Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8QID9

Protein Details
Accession D8QID9    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-277ASSSRAPPPRKPKDKGKKKAKAKASCVIHydrophilic
289-313MIIGQKEKVQKKRKERAAEKAKANKHydrophilic
440-460RCERPLPVRRVGCRNCRHPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-272RAPPPRKPKDKGKKKAKAK
295-313EKVQKKRKERAAEKAKANK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MAPKDSKVPTLTDAADWPLWRLRVTDALNRDDLTSVVTGSEKSPPPEIAVTPPTPTTSSPPSTSPGAPATTTTSTGSGSSSTTHQVARRETWSWRNARALSTIREHLSNDIALELHEYQHASELWEKLVEKFEQTNTSEMAVTELIKIFRAKLADADDGDISREAMSAHIHRVRQSVTQLATLGYPLNANLVPLILLASLPSSEKWKIVSSGISAGSSKAAPLTFSYVEAKLMAQVTSKEDLDDEQAYAASSSRAPPPRKPKDKGKKKAKAKASCVIHGEGHSTEECKMIIGQKEKVQKKRKERAAEKAKANKVKDSDSDSDSDSDSDVDDTHVTVSRRAYKKISAYLQLLGQCRARLHPRSMLGSPRRRQHCTCGRELTARPRASSANAENAPATGRGAASGHAPAPPLLPRAHLPSGCAYPASARCRVSCPLARVPTRCERPLPVRRVGCRNCRHPSTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.25
4 0.25
5 0.25
6 0.25
7 0.24
8 0.23
9 0.22
10 0.28
11 0.32
12 0.37
13 0.37
14 0.41
15 0.42
16 0.41
17 0.39
18 0.31
19 0.27
20 0.22
21 0.16
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.12
27 0.19
28 0.2
29 0.22
30 0.25
31 0.25
32 0.28
33 0.3
34 0.3
35 0.29
36 0.32
37 0.31
38 0.3
39 0.3
40 0.29
41 0.27
42 0.27
43 0.27
44 0.27
45 0.3
46 0.31
47 0.32
48 0.33
49 0.36
50 0.35
51 0.33
52 0.29
53 0.26
54 0.24
55 0.23
56 0.25
57 0.23
58 0.24
59 0.22
60 0.19
61 0.18
62 0.18
63 0.17
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.16
70 0.18
71 0.21
72 0.26
73 0.3
74 0.33
75 0.34
76 0.35
77 0.39
78 0.44
79 0.49
80 0.48
81 0.49
82 0.51
83 0.49
84 0.48
85 0.48
86 0.44
87 0.4
88 0.4
89 0.39
90 0.34
91 0.33
92 0.32
93 0.28
94 0.25
95 0.21
96 0.16
97 0.13
98 0.11
99 0.1
100 0.12
101 0.1
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.14
110 0.15
111 0.14
112 0.17
113 0.17
114 0.16
115 0.2
116 0.19
117 0.17
118 0.19
119 0.21
120 0.24
121 0.25
122 0.25
123 0.21
124 0.22
125 0.2
126 0.17
127 0.16
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.11
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.16
141 0.17
142 0.17
143 0.18
144 0.16
145 0.15
146 0.16
147 0.13
148 0.1
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.09
155 0.14
156 0.18
157 0.18
158 0.2
159 0.22
160 0.23
161 0.24
162 0.24
163 0.23
164 0.21
165 0.21
166 0.2
167 0.18
168 0.16
169 0.14
170 0.12
171 0.08
172 0.07
173 0.05
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.11
193 0.12
194 0.13
195 0.14
196 0.14
197 0.12
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.08
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.1
211 0.09
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.12
241 0.2
242 0.23
243 0.3
244 0.41
245 0.51
246 0.6
247 0.65
248 0.7
249 0.74
250 0.83
251 0.86
252 0.87
253 0.86
254 0.87
255 0.9
256 0.88
257 0.86
258 0.81
259 0.79
260 0.72
261 0.65
262 0.58
263 0.51
264 0.42
265 0.33
266 0.29
267 0.2
268 0.18
269 0.14
270 0.13
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.09
276 0.12
277 0.17
278 0.19
279 0.22
280 0.26
281 0.36
282 0.42
283 0.51
284 0.57
285 0.61
286 0.69
287 0.76
288 0.8
289 0.81
290 0.81
291 0.82
292 0.83
293 0.83
294 0.8
295 0.8
296 0.79
297 0.75
298 0.7
299 0.64
300 0.56
301 0.52
302 0.46
303 0.43
304 0.39
305 0.34
306 0.34
307 0.3
308 0.28
309 0.25
310 0.22
311 0.15
312 0.12
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.12
321 0.12
322 0.14
323 0.18
324 0.26
325 0.29
326 0.32
327 0.35
328 0.37
329 0.42
330 0.47
331 0.48
332 0.44
333 0.43
334 0.41
335 0.41
336 0.4
337 0.36
338 0.31
339 0.28
340 0.25
341 0.23
342 0.26
343 0.31
344 0.32
345 0.34
346 0.39
347 0.41
348 0.44
349 0.46
350 0.51
351 0.53
352 0.57
353 0.59
354 0.62
355 0.65
356 0.66
357 0.67
358 0.68
359 0.68
360 0.65
361 0.66
362 0.64
363 0.61
364 0.61
365 0.63
366 0.63
367 0.62
368 0.58
369 0.51
370 0.46
371 0.44
372 0.41
373 0.43
374 0.36
375 0.36
376 0.35
377 0.34
378 0.32
379 0.3
380 0.28
381 0.21
382 0.18
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.16
396 0.18
397 0.16
398 0.18
399 0.2
400 0.27
401 0.33
402 0.31
403 0.31
404 0.33
405 0.35
406 0.33
407 0.31
408 0.24
409 0.24
410 0.31
411 0.34
412 0.35
413 0.34
414 0.36
415 0.4
416 0.43
417 0.45
418 0.44
419 0.45
420 0.49
421 0.56
422 0.6
423 0.59
424 0.64
425 0.66
426 0.67
427 0.64
428 0.59
429 0.58
430 0.62
431 0.69
432 0.68
433 0.68
434 0.68
435 0.72
436 0.78
437 0.79
438 0.79
439 0.79
440 0.81
441 0.81