Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8QM47

Protein Details
Accession D8QM47    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-279ASSSRAPPPRKPKDKGKKKAKAKTSCVIHGHydrophilic
287-312CKTIIGQKEKVQKKQKERAAEKVKANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-272RAPPPRKPKDKGKKKAKAK
299-305KKQKERA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.666, cyto 5
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MAPKDSKVPTLTDAADWPLWRLRVTDALNRDDLTSVVTGSEKSPPPEIAVTPPTPATSSPPSTSPGAPATTTTSTGSGSSSTTHQVARRETWSWRNARALSTIREHLSNDIALELHEYQHASELWEKLVEKFEQTNTSEMAVTKLIKIFRAKLADGDDGDVSREAMSAHIHRVRQSVTQLATLGYPLNANLVPLILLASLPSSEKWKIVLSAISAGSSKAAPLTLSYVEAKLMAQVTSKEDSDDQQAYAASSSRAPPPRKPKDKGKKKAKAKTSCVIHGEGHSTEECKTIIGQKEKVQKKQKERAAEKVKANKTQTRIQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.24
4 0.24
5 0.24
6 0.24
7 0.23
8 0.22
9 0.21
10 0.27
11 0.31
12 0.35
13 0.36
14 0.39
15 0.4
16 0.4
17 0.37
18 0.3
19 0.25
20 0.2
21 0.15
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.18
28 0.18
29 0.2
30 0.23
31 0.23
32 0.26
33 0.28
34 0.28
35 0.26
36 0.3
37 0.28
38 0.27
39 0.26
40 0.24
41 0.22
42 0.22
43 0.22
44 0.22
45 0.25
46 0.26
47 0.27
48 0.29
49 0.31
50 0.31
51 0.28
52 0.25
53 0.22
54 0.21
55 0.2
56 0.22
57 0.21
58 0.22
59 0.2
60 0.18
61 0.17
62 0.17
63 0.16
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.11
68 0.13
69 0.14
70 0.16
71 0.19
72 0.23
73 0.26
74 0.28
75 0.3
76 0.31
77 0.34
78 0.39
79 0.44
80 0.43
81 0.43
82 0.45
83 0.43
84 0.42
85 0.43
86 0.39
87 0.35
88 0.34
89 0.33
90 0.29
91 0.28
92 0.27
93 0.23
94 0.21
95 0.17
96 0.13
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.1
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.16
116 0.15
117 0.13
118 0.15
119 0.16
120 0.19
121 0.19
122 0.19
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.12
132 0.11
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.18
137 0.2
138 0.2
139 0.19
140 0.22
141 0.21
142 0.19
143 0.19
144 0.15
145 0.12
146 0.12
147 0.1
148 0.07
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.11
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.18
160 0.19
161 0.19
162 0.2
163 0.2
164 0.18
165 0.18
166 0.17
167 0.16
168 0.14
169 0.12
170 0.11
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.05
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.12
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.08
211 0.08
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.13
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.2
230 0.21
231 0.17
232 0.16
233 0.16
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.19
241 0.27
242 0.3
243 0.39
244 0.49
245 0.59
246 0.67
247 0.73
248 0.77
249 0.8
250 0.87
251 0.89
252 0.9
253 0.89
254 0.9
255 0.93
256 0.92
257 0.91
258 0.87
259 0.85
260 0.81
261 0.77
262 0.7
263 0.63
264 0.55
265 0.46
266 0.43
267 0.34
268 0.3
269 0.24
270 0.21
271 0.19
272 0.19
273 0.17
274 0.13
275 0.15
276 0.19
277 0.27
278 0.33
279 0.37
280 0.42
281 0.52
282 0.6
283 0.68
284 0.71
285 0.73
286 0.76
287 0.82
288 0.83
289 0.84
290 0.82
291 0.83
292 0.83
293 0.81
294 0.8
295 0.8
296 0.8
297 0.77
298 0.78
299 0.74
300 0.7