQSTNAARSPTRRARVPSPPPPITDRPRTNRFVKPKPTAAPNKRQPEANPKLNPFSKNKPSPPERTRSSQRRSPPP
419-445KERAVDKGKGKATYVAPKSKPKPIRKA
541-557KKSRPAPRPSNPRGRKA
779-792ARARPRPKPRPVRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG scm:SCHCO_02618683  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MHPSSQDQKKSQPAIRRIRRISGMDVEEKDLWENAPRAWERDDRSHALSPPLDLAAISTRPPSEFMNRNPSLTRVSDATSSKLYKMPSRSVIESEKSGLQRGRGRDGREDLGMPKPKPKPTRKPVLRDLSDDSDDELEHPWKADISANRITRTVSPQTPEELDPTYQKKRSSTYKNLSFKKISKSGDTSAAKASTSKAPAEPIDLTNSPRKRRSPSPSRRPLRHQSTNAARSPTRRARVPSPPPPITDRPRTNRFVKPKPTAAPNKRQPEANPKLNPFSKNKPSPPERTRSSQRRSPPPLSKRTSIVIDDEDSSEGVEEVDGPEEDEEASFSRSLRKRASMRLTTPEAAPFPMDLTPKKRPQPQAFPMSDDSPLSSPPKRASDPFPMSPLSSQTKVPSYGDDDSDEDDFPTSDRVKAQKERAVDKGKGKATYVAPKSKPKPIRKAQPPPFSQFVPSAHDDTPRSRNKRFSDDGLSEGERDAKRPRSTSPASSAYEPIGDDDPDLSLGPASRDARELCPYCDELLPSSPTPTLTRMLEEVAKKSRPAPRPSNPRGRKAQLRHFAIVCQRHRFERDVLPDAERKGWPKKIDWSALPSRVRHLRDELQEILEDEVDHGGCVFWKELAKEIKEKGTRAATGVAGQFENFEKVQIGYYGEQGAAIITQTLYSMFPMDLIDPDKVFPLSPSEFLQRVLLPEAGLRLIEEDRARGAADALRTLRESAKYGVAMFPDDSGVGGRQSLGGSGGGGGVADGIVMARAARRRQQIEAEERREEEEEAANARARPRPKPRPVRKEATGSSMMDVEEDGGAGAGAGADNGGSRGGRCSSDMDMESDDDGWLSRQRLPSTAGSTGEMDVDVEQTPKPAKVWEAPEPTRKSGRIPRMRSASVQPKDSPKRVSRSRSTSVQPDGDVIELSSEDTDEENAPRGKRASQRSKPSSHLGKPSSQRSCPPSKPPSQQSKPSSHRQPSSRPASRAASVTSDNSSSFESLPLPPAKPASGLAAARARLAARRQQSEDRQLSAKNSLDWLLSDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.81
3 0.83
4 0.79
5 0.78
6 0.79
7 0.73
8 0.69
9 0.66
10 0.61
11 0.57
12 0.54
13 0.51
14 0.44
15 0.41
16 0.36
17 0.28
18 0.24
19 0.23
20 0.22
21 0.19
22 0.27
23 0.28
24 0.3
25 0.34
26 0.4
27 0.4
28 0.48
29 0.54
30 0.5
31 0.54
32 0.56
33 0.54
34 0.53
35 0.48
36 0.4
37 0.35
38 0.3
39 0.24
40 0.18
41 0.18
42 0.16
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.17
47 0.18
48 0.2
49 0.22
50 0.26
51 0.33
52 0.39
53 0.47
54 0.47
55 0.5
56 0.49
57 0.48
58 0.44
59 0.38
60 0.34
61 0.26
62 0.27
63 0.3
64 0.3
65 0.31
66 0.32
67 0.32
68 0.31
69 0.33
70 0.33
71 0.34
72 0.39
73 0.42
74 0.44
75 0.48
76 0.49
77 0.51
78 0.54
79 0.5
80 0.46
81 0.42
82 0.4
83 0.36
84 0.38
85 0.35
86 0.35
87 0.38
88 0.41
89 0.47
90 0.47
91 0.5
92 0.52
93 0.55
94 0.52
95 0.48
96 0.46
97 0.39
98 0.43
99 0.46
100 0.4
101 0.43
102 0.47
103 0.53
104 0.62
105 0.69
106 0.71
107 0.73
108 0.84
109 0.84
110 0.87
111 0.88
112 0.89
113 0.82
114 0.76
115 0.72
116 0.67
117 0.59
118 0.5
119 0.42
120 0.32
121 0.28
122 0.24
123 0.2
124 0.16
125 0.14
126 0.14
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.18
131 0.19
132 0.24
133 0.32
134 0.35
135 0.36
136 0.37
137 0.37
138 0.35
139 0.38
140 0.39
141 0.34
142 0.34
143 0.35
144 0.38
145 0.39
146 0.36
147 0.32
148 0.28
149 0.26
150 0.29
151 0.33
152 0.38
153 0.39
154 0.41
155 0.42
156 0.46
157 0.54
158 0.58
159 0.62
160 0.64
161 0.7
162 0.77
163 0.79
164 0.8
165 0.77
166 0.73
167 0.71
168 0.68
169 0.61
170 0.58
171 0.57
172 0.53
173 0.56
174 0.52
175 0.45
176 0.41
177 0.39
178 0.32
179 0.28
180 0.27
181 0.23
182 0.24
183 0.24
184 0.21
185 0.23
186 0.24
187 0.27
188 0.26
189 0.22
190 0.25
191 0.24
192 0.27
193 0.33
194 0.39
195 0.41
196 0.46
197 0.5
198 0.51
199 0.6
200 0.67
201 0.69
202 0.74
203 0.79
204 0.83
205 0.87
206 0.87
207 0.87
208 0.87
209 0.85
210 0.84
211 0.78
212 0.76
213 0.77
214 0.77
215 0.72
216 0.66
217 0.58
218 0.52
219 0.57
220 0.56
221 0.51
222 0.49
223 0.51
224 0.53
225 0.62
226 0.68
227 0.68
228 0.68
229 0.66
230 0.63
231 0.65
232 0.65
233 0.62
234 0.62
235 0.62
236 0.61
237 0.66
238 0.68
239 0.68
240 0.69
241 0.71
242 0.71
243 0.71
244 0.7
245 0.7
246 0.69
247 0.72
248 0.74
249 0.73
250 0.74
251 0.74
252 0.75
253 0.7
254 0.68
255 0.63
256 0.63
257 0.64
258 0.62
259 0.59
260 0.55
261 0.6
262 0.62
263 0.62
264 0.57
265 0.57
266 0.58
267 0.6
268 0.62
269 0.64
270 0.67
271 0.72
272 0.73
273 0.72
274 0.66
275 0.66
276 0.71
277 0.71
278 0.72
279 0.69
280 0.71
281 0.73
282 0.76
283 0.77
284 0.77
285 0.76
286 0.78
287 0.77
288 0.71
289 0.63
290 0.58
291 0.53
292 0.44
293 0.37
294 0.3
295 0.25
296 0.23
297 0.21
298 0.18
299 0.15
300 0.13
301 0.1
302 0.08
303 0.06
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.16
320 0.2
321 0.25
322 0.27
323 0.34
324 0.38
325 0.46
326 0.55
327 0.53
328 0.54
329 0.55
330 0.57
331 0.5
332 0.46
333 0.4
334 0.31
335 0.25
336 0.21
337 0.15
338 0.11
339 0.13
340 0.14
341 0.15
342 0.21
343 0.28
344 0.35
345 0.41
346 0.47
347 0.54
348 0.6
349 0.68
350 0.69
351 0.71
352 0.65
353 0.63
354 0.58
355 0.5
356 0.42
357 0.32
358 0.26
359 0.17
360 0.17
361 0.17
362 0.16
363 0.17
364 0.2
365 0.25
366 0.26
367 0.29
368 0.32
369 0.38
370 0.43
371 0.42
372 0.41
373 0.37
374 0.35
375 0.32
376 0.31
377 0.25
378 0.21
379 0.2
380 0.2
381 0.21
382 0.22
383 0.22
384 0.19
385 0.2
386 0.2
387 0.2
388 0.19
389 0.18
390 0.17
391 0.18
392 0.16
393 0.12
394 0.1
395 0.09
396 0.08
397 0.1
398 0.09
399 0.09
400 0.12
401 0.16
402 0.22
403 0.28
404 0.33
405 0.34
406 0.37
407 0.4
408 0.45
409 0.48
410 0.46
411 0.45
412 0.47
413 0.46
414 0.43
415 0.4
416 0.37
417 0.34
418 0.39
419 0.39
420 0.39
421 0.4
422 0.47
423 0.5
424 0.54
425 0.6
426 0.6
427 0.65
428 0.66
429 0.73
430 0.75
431 0.83
432 0.83
433 0.83
434 0.79
435 0.73
436 0.67
