Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PKP9

Protein Details
Accession D8PKP9    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-184WQEMRCPKTGKIEKRKCAKPEGMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 10.5, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039771  Csl4  
IPR019495  EXOSC1_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG scm:SCHCO_02609798  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10447  EXOSC1  
Amino Acid Sequences MSEIVLPGQPLVLPRGPVPQLGTGVYARGSDVRASLIGVPRHDGPKITISRIRPHPPSPNTVVLGSVIRLTPLQAIIAISVVDGVPLPPGEEFTGVIRTQDVRATEKDKVKIGDCFRGGDVVRGVVISLGDARSYFITTARNDLGVVFATSEAGATMQPVSWQEMRCPKTGKIEKRKCAKPEGMP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.23
3 0.24
4 0.25
5 0.26
6 0.24
7 0.24
8 0.23
9 0.24
10 0.18
11 0.18
12 0.17
13 0.14
14 0.12
15 0.11
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.1
21 0.11
22 0.14
23 0.18
24 0.19
25 0.19
26 0.21
27 0.23
28 0.25
29 0.24
30 0.22
31 0.19
32 0.25
33 0.27
34 0.29
35 0.31
36 0.33
37 0.41
38 0.47
39 0.51
40 0.48
41 0.5
42 0.55
43 0.54
44 0.56
45 0.53
46 0.5
47 0.45
48 0.4
49 0.35
50 0.26
51 0.23
52 0.17
53 0.13
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.04
75 0.03
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.09
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.14
91 0.18
92 0.23
93 0.27
94 0.29
95 0.29
96 0.3
97 0.28
98 0.33
99 0.32
100 0.33
101 0.29
102 0.28
103 0.26
104 0.28
105 0.26
106 0.22
107 0.19
108 0.13
109 0.12
110 0.1
111 0.1
112 0.06
113 0.06
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.12
125 0.13
126 0.18
127 0.17
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.12
133 0.12
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.07
146 0.08
147 0.13
148 0.16
149 0.18
150 0.24
151 0.33
152 0.36
153 0.41
154 0.44
155 0.42
156 0.5
157 0.58
158 0.63
159 0.65
160 0.72
161 0.76
162 0.82
163 0.88
164 0.82
165 0.82