FuNGI

D8QM30

Protein Details

Accession

D8QM30

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MEEKRRRKASKLHCMARYND	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 9, cyto 7.5, mito 6, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039900 Pat1-like IPR019167 PAT1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000290 P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA
KEGG	scm:SCHCO_083696 -
Pfam	View protein in Pfam PF09770 PAT1

Amino Acid Sequences

MEEKRRRKASKLHCMARYNDLMTQSDKDFITRIQVSQLVTQDPFNDDFYAQVYAAIVRSRMGLHAQDERVLKFGNVGGVGLGFSQNHRSRRPNAMQRMEQQVERIISNARKREEEKSQHSLHALQGALGKTSGRSYKAAPRQLLQVDSAGSDAHAHISKDDAKDAAAEAAKLGREALGITGESNGIVARKPFTTREVLMRLEHLYDVVMQAERLNNSRVEEGEEGFEEWQAEYDKIRERLANGIELSVPLEACDPPPFISLLGPTKGKRLLPRLTRHLSTETSLAMVALLIAGFDKLDVVRNAPLLDLPPGTPGQAEAEAQTQAFLLSVMQSLLPIVANLELRLVTGMLSVLVTRTDVPAIARSRPGLALFTLLLSRVEVIREQSTSGAVATPADEDWSSFHTIYAHFVELLLPYLPSLFPSMRQQAPAGERMRTDVIDQPVWQFLAALFILAQGEQTTALLAAVRHKVLDEVSMVKKGWVADEEEATTKINNVNLVLHSLGLDATQISVLQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.76
3	0.74
4	0.68
5	0.59
6	0.52
7	0.46
8	0.4
9	0.37
10	0.37
11	0.3
12	0.29
13	0.26
14	0.24
15	0.23
16	0.21
17	0.26
18	0.25
19	0.24
20	0.24
21	0.27
22	0.28
23	0.31
24	0.33
25	0.28
26	0.27
27	0.27
28	0.25
29	0.25
30	0.25
31	0.22
32	0.21
33	0.18
34	0.17
35	0.18
36	0.18
37	0.15
38	0.13
39	0.12
40	0.11
41	0.12
42	0.13
43	0.11
44	0.09
45	0.11
46	0.11
47	0.12
48	0.15
49	0.16
50	0.18
51	0.26
52	0.26
53	0.3
54	0.32
55	0.31
56	0.3
57	0.28
58	0.24
59	0.19
60	0.19
61	0.17
62	0.14
63	0.13
64	0.11
65	0.1
66	0.11
67	0.09
68	0.09
69	0.06
70	0.07
71	0.16
72	0.22
73	0.27
74	0.33
75	0.39
76	0.44
77	0.54
78	0.63
79	0.65
80	0.69
81	0.73
82	0.73
83	0.73
84	0.76
85	0.68
86	0.59
87	0.5
88	0.45
89	0.37
90	0.31
91	0.27
92	0.23
93	0.27
94	0.33
95	0.38
96	0.36
97	0.4
98	0.43
99	0.48
100	0.53
101	0.56
102	0.57
103	0.58
104	0.59
105	0.55
106	0.54
107	0.49
108	0.4
109	0.35
110	0.27
111	0.2
112	0.21
113	0.19
114	0.18
115	0.16
116	0.15
117	0.11
118	0.15
119	0.16
120	0.15
121	0.16
122	0.19
123	0.29
124	0.37
125	0.44
126	0.43
127	0.41
128	0.45
129	0.46
130	0.44
131	0.35
132	0.28
133	0.21
134	0.19
135	0.17
136	0.11
137	0.08
138	0.08
139	0.07
140	0.08
141	0.1
142	0.09
143	0.09
144	0.12
145	0.16
146	0.17
147	0.18
148	0.15
149	0.13
150	0.14
151	0.14
152	0.14
153	0.1
154	0.09
155	0.09
156	0.1
157	0.1
158	0.09
159	0.09
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.06
175	0.07
176	0.08
177	0.11
178	0.12
179	0.15
180	0.19
181	0.2
182	0.25
183	0.27
184	0.28
185	0.26
186	0.26
187	0.24
188	0.2
189	0.19
190	0.13
191	0.1
192	0.08
193	0.08
194	0.07
195	0.06
196	0.05
197	0.06
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.11
203	0.13
204	0.13
205	0.13
206	0.15
207	0.15
208	0.13
209	0.13
210	0.12
211	0.12
212	0.11
213	0.11
214	0.08
215	0.06
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.1
221	0.14
222	0.15
223	0.16
224	0.16
225	0.16
226	0.21
227	0.21
228	0.21
229	0.16
230	0.15
231	0.14
232	0.14
233	0.13
234	0.08
235	0.07
236	0.04
237	0.05
238	0.05
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.09
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.11
249	0.12
250	0.13
251	0.13
252	0.16
253	0.18
254	0.2
255	0.22
256	0.27
257	0.32
258	0.38
259	0.44
260	0.5
261	0.52
262	0.51
263	0.49
264	0.45
265	0.39
266	0.32
267	0.27
268	0.19
269	0.15
270	0.13
271	0.11
272	0.07
273	0.06
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.02
278	0.02
279	0.02
280	0.02
281	0.02
282	0.03
283	0.03
284	0.06
285	0.06
286	0.08
287	0.09
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.1
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.08
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.13
347	0.16
348	0.17
349	0.18
350	0.18
351	0.2
352	0.2
353	0.2
354	0.15
355	0.13
356	0.13
357	0.11
358	0.11
359	0.1
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.11
368	0.12
369	0.13
370	0.13
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.12
375	0.09
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.08
385	0.11
386	0.14
387	0.13
388	0.14
389	0.14
390	0.14
391	0.18
392	0.18
393	0.16
394	0.13
395	0.13
396	0.13
397	0.12
398	0.13
399	0.1
400	0.08
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.08
405	0.11
406	0.1
407	0.12
408	0.19
409	0.26
410	0.27
411	0.29
412	0.29
413	0.31
414	0.34
415	0.39
416	0.35
417	0.31
418	0.29
419	0.32
420	0.33
421	0.27
422	0.26
423	0.25
424	0.27
425	0.27
426	0.27
427	0.25
428	0.25
429	0.25
430	0.22
431	0.16
432	0.11
433	0.13
434	0.12
435	0.11
436	0.08
437	0.09
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.12
451	0.16
452	0.16
453	0.16
454	0.16
455	0.18
456	0.17
457	0.18
458	0.16
459	0.18
460	0.21
461	0.24
462	0.24
463	0.23
464	0.25
465	0.23
466	0.23
467	0.2
468	0.21
469	0.2
470	0.23
471	0.25
472	0.25
473	0.25
474	0.23
475	0.21
476	0.19
477	0.19
478	0.18
479	0.17
480	0.16
481	0.19
482	0.19
483	0.22
484	0.2
485	0.17
486	0.16
487	0.14
488	0.13
489	0.1
490	0.09
491	0.06
492	0.06

D8QM30

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer