Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PTA2

Protein Details
Accession D8PTA2    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-276ASSSRAPPPRKPKDKGKKRAKAKASCVHydrophilic
414-433PPPPRPPKTRIPRRSLPPATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-272RAPPPRKPKDKGKKRAKAK
294-313KEKALKKRKERAAEKVKANK
415-454PPPRPPKTRIPRRSLPPATPPAAPAPAAGPSRRPGLRKPE
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MAPKDSKVPTLTDAADWPLWRLRVTDALNRDDLTSVVTGSEKSPPPEIAVTPPTPTTSSPPSTSPGAPATTTTSTGSGSSPTTHQVARRETWSWRNARTLSTIREHLSNDIALELHEYQHASELWEKLVEKFEQTNTSEMAVTELIKIFRAKLANGDDGDVSREAMSAHIHRVRQSVTQLATLGYPLNANLVPLILLASLPSSEKWKIVSSGISAGSSKAAPLTFSYVEAKLMAQVTSKEDSDDEQAYAASSSRAPPPRKPKDKGKKRAKAKASCVIHGEGHSTEECKTIIGQKEKALKKRKERAAEKVKANKVKDSDSDSDSDSDSDVDDTHVTVSRRAYKKISAYWEDFGKYFRLPPKDAPAPDAGSDSEDDDDDDAPAQPPAAGSVGAPRPPTPEPVGDNRPPSPDSDEPPPPPRPPKTRIPRRSLPPATPPAAPAPAAGPSRRPGLRKPEERTANQHKDQGYINARERQENHRKVSAQQRKQREANIRAREQQLEDNRRRREQPPQAEAPPPPPAPAPEPEPAPAPTQGGGDPPGQPDEEGDIWWSVEQRRYSTSRKTEVLRVLRFFSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.25
4 0.25
5 0.25
6 0.25
7 0.24
8 0.24
9 0.22
10 0.28
11 0.32
12 0.37
13 0.38
14 0.41
15 0.42
16 0.42
17 0.39
18 0.32
19 0.27
20 0.22
21 0.17
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.12
27 0.19
28 0.2
29 0.22
30 0.26
31 0.25
32 0.28
33 0.31
34 0.31
35 0.3
36 0.33
37 0.32
38 0.31
39 0.31
40 0.29
41 0.28
42 0.28
43 0.27
44 0.28
45 0.31
46 0.32
47 0.33
48 0.34
49 0.36
50 0.36
51 0.33
52 0.3
53 0.27
54 0.25
55 0.24
56 0.26
57 0.24
58 0.25
59 0.23
60 0.2
61 0.19
62 0.19
63 0.18
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.15
68 0.17
69 0.19
70 0.2
71 0.24
72 0.29
73 0.34
74 0.35
75 0.38
76 0.38
77 0.42
78 0.48
79 0.52
80 0.51
81 0.49
82 0.53
83 0.51
84 0.5
85 0.51
86 0.48
87 0.45
88 0.44
89 0.44
90 0.38
91 0.4
92 0.39
93 0.34
94 0.3
95 0.25
96 0.2
97 0.16
98 0.15
99 0.11
100 0.13
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.18
113 0.19
114 0.18
115 0.22
116 0.2
117 0.19
118 0.21
119 0.23
120 0.26
121 0.27
122 0.27
123 0.23
124 0.24
125 0.22
126 0.19
127 0.17
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.11
136 0.14
137 0.15
138 0.14
139 0.18
140 0.23
141 0.25
142 0.25
143 0.25
144 0.22
145 0.21
146 0.23
147 0.17
148 0.13
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.11
154 0.1
155 0.16
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.25
160 0.26
161 0.26
162 0.27
163 0.26
164 0.23
165 0.24
166 0.22
167 0.2
168 0.18
169 0.16
170 0.14
171 0.09
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.12
193 0.14
194 0.15
195 0.16
196 0.17
197 0.14
198 0.17
199 0.17
200 0.16
201 0.14
202 0.13
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.11
211 0.1
212 0.12
213 0.14
214 0.13
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.1
219 0.11
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.13
225 0.13
