Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UP94

Protein Details
Accession Q0UP94    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-28ATDKKLSKKSASDKKSKKSTKASTGDAHydrophilic
114-134EKKPVKTSKASKKAPLKKAPSHydrophilic
404-431LIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGMIDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-19SKKSASDKKSKK
115-131KKPVKTSKASKKAPLKK
410-422KGFTKEKNKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
KEGG pno:SNOG_06420  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MATDKKLSKKSASDKKSKKSTKASTGDAPSTSNAEVPLDSVQAFLEQQGLKDAATKLKEFEKWQKTGASKPQDAPEPMDVDSDSDSSSDSSSDSESASSSDSSSDSSSESEAEEKKPVKTSKASKKAPLKKAPSVSSSSSSSSSSDSSSSESDSDSDSESEAKSAPTPAKAKKAKSVSSSSASSSSDSSSDSSDSSDSDDEPANKPLPESDSDSSSASSDSSSDSDSDSSSESEAEKPTKTKKVKVVKKAASVSSSSASSSSDSSSDSSSSESESEAETKPAVKAKKVAKKAASISSSSSSSDSSDSSSSDSSSDSDDEAAPGSAERKGSSTDSSATLPAASPERTTGGKRKFEGSPTADEPKAKKNHVENRFQRIKADTWVDPKLSSNAYVSYDYADRAHADLIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGMIDTSGGKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.84
3 0.88
4 0.88
5 0.86
6 0.86
7 0.87
8 0.87
9 0.84
10 0.8
11 0.77
12 0.74
13 0.69
14 0.59
15 0.51
16 0.42
17 0.38
18 0.32
19 0.25
20 0.19
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.14
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.09
32 0.14
33 0.13
34 0.13
35 0.16
36 0.17
37 0.15
38 0.2
39 0.22
40 0.22
41 0.25
42 0.26
43 0.25
44 0.31
45 0.35
46 0.37
47 0.45
48 0.48
49 0.47
50 0.5
51 0.54
52 0.51
53 0.55
54 0.58
55 0.57
56 0.53
57 0.54
58 0.56
59 0.56
60 0.55
61 0.51
62 0.45
63 0.38
64 0.34
65 0.31
66 0.26
67 0.2
68 0.2
69 0.16
70 0.12
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.1
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.1
96 0.11
97 0.13
98 0.15
99 0.16
100 0.21
101 0.23
102 0.24
103 0.31
104 0.33
105 0.34
106 0.4
107 0.49
108 0.54
109 0.62
110 0.65
111 0.66
112 0.75
113 0.8
114 0.82
115 0.81
116 0.77
117 0.74
118 0.77
119 0.71
120 0.65
121 0.59
122 0.52
123 0.46
124 0.41
125 0.35
126 0.3
127 0.27
128 0.24
129 0.2
130 0.18
131 0.16
132 0.14
133 0.13
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.11
152 0.12
153 0.16
154 0.21
155 0.24
156 0.33
157 0.39
158 0.4
159 0.45
160 0.51
161 0.5
162 0.5
163 0.52
164 0.46
165 0.45
166 0.44
167 0.37
168 0.33
169 0.29
170 0.24
171 0.19
172 0.16
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.16
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.15
196 0.18
197 0.17
198 0.18
199 0.19
200 0.19
201 0.19
202 0.16
203 0.14
204 0.09
205 0.08
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.15
225 0.19
226 0.28
227 0.3
228 0.35
229 0.42
230 0.51
231 0.59
232 0.66
233 0.72
234 0.68
235 0.72
236 0.69
237 0.62
238 0.53
239 0.46
240 0.38
241 0.28
242 0.23
243 0.16
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.17
269 0.17
270 0.16
271 0.23
272 0.32
273 0.4
274 0.46
275 0.52
276 0.5
277 0.54
278 0.57
279 0.57
280 0.5
281 0.42
282 0.39
283 0.34
284 0.32
285 0.27
286 0.23
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.12
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.1
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.08
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.12
316 0.15
317 0.16
318 0.18
319 0.18
320 0.19
321 0.2
322 0.19
323 0.17
324 0.15
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.13
331 0.15
332 0.17
333 0.22
334 0.29
335 0.35
336 0.41
337 0.42
338 0.45
339 0.46
340 0.48
341 0.52
342 0.47
343 0.45
344 0.44
345 0.47
346 0.45
347 0.45
348 0.44
349 0.45
350 0.47
351 0.43
352 0.45
353 0.5
354 0.58
355 0.63
356 0.71
357 0.69
358 0.73
359 0.79
360 0.72
361 0.66
362 0.6
363 0.54
364 0.5
365 0.48
366 0.42
367 0.39
368 0.43
369 0.4
370 0.37
371 0.37
372 0.34
373 0.3
374 0.27
375 0.22
376 0.21
377 0.23
378 0.24
379 0.22
380 0.2
381 0.2
382 0.2
383 0.19
384 0.17
385 0.15
386 0.15
387 0.15
388 0.13
389 0.13
390 0.15
391 0.17
392 0.21
393 0.19
394 0.19
395 0.22
396 0.24
397 0.31
398 0.32
399 0.39
400 0.46
401 0.56
402 0.67
403 0.75
404 0.82
405 0.84
406 0.9
407 0.91
408 0.91
409 0.91
410 0.89
411 0.87
412 0.85
413 0.79
414 0.69
415 0.59
416 0.52
417 0.42
418 0.35
419 0.28
420 0.21
421 0.17