Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PNW0

Protein Details
Accession D8PNW0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-362AEQQKILERERKRQYKKASKVVRKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-298AARA
301-362VKELKKEEEERKAEESGVEDKKAAKRRAEQERIAKLPAAEQQKILERERKRQYKKASKVVRK
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 8.5, mito 6, nucl 5.5, extr 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG scm:SCHCO_02621304  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MSALNFLAPRPFVHPETWEGVEYKWKFLVFRPGYFKLEGYILAAVVVYLVLFFYGKSANARKANAWFSAHRPLLEANFSKPAAGGLIQDGYSDFFAFSTGRRNVASLHAIFALRPRHDPFQILAQTGYAAFDLQYRPLDDLQLDFLLPASLPVDFVWALVNKDELRGIKKGRWDLTLTRTTENGALPGYVSVMSEFADVTENILKLPAGQALVKVLEDPAIKPYFRSLSITDQPRDRPSSVGEFEDRQKHVILSLVAPPPSSASVDAPLITAVFDLIDQLSRVSLRPETKNKLRAARAEVVKELKKEEEERKAEESGVEDKKAAKRRAEQERIAKLPAAEQQKILERERKRQYKKASKVVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.36
4 0.36
5 0.33
6 0.28
7 0.27
8 0.34
9 0.32
10 0.3
11 0.28
12 0.27
13 0.26
14 0.29
15 0.4
16 0.34
17 0.4
18 0.45
19 0.47
20 0.5
21 0.5
22 0.46
23 0.37
24 0.34
25 0.27
26 0.21
27 0.16
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.08
32 0.06
33 0.06
34 0.03
35 0.03
36 0.03
37 0.03
38 0.03
39 0.03
40 0.05
41 0.06
42 0.07
43 0.13
44 0.18
45 0.26
46 0.31
47 0.33
48 0.35
49 0.41
50 0.43
51 0.42
52 0.41
53 0.36
54 0.36
55 0.44
56 0.42
57 0.35
58 0.33
59 0.31
60 0.29
61 0.33
62 0.29
63 0.23
64 0.27
65 0.26
66 0.25
67 0.23
68 0.2
69 0.15
70 0.14
71 0.12
72 0.08
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.15
86 0.16
87 0.17
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.23
92 0.27
93 0.19
94 0.19
95 0.19
96 0.18
97 0.18
98 0.21
99 0.23
100 0.19
101 0.22
102 0.24
103 0.27
104 0.28
105 0.3
106 0.27
107 0.3
108 0.31
109 0.28
110 0.24
111 0.2
112 0.19
113 0.17
114 0.16
115 0.08
116 0.05
117 0.05
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.1
122 0.1
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.1
152 0.12
153 0.15
154 0.17
155 0.18
156 0.23
157 0.27
158 0.28
159 0.29
160 0.29
161 0.29
162 0.33
163 0.37
164 0.34
165 0.3
166 0.28
167 0.27
168 0.25
169 0.22
170 0.16
171 0.1
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.12
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.17
211 0.16
212 0.17
213 0.19
214 0.17
215 0.23
216 0.3
217 0.36
218 0.35
219 0.37
220 0.39
221 0.4
222 0.42
223 0.35
224 0.3
225 0.27
226 0.31
227 0.3
228 0.29
229 0.27
230 0.25
231 0.29
232 0.34
233 0.32
234 0.27
235 0.26
236 0.23
237 0.22
238 0.22
239 0.18
240 0.13
241 0.18
242 0.2
243 0.19
244 0.19
245 0.18
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.12
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.06
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.1
271 0.15
272 0.2
273 0.28
274 0.37
275 0.45
276 0.53
277 0.6
278 0.63
279 0.67
280 0.66
281 0.64
282 0.63
283 0.63
284 0.6
285 0.55
286 0.54
287 0.52
288 0.51
289 0.46
290 0.42
291 0.36
292 0.35
293 0.39
294 0.42
295 0.46
296 0.46
297 0.49
298 0.5
299 0.48
300 0.44
301 0.38
302 0.34
303 0.32
304 0.31
305 0.28
306 0.25
307 0.29
308 0.36
309 0.45
310 0.47
311 0.46
312 0.52
313 0.61
314 0.71
315 0.74
316 0.75
317 0.76
318 0.79
319 0.75
320 0.68
321 0.61
322 0.5
323 0.45
324 0.44
325 0.41
326 0.33
327 0.31
328 0.33
329 0.39
330 0.44
331 0.46
332 0.47
333 0.46
334 0.55
335 0.64
336 0.71
337 0.71
338 0.76
339 0.81
340 0.84
341 0.88
342 0.89