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.14
230 0.14
231 0.12
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.08
237 0.06
238 0.05
239 0.07
240 0.13
241 0.2
242 0.23
243 0.3
244 0.41
245 0.51
246 0.6
247 0.64
248 0.7
249 0.74
250 0.82
251 0.86
252 0.86
253 0.85
254 0.85
255 0.89
256 0.87
257 0.84
258 0.8
259 0.78
260 0.69
261 0.61
262 0.54
263 0.46
264 0.37
265 0.29
266 0.24
267 0.15
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.08
275 0.08
276 0.12
277 0.17
278 0.21
279 0.22
280 0.25
281 0.34
282 0.39
283 0.47
284 0.52
285 0.54
286 0.6
287 0.68
288 0.71
289 0.72
290 0.73
291 0.75
292 0.76
293 0.76
294 0.74
295 0.73
296 0.72
297 0.69
298 0.65
299 0.58
300 0.5
301 0.45
302 0.39
303 0.37
304 0.33
305 0.28
306 0.28
307 0.25
308 0.24
309 0.21
310 0.19
311 0.13
312 0.1
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.09
321 0.1
322 0.11
323 0.14
324 0.22
325 0.25
326 0.27
327 0.29
328 0.3
329 0.34
330 0.38
331 0.42
332 0.38
333 0.39
334 0.38
335 0.38
336 0.34
337 0.3
338 0.26
339 0.21
340 0.17
341 0.18
342 0.21
343 0.24
344 0.25
345 0.28
346 0.35
347 0.4
348 0.4
349 0.38
350 0.36
351 0.33
352 0.31
353 0.29
354 0.21
355 0.16
356 0.15
357 0.13
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.11
376 0.13
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.2
381 0.21
382 0.24
383 0.22
384 0.23
385 0.25
386 0.31
387 0.38
388 0.38
389 0.41
390 0.39
391 0.4
392 0.36
393 0.35
394 0.35
395 0.31
396 0.3
397 0.33
398 0.37
399 0.38
400 0.44
401 0.46
402 0.45
403 0.5
404 0.54
405 0.55
406 0.55
407 0.61
408 0.67
409 0.73
410 0.77
411 0.78
412 0.79
413 0.79
414 0.84
415 0.79
416 0.72
417 0.7
418 0.67
419 0.61
420 0.52
421 0.47
422 0.39
423 0.35
424 0.3
425 0.22
426 0.16
427 0.19
428 0.21
429 0.2
430 0.19
431 0.2
432 0.26
433 0.3
434 0.32
435 0.33
436 0.42
437 0.51
438 0.58
439 0.62
440 0.66
441 0.7
442 0.71
443 0.74
444 0.74
445 0.73
446 0.67
447 0.65
448 0.56
449 0.51
450 0.49
451 0.48
452 0.44
453 0.42
454 0.45
455 0.47
456 0.47
457 0.5
458 0.52
459 0.53
460 0.58
461 0.58
462 0.58
463 0.58
464 0.58
465 0.59
466 0.67
467 0.68
468 0.67
469 0.68
470 0.72
471 0.73
472 0.76
473 0.78
474 0.77
475 0.76
476 0.76
477 0.77
478 0.73
479 0.71
480 0.7
481 0.66
482 0.58
483 0.57
484 0.57
485 0.58
486 0.62
487 0.64
488 0.67
489 0.7
490 0.72
491 0.68
492 0.68
493 0.69
494 0.7
495 0.69
496 0.7
497 0.68
498 0.68
499 0.66
500 0.6
501 0.57
502 0.47
503 0.4
504 0.34
505 0.33
506 0.32
507 0.34
508 0.34
509 0.3
510 0.32
511 0.32
512 0.33
513 0.31
514 0.3
515 0.28
516 0.24
517 0.21
518 0.21
519 0.2
520 0.19
521 0.2
522 0.19
523 0.19
524 0.2
525 0.21
526 0.2
527 0.19
528 0.18
529 0.21
530 0.19
531 0.18
532 0.18
533 0.16
534 0.16
535 0.17
536 0.19
537 0.17
538 0.23
539 0.25
540 0.26
541 0.32
542 0.38
543 0.44
544 0.51
545 0.56
546 0.57
547 0.6
548 0.62
549 0.64
550 0.68
551 0.71
552 0.68
553 0.63