437 0.57
438 0.49
439 0.4
440 0.32
441 0.27
442 0.25
443 0.23
444 0.21
445 0.24
446 0.23
447 0.24
448 0.32
449 0.36
450 0.39
451 0.39
452 0.46
453 0.47
454 0.53
455 0.52
456 0.48
457 0.46
458 0.42
459 0.41
460 0.36
461 0.32
462 0.25
463 0.22
464 0.23
465 0.16
466 0.17
467 0.2
468 0.24
469 0.26
470 0.27
471 0.29
472 0.32
473 0.35
474 0.36
475 0.38
476 0.36
477 0.35
478 0.35
479 0.34
480 0.26
481 0.23
482 0.2
483 0.15
484 0.1
485 0.09
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.08
496 0.09
497 0.09
498 0.11
499 0.12
500 0.14
501 0.2
502 0.2
503 0.18
504 0.19
505 0.2
506 0.19
507 0.18
508 0.17
509 0.12
510 0.13
511 0.15
512 0.13
513 0.13
514 0.12
515 0.12
516 0.13
517 0.14
518 0.14
519 0.12
520 0.13
521 0.12
522 0.13
523 0.16
524 0.16
525 0.17
526 0.19
527 0.19
528 0.19
529 0.23
530 0.3
531 0.34
532 0.4
533 0.46
534 0.51
535 0.61
536 0.68
537 0.75
538 0.72
539 0.71
540 0.71
541 0.68
542 0.67
543 0.64
544 0.66
545 0.64
546 0.63
547 0.59
548 0.52
549 0.5
550 0.47
551 0.48
552 0.41
553 0.38
554 0.35
555 0.35
556 0.37
557 0.37
558 0.34
559 0.33
560 0.35
561 0.34
562 0.34
563 0.34
564 0.34
565 0.32
566 0.31
567 0.26
568 0.25
569 0.26
570 0.29
571 0.29
572 0.29
573 0.36
574 0.39
575 0.42
576 0.39
577 0.4
578 0.41
579 0.46
580 0.46
581 0.38
582 0.37
583 0.4
584 0.41
585 0.36
586 0.36
587 0.35
588 0.35
589 0.39
590 0.36
591 0.3
592 0.28
593 0.26
594 0.21
595 0.15
596 0.12
597 0.08
598 0.07
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.04
603 0.04
604 0.05
605 0.05
606 0.06
607 0.07
608 0.08
609 0.13
610 0.18
611 0.2
612 0.23
613 0.25
614 0.31
615 0.33
616 0.33
617 0.32
618 0.31
619 0.29
620 0.27
621 0.27
622 0.19
623 0.19
624 0.19
625 0.16
626 0.12
627 0.12
628 0.11
629 0.1
630 0.12
631 0.09
632 0.09
633 0.08
634 0.08
635 0.09
636 0.09
637 0.11
638 0.09
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.09
643 0.08
644 0.08
645 0.05
646 0.04
647 0.04
648 0.03
649 0.03
650 0.03
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.05
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.07
660 0.09
661 0.1
662 0.09
663 0.1
664 0.1
665 0.1
666 0.1
667 0.09
668 0.12
669 0.13
670 0.14
671 0.16
672 0.19
673 0.19
674 0.2
675 0.21
676 0.17
677 0.17
678 0.17
679 0.15
680 0.11
681 0.11
682 0.11
683 0.1
684 0.09
685 0.07
686 0.07
687 0.07
688 0.1
689 0.1
690 0.09
691 0.1
692 0.1
693 0.11
694 0.09
695 0.1
696 0.09
697 0.1
698 0.12
699 0.13
700 0.13
701 0.14
702 0.15
703 0.16
704 0.16
705 0.18
706 0.16
707 0.18
708 0.18
709 0.18
710 0.18
711 0.16
712 0.16
713 0.14
714 0.12
715 0.1
716 0.09
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.04
732 0.04
733 0.04
734 0.03
735 0.03
736 0.02
737 0.02
738 0.02
739 0.02
740 0.02
741 0.02
742 0.05
743 0.09
744 0.13
745 0.19
746 0.26
747 0.29
748 0.33
749 0.4
750 0.45
751 0.52
752 0.59
753 0.58
754 0.54
755 0.52
756 0.5
757 0.45
758 0.38
759 0.29
760 0.22
761 0.18
762 0.17
763 0.18
764 0.18
765 0.18
766 0.2
767 0.23
768 0.24
769 0.32
770 0.41
771 0.5
772 0.59
773 0.69
774 0.77
775 0.83
776 0.88
777 0.88
778 0.83
779 0.81
780 0.73
781 0.68
782 0.61
783 0.51
784 0.43
785 0.36
786 0.3
787 0.2
788 0.18
789 0.12
790 0.08
791 0.07
792 0.05
793 0.04
794 0.04
795 0.03
796 0.03
797 0.02
798 0.02
799 0.02
800 0.02
801 0.02
802 0.02
803 0.03
804 0.04
805 0.04
806 0.04
807 0.07
808 0.09
809 0.1
810 0.12
811 0.15
812 0.16
813 0.21
814 0.21
815 0.21
816 0.2
817 0.2
818 0.2
819 0.17
820 0.15
821 0.1
822 0.1
823 0.09
824 0.12
825 0.13
826 0.16
827 0.21
828 0.22
829 0.25
830 0.29
831 0.32
832 0.33
833 0.34
834 0.31
835 0.28
836 0.28
837 0.26
838 0.22
839 0.17
840 0.13
841 0.1
842 0.1
843 0.09
844 0.09
845 0.08
846 0.11
847 0.12
848 0.13
849 0.14
850 0.14
851 0.17
852 0.23
853 0.29
854 0.36
855 0.43
856 0.48
857 0.56
858 0.59
859 0.61
860 0.6
861 0.55
862 0.54
863 0.54
864 0.6
865 0.61
866 0.63
867 0.67
868 0.69
869 0.7
870 0.66
871 0.66
872 0.65
873 0.6
874 0.59
875 0.54
876 0.57
877 0.63
878 0.65
879 0.64
880 0.61
881 0.66
882 0.7
883 0.75
884 0.74
885 0.74
886 0.74
887 0.73
888 0.71
889 0.68
890 0.66
891 0.59
892 0.5
893 0.43
894 0.38
895 0.31
896 0.25
897 0.18
898 0.12
899 0.09
900 0.09
901 0.08
902 0.07
903 0.07
904 0.07
905 0.09
906 0.1
907 0.11
908 0.16
909 0.2
910 0.21
911 0.24
912 0.26
913 0.31
914 0.37
915 0.47
916 0.53
917 0.58
918 0.69
919 0.73
920 0.77
921 0.76
922 0.77
923 0.76
924 0.72
925 0.72
926 0.66
927 0.66
928 0.68
929 0.72
930 0.71
931 0.65
932 0.65
933 0.63
934 0.68
935 0.66
936 0.68
937 0.68
938 0.69
939 0.75
940 0.78
941 0.82
942 0.81
943 0.84
944 0.82
945 0.83
946 0.8
947 0.81
948 0.81
949 0.79
950 0.79
951 0.76
952 0.78
953 0.78
954 0.82
955 0.8
956 0.73
957 0.7
958 0.66
959 0.62
960 0.55
961 0.48
962 0.42
963 0.36
964 0.36
965 0.32
966 0.28
967 0.26
968 0.24
969 0.24
970 0.21
971 0.18
972 0.17
973 0.17
974 0.17
975 0.23
976 0.26
977 0.25
978 0.26
979 0.28
980 0.28
981 0.27
982 0.26
983 0.25
984 0.27
985 0.26
986 0.28
987 0.31
988 0.3
989 0.29
990 0.3
991 0.26
992 0.25
993 0.3
994 0.34
995 0.37
996 0.43
997 0.49
998 0.57
999 0.65
1000 0.7
1001 0.69
1002 0.65
1003 0.61
1004 0.57
1005 0.55
1006 0.52
1007 0.46
1008 0.38
1009 0.35
1010 0.32
1011 0.29