Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0U5G5

Protein Details
Accession Q0U5G5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-322SRSRSYDSRSRSRTRTRSRSYEDGERRRTRSPSDRGRRDSTSRSRTRSRSRRGEHSGDERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
273-316RSRTRTRSRSYEDGERRRTRSPSDRGRRDSTSRSRTRSRSRRGE
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 15.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pno:SNOG_12999  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANSKPRFDRADERALLDDRGYSGALIRGQNPALLFEKGVRERITESYYWKEQCFGLNAATLCDRAADLKFIGGTTGITGKPTPFLCLAFKMLQLVPEKAIVLEYLNFGGDEEEEDEEGGVKKEEEEDGDEKPQDPNAAGKLGQFKYLRCLAAFYIRLAWEPVEIYKTLEPLLTDYRKIKRRLKDAFTLTYVDQFIDDLLTKDRMCATSLWKLPSRANLEDLDMLEPRESPLGDEVDELDEDMKREGSEGSVRSRTRSYDSRSRSRSYDSRSRSRTRTRSRSYEDGERRRTRSPSDRGRRDSTSRSRTRSRSRRGEHSGDER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.5
3 0.44
4 0.35
5 0.29
6 0.2
7 0.2
8 0.17
9 0.12
10 0.11
11 0.14
12 0.18
13 0.18
14 0.18
15 0.21
16 0.21
17 0.23
18 0.21
19 0.21
20 0.2
21 0.19
22 0.18
23 0.18
24 0.26
25 0.26
26 0.31
27 0.28
28 0.27
29 0.29
30 0.33
31 0.34
32 0.28
33 0.31
34 0.33
35 0.39
36 0.4
37 0.37
38 0.35
39 0.31
40 0.33
41 0.32
42 0.26
43 0.21
44 0.22
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.19
49 0.14
50 0.13
51 0.12
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.15
72 0.17
73 0.17
74 0.19
75 0.23
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.19
80 0.21
81 0.22
82 0.21
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.14
87 0.14
88 0.1
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.16
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.15
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.12
128 0.18
129 0.18
130 0.24
131 0.23
132 0.21
133 0.24
134 0.28
135 0.26
136 0.19
137 0.2
138 0.15
139 0.2
140 0.2
141 0.17
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.09
159 0.15
160 0.14
161 0.16
162 0.2
163 0.27
164 0.34
165 0.41
166 0.46
167 0.48
168 0.56
169 0.63
170 0.63
171 0.64
172 0.62
173 0.58
174 0.53
175 0.48
176 0.38
177 0.32
178 0.27
179 0.19
180 0.14
181 0.11
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.16
195 0.22
196 0.25
197 0.29
198 0.3
199 0.32
200 0.32
201 0.38
202 0.4
203 0.33
204 0.32
205 0.29
206 0.28
207 0.27
208 0.26
209 0.21
210 0.15
211 0.14
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.14
236 0.15
237 0.21
238 0.28
239 0.28
240 0.31
241 0.33
242 0.33
243 0.35
244 0.4
245 0.42
246 0.45
247 0.53
248 0.6
249 0.63
250 0.65
251 0.61
252 0.62
253 0.61
254 0.6
255 0.62
256 0.6
257 0.65
258 0.69
259 0.73
260 0.74
261 0.77
262 0.79
263 0.8
264 0.83
265 0.82
266 0.84
267 0.84
268 0.84
269 0.8
270 0.8
271 0.79
272 0.79
273 0.8
274 0.78
275 0.74
276 0.72
277 0.7
278 0.68
279 0.68
280 0.68
281 0.69
282 0.72
283 0.78
284 0.79
285 0.82
286 0.8
287 0.77
288 0.77
289 0.76
290 0.76
291 0.74
292 0.75
293 0.77
294 0.8
295 0.84
296 0.84
297 0.84
298 0.85
299 0.84
300 0.86
301 0.86
302 0.84