FuNGI

D8Q0H2

Protein Details

Accession

D8Q0H2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
164-187	KGEKMDEKASKKKRSRWDAPPAEG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
144-150	GAKRKRR
171-179	KASKKKRSR

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_nucl 13.5, nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
KEGG	scm:SCHCO_02618363 -
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSAPNSPRLVDSFTAPKEVLQEFADLAEEEDVDPFAETASKRQIAARQSDYHNRRFNRVAVDSGDAFKEGEDGQAGESGYKDAMRLARLEQEEQRVKRAIEEKERQEREEGKMKMDLDKTPPASELKDVAEDLEPKEAKEASAGAKRKRRWDVPDSDENQDPNKGEKMDEKASKKKRSRWDAPPAEGAAAETPKRSRWDQAPAQQDTPMIPIIMNAPSYMHDDKHNRYLTDEELNAVLPATGYAIVTPPPGYGPSIPPRHLMATPVTEVGGFQIQESSDAAAMAAAAGLAPELPTEIPGVGNLAFFKQEDAQYFAKILKEEDETELSVDEMKERKIMRLLLKIKNGTPPVRKTALRQITDKAREFGAGPLFDKILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHADEYVRNTTARAFSVVASALGIPSLLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIVQQIAIMMGCAVLPHLRNLVDCIAHGLTDEQQKVRTMTALGLAALAEAAAPYGIESFDNVLKPLWLGIRLHRGKGLAAFLKAIGFIIPLMDPEYASYYTKEVTVILIREFQTSDEEMKKIVLKVVKQCAATEGVTPSYIKNDILPDFFRSFWVRRMALDRRNYKQVVETTVELAQKAGVAEIVGRIVNELKDDSEPYRKMVMETITKVVATLGAADIDERLEVRLVDGIIFSFQEQTTEDQVMLDGFGTVVNALGIRVKPYLTQIVSTILWRLNNKSAKVRQQAADLTTRLAVVIKQCGEDQLLSKLGLVLFEQLGEEYPDTLGSIIAAEGAIANVVGMTQMNPPVKDLLPRMTPILRNRHEKVQEASINLIGRIADRGAEFVPAREWMRICFELLDLLKAHKKAIRRAAVNSFGYIAKSLGPQDVLSVLLTNLRVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTCIPAILNEYRTAELNVRTGCLKALSFVFEYVGPQSAFYVDSVVTMLEDALTDRDLVHRQTASTIVKHLALGVAGLGCEDSMMHLMNLVWPNCFETSPHVIGAVMDAIEAMRVTLGPGVLLSYVLQGLFHPARKVREVYWRIYNSLYLGAADALVPFYPDVGELSEGQNVYDRHPLQMFV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.32
3	0.31
4	0.31
5	0.3
6	0.28
7	0.21
8	0.21
9	0.17
10	0.18
11	0.18
12	0.13
13	0.13
14	0.11
15	0.1
16	0.09
17	0.09
18	0.09
19	0.08
20	0.08
21	0.07
22	0.07
23	0.1
24	0.11
25	0.15
26	0.23
27	0.25
28	0.25
29	0.3
30	0.36
31	0.39
32	0.47
33	0.48
34	0.47
35	0.52
36	0.62
37	0.64
38	0.68
39	0.7
40	0.65
41	0.65
42	0.63
43	0.61
44	0.59
45	0.56
46	0.5
47	0.44
48	0.46
49	0.41
50	0.38
51	0.34
52	0.25
53	0.22
54	0.18
55	0.16
56	0.12
57	0.11
58	0.1
59	0.1
60	0.1
61	0.13
62	0.13
63	0.11
64	0.12
65	0.11
66	0.11
67	0.11
68	0.1
69	0.12
70	0.14
71	0.16
72	0.17
73	0.18
74	0.25
75	0.28
76	0.32
77	0.33
78	0.4
79	0.48
80	0.48
81	0.51
82	0.48
83	0.45
84	0.48
85	0.5
86	0.49
87	0.51
88	0.58
89	0.63
90	0.69
91	0.73
92	0.67
93	0.66
94	0.63
95	0.59
96	0.59
97	0.51
98	0.44
99	0.45
100	0.45
101	0.45
102	0.43
103	0.4
104	0.36
105	0.43
106	0.42
107	0.38
108	0.39
109	0.35
110	0.34
111	0.32
112	0.29
113	0.23
114	0.23
115	0.22
116	0.21
117	0.22
118	0.22
119	0.21
120	0.26
121	0.24
122	0.22
123	0.25
124	0.23
125	0.2
126	0.2
127	0.21
128	0.19
129	0.27
130	0.34
131	0.4
132	0.48
133	0.53
134	0.61
135	0.68
136	0.7
137	0.69
138	0.72
139	0.73
140	0.73
141	0.78
142	0.73
143	0.68
144	0.63
145	0.56
146	0.49
147	0.43
148	0.36
149	0.29
150	0.3
151	0.26
152	0.25
153	0.29
154	0.33
155	0.38
156	0.45
157	0.49
158	0.55
159	0.64
160	0.72
161	0.75
162	0.77
163	0.79
164	0.82
165	0.84
166	0.84
167	0.85
168	0.84
169	0.8
170	0.76
171	0.67
172	0.57
173	0.47
174	0.38
175	0.29
176	0.24
177	0.2
178	0.17
179	0.17
180	0.2
181	0.25
182	0.26
183	0.3
184	0.33
185	0.42
186	0.48
187	0.55
188	0.6
189	0.6
190	0.59
191	0.53
192	0.48
193	0.39
194	0.32
195	0.25
196	0.16
197	0.11
198	0.1
199	0.11
200	0.12
201	0.12
202	0.09
203	0.09
204	0.11
205	0.17
206	0.18
207	0.17
208	0.23
209	0.29
210	0.33
211	0.42
212	0.45
213	0.39
214	0.4
215	0.41
216	0.38
217	0.37
218	0.32
219	0.24
220	0.2
221	0.2
222	0.18
223	0.15
224	0.11
225	0.06
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.07
234	0.08
235	0.07
236	0.08
237	0.09
238	0.11
239	0.12
240	0.17
241	0.25
242	0.31
243	0.32
244	0.33
245	0.34
246	0.36
247	0.34
248	0.31
249	0.26
250	0.23
251	0.23
252	0.21
253	0.19
254	0.16
255	0.15
256	0.14
257	0.13
258	0.09
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.11
264	0.1
265	0.08
266	0.08
267	0.07
268	0.06
269	0.06
270	0.04
271	0.04
272	0.03
273	0.02
274	0.02
275	0.02
276	0.02
277	0.02
278	0.02
279	0.03
280	0.03
281	0.04
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.1
295	0.12
296	0.14
297	0.18
298	0.19
299	0.19
300	0.19
301	0.2
302	0.19
303	0.17
304	0.16
305	0.14
306	0.15
307	0.17
308	0.19
309	0.19
310	0.17
311	0.17
312	0.16
313	0.14
314	0.13
315	0.11
316	0.11
317	0.11
318	0.12
319	0.16
320	0.16
321	0.19
322	0.21
323	0.26
324	0.28
325	0.36
326	0.43
327	0.45
328	0.51
329	0.51
330	0.49
331	0.51
332	0.51
333	0.48
334	0.47
335	0.45
336	0.45
337	0.47
338	0.47
339	0.44
340	0.5
341	0.52
342	0.48
343	0.46
344	0.46
345	0.5
346	0.56
347	0.53
348	0.44
349	0.36
350	0.33
351	0.31
352	0.29
353	0.24
354	0.18
355	0.17
356	0.17
357	0.17
358	0.16
359	0.15
360	0.11
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.1
368	0.12
369	0.12
370	0.14
371	0.13
372	0.13
373	0.16
374	0.16
375	0.16
376	0.14
377	0.15
378	0.14
379	0.18
380	0.2
381	0.18
382	0.19
383	0.19
384	0.19
385	0.19
386	0.19
387	0.14
388	0.14
389	0.15
390	0.15
391	0.16
392	0.18
393	0.17
394	0.18
395	0.2
396	0.2
397	0.18
398	0.16
399	0.14
400	0.14
401	0.15
402	0.14
403	0.13
404	0.1
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.06
409	0.05
410	0.04
411	0.05
412	0.05
413	0.06
414	0.06
415	0.05
416	0.06
417	0.06
418	0.08
419	0.1
420	0.12
421	0.12
422	0.14
423	0.15
424	0.15
425	0.15
426	0.13
427	0.11
428	0.08
429	0.08
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.07
439	0.06
440	0.06
441	0.07
442	0.08
443	0.11
444	0.12
445	0.11
446	0.14
447	0.15
448	0.16
449	0.17
450	0.15
451	0.12
452	0.12
453	0.13
454	0.12
455	0.12
456	0.12
457	0.11
458	0.11
459	0.12
460	0.12
461	0.1
462	0.08
463	0.08
464	0.06
465	0.05
466	0.04
467	0.03
468	0.03
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.05
474	0.09
475	0.14
476	0.19
477	0.25
478	0.29
479	0.32
480	0.39
481	0.48
482	0.54
483	0.59
484	0.6
485	0.61
486	0.64
487	0.68
488	0.63
489	0.57
490	0.5
491	0.45
492	0.41
493	0.34
494	0.28
495	0.21
496	0.19
497	0.15
498	0.13
499	0.07
500	0.05
501	0.04
502	0.03
503	0.03
504	0.03
505	0.04
506	0.04
507	0.05
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.09
512	0.1
513	0.09
514	0.09
515	0.11
516	0.09
517	0.09
518	0.09
519	0.08
520	0.09
521	0.13
522	0.14
523	0.12
524	0.13
525	0.15
526	0.15
527	0.15
528	0.13
529	0.09
530	0.09
531	0.1
532	0.09
533	0.08
534	0.07
535	0.07
536	0.06
537	0.05
538	0.04
539	0.02
540	0.02
541	0.02
542	0.02
543	0.02
544	0.02
545	0.02
546	0.02
547	0.03
548	0.03
549	0.04
550	0.06
551	0.06
552	0.07
553	0.07
554	0.06
555	0.07
556	0.07
557	0.06
558	0.07
559	0.07
560	0.1
561	0.2
562	0.21
563	0.22
564	0.22
565	0.22
566	0.2
567	0.21
568	0.22
569	0.13
570	0.13
571	0.12
572	0.11
573	0.11
574	0.1
575	0.09
576	0.06
577	0.04
578	0.03
579	0.04
580	0.03
581	0.04
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.08
587	0.08
588	0.09
589	0.1
590	0.09
591	0.09
592	0.1
593	0.09
594	0.07
595	0.07
596	0.08
597	0.09
598	0.09
599	0.12
600	0.12
601	0.12
602	0.13
603	0.12
604	0.12
605	0.12
606	0.15
607	0.13
608	0.13
609	0.12
610	0.13
611	0.14
612	0.12
613	0.14
614	0.14
615	0.16
616	0.22
617	0.27
618	0.3
619	0.29
620	0.29
621	0.27
622	0.27
623	0.24
624	0.19
625	0.15
626	0.11
627	0.12
628	0.12
629	0.1
630	0.1
631	0.1
632	0.09
633	0.09
634	0.11
635	0.12
636	0.14
637	0.15
638	0.17
639	0.17
640	0.17
641	0.18
642	0.19
643	0.2
644	0.22
645	0.26
646	0.23
647	0.23
648	0.3
649	0.35
650	0.38
651	0.45
652	0.47
653	0.46
654	0.52
655	0.51
656	0.45
657	0.43
658	0.38
659	0.34
660	0.29
661	0.26
662	0.22
663	0.24
664	0.24
665	0.19
666	0.16
667	0.12
668	0.1
669	0.09
670	0.08
671	0.04
672	0.04
673	0.04
674	0.04
675	0.05
676	0.04
677	0.04
678	0.05
679	0.06
680	0.06
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.08
685	0.1
686	0.12
687	0.18
688	0.19
689	0.2
690	0.22
691	0.22
692	0.21
693	0.23
694	0.24
695	0.21
696	0.23
697	0.22
698	0.2
699	0.19
700	0.18
701	0.15
702	0.12
703	0.07
704	0.06
705	0.04
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.05
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.07
728	0.08
729	0.1
730	0.12
731	0.12
732	0.12
733	0.1
734	0.11
735	0.1
736	0.09
737	0.06
738	0.04
739	0.03
740	0.03
741	0.03
742	0.03
743	0.03
744	0.03
745	0.03
746	0.03
747	0.05
748	0.06
749	0.07
750	0.08
751	0.08
752	0.09
753	0.12
754	0.17
755	0.15
756	0.16
757	0.15
758	0.18
759	0.18
760	0.18
761	0.17
762	0.14
763	0.16
764	0.17
765	0.19
766	0.24
767	0.29
768	0.31
769	0.38
770	0.43
771	0.49
772	0.54
773	0.56
774	0.49
775	0.49
776	0.49
777	0.43
778	0.42
779	0.33
780	0.27
781	0.23
782	0.21
783	0.16
784	0.14
785	0.12
786	0.09
787	0.13
788	0.13
789	0.14
790	0.14
791	0.15
792	0.16
793	0.15
794	0.15
795	0.13
796	0.14
797	0.13
798	0.13
799	0.13
800	0.12
801	0.12
802	0.1
803	0.09
804	0.07
805	0.07
806	0.07
807	0.06
808	0.07
809	0.07
810	0.07
811	0.06
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.06
816	0.06
817	0.04
818	0.04
819	0.04
820	0.04
821	0.03
822	0.03
823	0.03
824	0.03
825	0.03
826	0.02
827	0.02
828	0.02
829	0.02
830	0.02
831	0.03
832	0.04
833	0.05
834	0.11
835	0.13
836	0.13
837	0.15
838	0.17
839	0.18
840	0.21
841	0.22
842	0.23
843	0.23
844	0.24
845	0.27
846	0.28
847	0.33
848	0.36
849	0.44
850	0.44
851	0.5
852	0.52
853	0.58
854	0.58
855	0.57
856	0.53
857	0.52
858	0.49
859	0.43
860	0.41
861	0.35
862	0.32
863	0.27
864	0.24
865	0.15
866	0.12
867	0.12
868	0.1
869	0.08
870	0.08
871	0.1
872	0.09
873	0.13
874	0.12
875	0.12
876	0.13
877	0.15
878	0.16
879	0.18
880	0.18
881	0.16
882	0.22
883	0.22
884	0.22
885	0.19
886	0.18
887	0.2
888	0.2
889	0.21
890	0.15
891	0.18
892	0.21
893	0.21
894	0.24
895	0.21
896	0.26
897	0.32
898	0.42
899	0.47
900	0.46
901	0.51
902	0.56
903	0.61
904	0.56
905	0.49
906	0.41
907	0.33
908	0.3
909	0.25
910	0.18
911	0.12
912	0.12
913	0.13
914	0.12
915	0.13
916	0.12
917	0.12
918	0.12
919	0.12
920	0.1
921	0.09
922	0.08
923	0.09
924	0.1
925	0.1
926	0.13
927	0.14
928	0.15
929	0.17
930	0.26
931	0.31
932	0.37
933	0.41
934	0.41
935	0.41
936	0.41
937	0.4
938	0.32
939	0.29
940	0.23
941	0.19
942	0.14
943	0.12
944	0.12
945	0.11
946	0.1
947	0.05
948	0.05
949	0.05
950	0.07
951	0.07
952	0.08
953	0.1
954	0.11
955	0.11
956	0.13
957	0.18
958	0.19
959	0.2
960	0.21
961	0.22
962	0.22
963	0.23
964	0.22
965	0.21
966	0.21
967	0.24
968	0.22
969	0.22
970	0.22
971	0.21
972	0.2
973	0.18
974	0.16
975	0.13
976	0.14
977	0.16
978	0.16
979	0.16
980	0.16
981	0.14
982	0.16
983	0.15
984	0.17
985	0.14
986	0.13
987	0.13
988	0.12
989	0.13
990	0.11
991	0.12
992	0.08
993	0.08
994	0.09
995	0.08
996	0.07
997	0.07
998	0.06
999	0.05
1000	0.05
1001	0.05
1002	0.06
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.11
1007	0.14
1008	0.16
1009	0.2
1010	0.2
1011	0.2
1012	0.21
1013	0.28
1014	0.28
1015	0.26
1016	0.27
1017	0.25
1018	0.25
1019	0.24
1020	0.23
1021	0.17
1022	0.13
1023	0.11
1024	0.09
1025	0.07
1026	0.06
1027	0.06
1028	0.05
1029	0.04
1030	0.04
1031	0.04
1032	0.04
1033	0.06
1034	0.07
1035	0.07
1036	0.08
1037	0.08
1038	0.14
1039	0.2
1040	0.19
1041	0.18
1042	0.18
1043	0.21
1044	0.22
1045	0.22
1046	0.18
1047	0.19
1048	0.26
1049	0.27
1050	0.26
1051	0.24
1052	0.22
1053	0.22
1054	0.22
1055	0.17
1056	0.09
1057	0.07
1058	0.07
1059	0.06
1060	0.07
1061	0.06
1062	0.05
1063	0.04
1064	0.04
1065	0.05
1066	0.06
1067	0.06
1068	0.06
1069	0.06
1070	0.07
1071	0.07
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.08
1076	0.07
1077	0.08
1078	0.07
1079	0.14
1080	0.18
1081	0.21
1082	0.25
1083	0.29
1084	0.35
1085	0.4
1086	0.43
1087	0.4
1088	0.47
1089	0.49
1090	0.5
1091	0.56
1092	0.54
1093	0.51
1094	0.49
1095	0.46
1096	0.37
1097	0.34
1098	0.29
1099	0.19
1100	0.16
1101	0.14
1102	0.12
1103	0.11
1104	0.09
1105	0.07
1106	0.07
1107	0.07
1108	0.06
1109	0.07
1110	0.07
1111	0.07
1112	0.08
1113	0.09
1114	0.11
1115	0.11
1116	0.13
1117	0.17
1118	0.17
1119	0.17
1120	0.21
1121	0.2
1122	0.21
1123	0.29
1124	0.28
1125	0.29

D8Q0H2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer