Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PLH9

Protein Details
Accession D8PLH9    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-243DWRDRRASPPPRRYSPDYRRRRSYSRSPPRGSSPRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-65DAPPSRRSRSRSPARSYARSVRSPVPPKR
212-243RRASPPPRRYSPDYRRRRSYSRSPPRGSSPRR
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12363  RRM_TRA2  
Amino Acid Sequences MSPQYADPAAAAVPDPYSDYSAPPAAPPRDDRDRDRDAPPSRRSRSRSPARSYARSVRSPVPPKRPSHAPIAPNPTQVLGVFGLSIRTEERDLDEEFSRFGTVEKVTIVYDQRSGRSRGFGFIRMSTVEEATRCIQELNGIDLNGRNIRVDYSVTDRPHAPTPGEYMGHRRAPRDSYRDSSYHRDRDRDYYRDRDSYRDYDRDYRRDDWRDRRASPPPRRYSPDYRRRRSYSRSPPRGSSPRRAADYEAPAPAPPADRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.1
4 0.14
5 0.14
6 0.15
7 0.18
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.27
12 0.26
13 0.29
14 0.32
15 0.36
16 0.44
17 0.49
18 0.52
19 0.52
20 0.58
21 0.58
22 0.58
23 0.6
24 0.59
25 0.63
26 0.66
27 0.68
28 0.67
29 0.71
30 0.74
31 0.74
32 0.76
33 0.78
34 0.79
35 0.77
36 0.8
37 0.79
38 0.79
39 0.76
40 0.74
41 0.7
42 0.64
43 0.61
44 0.57
45 0.58
46 0.62
47 0.63
48 0.64
49 0.65
50 0.65
51 0.66
52 0.68
53 0.61
54 0.61
55 0.59
56 0.53
57 0.54
58 0.58
59 0.54
60 0.48
61 0.46
62 0.37
63 0.3
64 0.25
65 0.2
66 0.12
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.07
72 0.08
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.17
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.13
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.14
98 0.15
99 0.17
100 0.19
101 0.22
102 0.21
103 0.24
104 0.23
105 0.23
106 0.24
107 0.25
108 0.24
109 0.22
110 0.22
111 0.18
112 0.19
113 0.15
114 0.14
115 0.1
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.14
131 0.12
132 0.12
133 0.08
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.14
140 0.2
141 0.2
142 0.22
143 0.22
144 0.24
145 0.27
146 0.26
147 0.21
148 0.17
149 0.2
150 0.21
151 0.21
152 0.19
153 0.22
154 0.26
155 0.31
156 0.31
157 0.29
158 0.3
159 0.34
160 0.4
161 0.41
162 0.41
163 0.4
164 0.43
165 0.45
166 0.46
167 0.5
168 0.52
169 0.54
170 0.53
171 0.52
172 0.51
173 0.57
174 0.59
175 0.58
176 0.55
177 0.55
178 0.56
179 0.59
180 0.57
181 0.53
182 0.52
183 0.52
184 0.53
185 0.49
186 0.49
187 0.51
188 0.57
189 0.58
190 0.57
191 0.56
192 0.58
193 0.61
194 0.66
195 0.67
196 0.7
197 0.71
198 0.68
199 0.71
200 0.72
201 0.74
202 0.76
203 0.76
204 0.75
205 0.75
206 0.79
207 0.79
208 0.8
209 0.81
210 0.81
211 0.81
212 0.81
213 0.83
214 0.83
215 0.84
216 0.81
217 0.81
218 0.82
219 0.83
220 0.84
221 0.8
222 0.78
223 0.8
224 0.82
225 0.78
226 0.77
227 0.76
228 0.73
229 0.72
230 0.69
231 0.65
232 0.62
233 0.63
234 0.56
235 0.49
236 0.42
237 0.37
238 0.36
239 0.32