Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PKH5

Protein Details
Accession D8PKH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-260PEPKRRWIPSKWEKKKVMKIVRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-272PKRRWIPSKWEKKKVMKIVRAIREGRIVPNKPK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028598  BOP1/Erb1  
IPR012953  BOP1_N_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0043021  F:ribonucleoprotein complex binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG scm:SCHCO_02623891  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08145  BOP1NT  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MTAVAPSKKRKHAAEPASEAFNDSTALEMLSDEEDAQSVHSDDGEVDNFPEIDAGSDSSDDESYLEGSEDEDEDDEEELTEGTSASDDDEELHIFPKAKTVTSEITGQPKRVYPEIEPDYDSDSSTEDTPNRVGNVPMHWYDDLPHIGYDINGKRVLRPAKGDELDKFLSTVEDPSAWTSAFDKNTQMDRPLTDEELDIIRRLQAGENPDAEYDPYEPTVEWFTGKGKEEVMPLSAAPEPKRRWIPSKWEKKKVMKIVRAIREGRIVPNKPKASNKMEFYNIWASEPSTSQPPLPAPKPRLPTNAESYNPPEEYLPTDAERAEWEAQDPEDRERDFLPQKYSSLRHVPAYDQFMKERFNRQLDLYLAPRIQRVKLNVDPSSLIPKLPSPSSLKPFPNYRSLRLEHSKRARCVAVSPDGAWVVSGDEAGVVSLWEPTVGREVVRWTLDGRIGAVEWCPRTDVSYFVATTEETLHFFIPPHLSAPVLAATQVLLAPSTLPPAPATPSPVKWSSASLSAWTHNKAILTVRLPPTSSLPKQLAWHRRGDYLATVSGTGPQGGVWVHQVTRRHSQAPFKKIRGAVQAVLFHPTKPQFFVATQQYVRLYDLAEQKLLKTLMPGIRWISAMDVHPSGDHLIVGGYDRKLCWFDLELSDKPYKVLRYHTRAIRALAFHPTYPLFASSSDDGSIQVFHARVYNDLMTDPLIVPLKILRGHTVSDGLGVLAVRWVPRQPWLVSAGADGSTAVWCS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.76
3 0.71
4 0.67
5 0.61
6 0.53
7 0.42
8 0.33
9 0.24
10 0.16
11 0.14
12 0.1
13 0.11
14 0.08
15 0.08
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.12
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.08
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.12
46 0.12
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.07
54 0.08
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.19
84 0.19
85 0.2
86 0.21
87 0.25
88 0.27
89 0.27
90 0.33
91 0.29
92 0.38
93 0.39
94 0.39
95 0.37
96 0.37
97 0.39
98 0.37
99 0.37
100 0.3
101 0.37
102 0.4
103 0.4
104 0.38
105 0.35
106 0.36
107 0.33
108 0.3
109 0.21
110 0.17
111 0.16
112 0.16
113 0.18
114 0.15
115 0.17
116 0.18
117 0.2
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.2
122 0.22
123 0.25
124 0.24
125 0.25
126 0.24
127 0.23
128 0.23
129 0.25
130 0.23
131 0.19
132 0.18
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.21
137 0.19
138 0.21
139 0.23
140 0.23
141 0.24
142 0.32
143 0.37
144 0.33
145 0.36
146 0.37
147 0.43
148 0.46
149 0.47
150 0.41
151 0.42
152 0.4
153 0.35
154 0.3
155 0.21
156 0.19
157 0.16
158 0.16
159 0.11
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.16
168 0.18
169 0.18
170 0.19
171 0.22
172 0.27
173 0.28
174 0.29
175 0.25
176 0.24
177 0.28
178 0.27
179 0.25
180 0.21
181 0.2
182 0.18
183 0.19
184 0.18
185 0.14
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.16
193 0.19
194 0.2
195 0.2
196 0.2
197 0.2
198 0.18
199 0.16
200 0.13
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.13
211 0.17
212 0.19
213 0.18
214 0.17
215 0.18
216 0.19
217 0.19
218 0.18
219 0.14
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.16
225 0.23
226 0.24
227 0.3
228 0.37
229 0.39
230 0.43
231 0.47
232 0.55
233 0.58
234 0.68
235 0.71
236 0.74
237 0.79
238 0.81
239 0.84
240 0.84
241 0.83
242 0.78
243 0.77
244 0.76
245 0.75
246 0.72
247 0.64
248 0.56
249 0.51
250 0.46
251 0.43
252 0.42
253 0.39
254 0.39
255 0.46
256 0.48
257 0.47
258 0.52
259 0.53
260 0.52
261 0.54
262 0.52
263 0.47
264 0.47
265 0.43
266 0.41
267 0.4
268 0.32
269 0.27
270 0.23
271 0.19
272 0.17
273 0.18
274 0.15
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.15
280 0.2
281 0.23
282 0.29
283 0.32
284 0.37
285 0.42
286 0.45
287 0.48
288 0.47
289 0.47
290 0.47
291 0.47
292 0.42
293 0.39
294 0.38
295 0.36
296 0.32
297 0.28
298 0.22
299 0.16
300 0.18
301 0.17
302 0.15
303 0.12
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.12
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.12
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.2
322 0.22
323 0.24
324 0.26
325 0.24
326 0.25
327 0.28
328 0.29
329 0.28
330 0.3
331 0.29
332 0.26
333 0.26
334 0.27
335 0.26
336 0.31
337 0.3
338 0.25
339 0.24
340 0.24
341 0.26
342 0.26
343 0.29
344 0.28
345 0.27
346 0.27
347 0.27
348 0.29
349 0.28
350 0.28
351 0.23
352 0.2
353 0.19
354 0.18
355 0.19
356 0.17
357 0.17
358 0.17
359 0.18
360 0.22
361 0.25
362 0.3
363 0.28
364 0.28
365 0.27
366 0.25
367 0.28
368 0.22
369 0.17
370 0.13
371 0.14
372 0.15
373 0.14
374 0.17
375 0.17
376 0.21
377 0.26
378 0.32
379 0.32
380 0.33
381 0.38
382 0.38
383 0.42
384 0.4
385 0.4
386 0.4
387 0.4
388 0.44
389 0.46
390 0.48
391 0.47
392 0.54
393 0.56
394 0.52
395 0.53
396 0.47
397 0.39
398 0.38
399 0.33
400 0.29
401 0.24
402 0.22
403 0.2
404 0.19
405 0.19
406 0.16
407 0.11
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.02
417 0.02
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.04
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.1
428 0.12
429 0.13
430 0.13
431 0.11
432 0.13
433 0.14
434 0.13
435 0.12
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.11
444 0.1
445 0.12
446 0.12
447 0.13
448 0.13
449 0.15
450 0.15
451 0.14
452 0.15
453 0.13
454 0.13
455 0.13
456 0.11
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.1
461 0.11
462 0.12
463 0.12
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.11
470 0.1
471 0.08
472 0.08
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.05
481 0.05
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.11
488 0.11
489 0.17
490 0.18
491 0.2
492 0.24
493 0.26
494 0.27
495 0.25
496 0.26
497 0.22
498 0.23
499 0.22
500 0.2
501 0.2
502 0.22
503 0.24
504 0.23
505 0.22
506 0.19
507 0.19
508 0.18
509 0.18
510 0.19
511 0.18
512 0.23
513 0.26
514 0.26
515 0.26
516 0.26
517 0.29
518 0.33
519 0.32
520 0.31
521 0.3
522 0.31
523 0.35
524 0.43
525 0.48
526 0.43
527 0.49
528 0.45
529 0.46
530 0.45
531 0.41
532 0.35
533 0.28
534 0.27
535 0.2
536 0.18
537 0.16
538 0.17
539 0.16
540 0.13
541 0.1
542 0.08
543 0.09
544 0.08
545 0.09
546 0.08
547 0.1
548 0.11
549 0.14
550 0.19
551 0.23
552 0.31
553 0.34
554 0.36
555 0.38
556 0.48
557 0.53
558 0.59
559 0.63
560 0.59
561 0.62
562 0.6
563 0.61
564 0.58
565 0.53
566 0.46
567 0.42
568 0.43
569 0.37
570 0.38
571 0.34
572 0.26
573 0.28
574 0.27
575 0.24
576 0.23
577 0.24
578 0.23
579 0.23
580 0.3
581 0.31
582 0.35
583 0.34
584 0.34
585 0.34
586 0.32
587 0.32
588 0.25
589 0.19
590 0.19
591 0.26
592 0.24
593 0.25
594 0.25
595 0.24
596 0.29
597 0.28
598 0.22
599 0.16
600 0.22
601 0.24
602 0.24
603 0.27
604 0.24
605 0.25
606 0.25
607 0.24
608 0.19
609 0.17
610 0.18
611 0.18
612 0.17
613 0.16
614 0.15
615 0.16
616 0.16
617 0.13
618 0.11
619 0.08
620 0.07
621 0.07
622 0.09
623 0.12
624 0.12
625 0.13
626 0.13
627 0.16
628 0.17
629 0.18
630 0.19
631 0.18
632 0.2
633 0.26
634 0.31
635 0.31
636 0.35
637 0.37
638 0.34
639 0.32
640 0.33
641 0.31
642 0.28
643 0.37
644 0.41
645 0.47
646 0.55
647 0.6
648 0.64
649 0.63
650 0.63
651 0.58
652 0.51
653 0.45
654 0.45
655 0.41
656 0.33
657 0.33
658 0.3
659 0.26
660 0.25
661 0.24
662 0.17
663 0.15
664 0.19
665 0.18
666 0.19
667 0.18
668 0.17
669 0.16
670 0.15
671 0.15
672 0.12
673 0.13
674 0.11
675 0.11
676 0.15
677 0.15
678 0.16
679 0.2
680 0.21
681 0.18
682 0.18
683 0.19
684 0.16
685 0.17
686 0.16
687 0.15
688 0.16
689 0.15
690 0.15
691 0.16
692 0.2
693 0.21
694 0.22
695 0.22
696 0.23
697 0.25
698 0.26
699 0.27
700 0.23
701 0.21
702 0.19
703 0.15
704 0.14
705 0.12
706 0.1
707 0.09
708 0.1
709 0.1
710 0.12
711 0.14
712 0.15
713 0.21
714 0.27
715 0.27
716 0.29
717 0.32
718 0.32
719 0.3
720 0.3
721 0.25
722 0.19
723 0.18
724 0.14
725 0.11