Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8QDS2

Protein Details
Accession D8QDS2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-48AQEVRRKKALEEQKRRRAEKVBasic
96-126KSDLPTQFTGKRRKRKGKKSKLQVMHVERQPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-45VRRKKALEEQKRRRA
106-116KRRKRKGKKSK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017336  Snurportin-1  
IPR024721  Snurportin-1_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061015  P:snRNA import into nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF11538  Snurportin1  
CDD cd09232  Snurportin-1_C  
Amino Acid Sequences MSDSPSESNPRKATFKLPPAPVRDKVAAQEVRRKKALEEQKRRRAEKVDSARLQLESFAKLSLEDNDSDEDQGSYKEVRTPLIIKQEMREQDTPTKSDLPTQFTGKRRKRKGKKSKLQVMHVERQPPNPKWADKCMYAELLEMSEDMPWDSDGIPADIETGWVAVAPVPVGKRCLVVTSMPSGTNATVPNTTLRSRLLGKSLIPPFPSPLPHATVLDCILDDHWRDNGILHVLDVLKWKGRDMMECETAFRFWWRDMRLAELPPSVTVSGTIHRFAYPVLFVPIPYHTDTTIPNLLNLVLPLARAARQVEVPPIQHVEVLAAAVRACPYPNGAALASVEPDGLLLYVAEAMYEQGTSPLASWVPIRSYEQPEYPHPASEKAGIVQGRMSGSSGRMARGPNDGPLDVFTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.61
3 0.61
4 0.65
5 0.67
6 0.71
7 0.75
8 0.71
9 0.67
10 0.61
11 0.54
12 0.48
13 0.51
14 0.49
15 0.47
16 0.53
17 0.55
18 0.58
19 0.6
20 0.57
21 0.5
22 0.54
23 0.6
24 0.61
25 0.64
26 0.68
27 0.74
28 0.83
29 0.84
30 0.8
31 0.76
32 0.73
33 0.72
34 0.72
35 0.72
36 0.66
37 0.66
38 0.63
39 0.56
40 0.48
41 0.41
42 0.33
43 0.24
44 0.21
45 0.18
46 0.16
47 0.15
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.15
52 0.16
53 0.19
54 0.19
55 0.19
56 0.18
57 0.15
58 0.13
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.2
67 0.22
68 0.25
69 0.34
70 0.37
71 0.33
72 0.35
73 0.41
74 0.41
75 0.45
76 0.42
77 0.37
78 0.42
79 0.44
80 0.44
81 0.39
82 0.4
83 0.34
84 0.39
85 0.38
86 0.36
87 0.36
88 0.4
89 0.43
90 0.47
91 0.58
92 0.59
93 0.66
94 0.7
95 0.79
96 0.84
97 0.88
98 0.92
99 0.93
100 0.94
101 0.94
102 0.94
103 0.91
104 0.88
105 0.86
106 0.83
107 0.8
108 0.73
109 0.71
110 0.62
111 0.62
112 0.63
113 0.55
114 0.53
115 0.5
116 0.51
117 0.46
118 0.53
119 0.49
120 0.44
121 0.45
122 0.41
123 0.37
124 0.32
125 0.28
126 0.21
127 0.16
128 0.13
129 0.1
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.15
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.14
172 0.13
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.16
183 0.17
184 0.18
185 0.17
186 0.17
187 0.23
188 0.26
189 0.25
190 0.24
191 0.23
192 0.22
193 0.23
194 0.23
195 0.18
196 0.17
197 0.18
198 0.17
199 0.18
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.13
204 0.1
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.15
227 0.16
228 0.18
229 0.21
230 0.25
231 0.27
232 0.27
233 0.28
234 0.25
235 0.24
236 0.21
237 0.18
238 0.15
239 0.11
240 0.17
241 0.18
242 0.22
243 0.22
244 0.27
245 0.29
246 0.29
247 0.3
248 0.25
249 0.23
250 0.19
251 0.2
252 0.14
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.11
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.13
264 0.1
265 0.09
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.13
275 0.15
276 0.16
277 0.2
278 0.23
279 0.21
280 0.19
281 0.18
282 0.18
283 0.17
284 0.16
285 0.12
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.11
293 0.11
294 0.13
295 0.14
296 0.19
297 0.22
298 0.22
299 0.22
300 0.24
301 0.22
302 0.2
303 0.19
304 0.14
305 0.11
306 0.11
307 0.09
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.12
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.05
330 0.05
331 0.03
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.13
350 0.15
351 0.17
352 0.21
353 0.25
354 0.33
355 0.36
356 0.39
357 0.41
358 0.44
359 0.5
360 0.46
361 0.45
362 0.4
363 0.39
364 0.37
365 0.37
366 0.34
367 0.27
368 0.31
369 0.26
370 0.25
371 0.23
372 0.24
373 0.21
374 0.19
375 0.19
376 0.15
377 0.16
378 0.22
379 0.22
380 0.21
381 0.23
382 0.25
383 0.26
384 0.32
385 0.32
386 0.31
387 0.34
388 0.33
389 0.3