Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8QM52

Protein Details
Accession D8QM52    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23FPPANHVRSKGKKPPPGPCFACHydrophilic
340-367REHPITAFKRIRRHRKKLKEQARLADSLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
348-358KRIRRHRKKLK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG scm:SCHCO_01176987  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MFPPANHVRSKGKKPPPGPCFACGSPNHWNKDCPHWDEYQERNAREAHQAEWDRTSQLAYDTAYVLIVEQGFDGASQPSLVREEESKTQDLRAEEPTRREVFIASTPCFVQRVEEIHEEYWHQGECLPVDSLYDLEYIYAEAEDDAGLADRGVREEVNLAEREIKDTPPTEAFKGEWEEDTNRALVLPKPYDPSVIRLRPRKPLPRQLSRNISVLSVRGRVGARGNATIDLRLDSCASTTFVSGSYYDKLQGPKRIEQGEPMNLLQLTSDHTPIRGTTRLPVTFDCDDGSEIEVETDMYVVDGMTVDILLGEDFQQAYEISVSRSQDGGGQTVVTFGGAREHPITAFKRIRRHRKKLKEQARLADSLVRSEQQVRLPPHSVVKVRVNGPFKADEEWVVENLMLASGEDQITAVPNTILSSDSPFIPVANPSDTPRMIRVGDVLGRAAKASDFFDRPKDSAERDKLARHAAAMAQLCALQSEVSQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.85
3 0.82
4 0.83
5 0.77
6 0.7
7 0.67
8 0.59
9 0.59
10 0.5
11 0.49
12 0.49
13 0.52
14 0.56
15 0.51
16 0.54
17 0.5
18 0.59
19 0.61
20 0.56
21 0.53
22 0.5
23 0.52
24 0.56
25 0.58
26 0.57
27 0.57
28 0.51
29 0.5
30 0.48
31 0.45
32 0.44
33 0.41
34 0.32
35 0.35
36 0.37
37 0.37
38 0.39
39 0.37
40 0.3
41 0.29
42 0.28
43 0.19
44 0.17
45 0.17
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.12
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.13
70 0.17
71 0.23
72 0.28
73 0.3
74 0.29
75 0.3
76 0.32
77 0.32
78 0.31
79 0.32
80 0.34
81 0.35
82 0.38
83 0.44
84 0.42
85 0.41
86 0.38
87 0.31
88 0.28
89 0.3
90 0.31
91 0.25
92 0.25
93 0.25
94 0.25
95 0.26
96 0.22
97 0.18
98 0.15
99 0.18
100 0.21
101 0.24
102 0.25
103 0.25
104 0.26
105 0.25
106 0.23
107 0.21
108 0.16
109 0.13
110 0.11
111 0.12
112 0.11
113 0.13
114 0.12
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.09
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.16
148 0.16
149 0.19
150 0.19
151 0.18
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.2
156 0.22
157 0.2
158 0.2
159 0.2
160 0.2
161 0.23
162 0.21
163 0.17
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.19
168 0.16
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.15
174 0.16
175 0.17
176 0.19
177 0.2
178 0.23
179 0.22
180 0.25
181 0.29
182 0.33
183 0.38
184 0.43
185 0.46
186 0.51
187 0.59
188 0.64
189 0.63
190 0.68
191 0.7
192 0.73
193 0.77
194 0.76
195 0.76
196 0.69
197 0.64
198 0.54
199 0.46
200 0.35
201 0.3
202 0.24
203 0.18
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.15
212 0.16
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.12
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.1
235 0.12
236 0.15
237 0.18
238 0.24
239 0.27
240 0.3
241 0.35
242 0.36
243 0.34
244 0.34
245 0.35
246 0.32
247 0.3
248 0.25
249 0.22
250 0.19
251 0.18
252 0.14
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.11
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.15
265 0.21
266 0.22
267 0.23
268 0.23
269 0.25
270 0.24
271 0.24
272 0.2
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.02
294 0.02
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.06
307 0.08
308 0.11
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.14
314 0.15
315 0.14
316 0.12
317 0.11
318 0.1
319 0.11
320 0.1
321 0.07
322 0.06
323 0.04
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.18
331 0.2
332 0.25
333 0.32
334 0.35
335 0.43
336 0.53
337 0.64
338 0.69
339 0.78
340 0.81
341 0.85
342 0.92
343 0.93
344 0.94
345 0.93
346 0.9
347 0.87
348 0.81
349 0.71
350 0.61
351 0.55
352 0.44
353 0.37
354 0.31
355 0.22
356 0.19
357 0.21
358 0.23
359 0.22
360 0.3
361 0.31
362 0.34
363 0.36
364 0.37
365 0.39
366 0.42
367 0.4
368 0.38
369 0.41
370 0.42
371 0.43
372 0.48
373 0.47
374 0.42
375 0.43
376 0.4
377 0.35
378 0.32
379 0.29
380 0.24
381 0.23
382 0.24
383 0.2
384 0.17
385 0.16
386 0.13
387 0.12
388 0.11
389 0.07
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.08
406 0.12
407 0.13
408 0.13
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.15
413 0.17
414 0.15
415 0.17
416 0.19
417 0.2
418 0.26
419 0.27
420 0.28
421 0.28
422 0.29
423 0.26
424 0.25
425 0.24
426 0.23
427 0.25
428 0.23
429 0.23
430 0.2
431 0.2
432 0.2
433 0.18
434 0.14
435 0.13
436 0.15
437 0.19
438 0.21
439 0.24
440 0.31
441 0.35
442 0.35
443 0.39
444 0.42
445 0.42
446 0.48
447 0.53
448 0.52
449 0.52
450 0.56
451 0.55
452 0.56
453 0.51
454 0.42
455 0.37
456 0.32
457 0.35
458 0.31
459 0.27
460 0.22
461 0.21
462 0.2
463 0.17
464 0.16
465 0.09