Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8QHD1

Protein Details
Accession D8QHD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-27LVSHCTFKLRINRHRKQITSETKKHydrophilic
313-339ATRVINLLPRRAKRRPRRSATGAGVKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-340PRRAKRRPRRSATGAGVKKH
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 5.5, cyto_nucl 4.333, cyto_pero 2.333, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008949  Isoprenoid_synthase_dom_sf  
IPR034686  Terpene_cyclase-like_2  
Gene Ontology GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF19086  Terpene_syn_C_2  
Amino Acid Sequences MPDLVSHCTFKLRINRHRKQITSETKKWLFQGDNLVGKARDKYHGLKAGLLTSMCYPDAAAPQLRVCNDYLTYLFHLDNLSDDMDNFGTTTTADVVLNSLYHPYTYRCPARVGRMTRDYYKRMLPTASAGCQQRFIETFDFFFQSVTQQAIDRASGVIPDLESYVALRRDTSGCKPCWALIEYANNLDIPDAVMDHPVLREMGEAANDLVTWSNDIFSYNVEQSKGDTHNMIPVVMNERGLDLQGAVDFVGELCKQAIDRFNYARSCLPSWSPKIDRDVDVYADGLANWMVGSLHWSFETERYFGKDGHTVKATRVINLLPRRAKRRPRRSATGAGVKKHRSIVTLCSPMPNSRLGVPVISVLSESPGAKDSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.69
3 0.76
4 0.84
5 0.8
6 0.79
7 0.8
8 0.81
9 0.8
10 0.78
11 0.77
12 0.73
13 0.72
14 0.65
15 0.61
16 0.52
17 0.46
18 0.48
19 0.45
20 0.46
21 0.44
22 0.45
23 0.38
24 0.38
25 0.38
26 0.31
27 0.29
28 0.28
29 0.32
30 0.38
31 0.46
32 0.45
33 0.44
34 0.43
35 0.41
36 0.38
37 0.33
38 0.25
39 0.18
40 0.19
41 0.16
42 0.14
43 0.12
44 0.12
45 0.14
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.19
50 0.23
51 0.23
52 0.23
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.2
57 0.18
58 0.17
59 0.19
60 0.19
61 0.18
62 0.16
63 0.16
64 0.14
65 0.14
66 0.13
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.11
91 0.15
92 0.22
93 0.26
94 0.27
95 0.32
96 0.35
97 0.42
98 0.48
99 0.49
100 0.49
101 0.52
102 0.55
103 0.57
104 0.6
105 0.54
106 0.49
107 0.49
108 0.44
109 0.38
110 0.35
111 0.28
112 0.27
113 0.27
114 0.26
115 0.26
116 0.26
117 0.24
118 0.27
119 0.26
120 0.23
121 0.21
122 0.22
123 0.19
124 0.18
125 0.19
126 0.17
127 0.18
128 0.16
129 0.15
130 0.12
131 0.1
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.12
157 0.16
158 0.22
159 0.25
160 0.25
161 0.27
162 0.27
163 0.26
164 0.27
165 0.25
166 0.2
167 0.17
168 0.21
169 0.2
170 0.2
171 0.19
172 0.16
173 0.15
174 0.13
175 0.09
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.16
212 0.17
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.12
220 0.12
221 0.15
222 0.14
223 0.14
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.09
244 0.15
245 0.17
246 0.21
247 0.24
248 0.29
249 0.3
250 0.32
251 0.33
252 0.31
253 0.29
254 0.27
255 0.29
256 0.31
257 0.34
258 0.4
259 0.4
260 0.39
261 0.43
262 0.45
263 0.42
264 0.39
265 0.37
266 0.3
267 0.27
268 0.24
269 0.19
270 0.15
271 0.13
272 0.09
273 0.07
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.1
284 0.11
285 0.15
286 0.18
287 0.16
288 0.17
289 0.21
290 0.23
291 0.23
292 0.25
293 0.28
294 0.27
295 0.31
296 0.34
297 0.3
298 0.3
299 0.38
300 0.35
301 0.3
302 0.3
303 0.27
304 0.31
305 0.38
306 0.45
307 0.44
308 0.51
309 0.58
310 0.66
311 0.75
312 0.77
313 0.81
314 0.84
315 0.85
316 0.87
317 0.87
318 0.87
319 0.85
320 0.85
321 0.79
322 0.75
323 0.74
324 0.68
325 0.63
326 0.59
327 0.51
328 0.44
329 0.41
330 0.42
331 0.43
332 0.47
333 0.44
334 0.43
335 0.45
336 0.44
337 0.43
338 0.38
339 0.31
340 0.26
341 0.29
342 0.25
343 0.23
344 0.21
345 0.21
346 0.18
347 0.17
348 0.15
349 0.11
350 0.12
351 0.14
352 0.13
353 0.12