Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PV38

Protein Details
Accession D8PV38    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-230DRGYRGGRSRSPRRDRYDDRRARSBasic
253-275YDYPYERRRPDDRDRRRDDKVEDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-235YRGGRSRSPRRDRYDDRRARSPPPRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG scm:SCHCO_02563237  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12339  RRM2_SRSF1_4_like  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSSSATMGRRLYLGKLPPDTAPEDVKKTFGAYGTVVDCRVMTGFGFIEYESSKDAEDAVNEMNGKTFNGNSIAVEFARENRPRREPYERDREYGAPRRRPGGFRVLVTGVSRDTSWQDLKDFGREAGSVTFADIDRDVPGQGVLEYMSRDDADHAVRYLDRRDLRGHPVNVTLDDSRGGADNYRRDSRYDRDDRRDYDRRDYDRRDDRGYRGGRSRSPRRDRYDDRRARSPPPRRDLDDRKPSGYDGYSRYDYDYPYERRRPDDRDRRRDDKVEDRPSRSSGGDRDRDSSRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.38
4 0.37
5 0.39
6 0.39
7 0.35
8 0.35
9 0.33
10 0.35
11 0.34
12 0.34
13 0.31
14 0.29
15 0.28
16 0.22
17 0.2
18 0.16
19 0.18
20 0.19
21 0.2
22 0.18
23 0.17
24 0.15
25 0.14
26 0.13
27 0.1
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.11
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.12
56 0.12
57 0.11
58 0.12
59 0.13
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.2
65 0.26
66 0.29
67 0.34
68 0.42
69 0.45
70 0.51
71 0.58
72 0.57
73 0.6
74 0.67
75 0.63
76 0.58
77 0.57
78 0.55
79 0.53
80 0.56
81 0.56
82 0.52
83 0.51
84 0.53
85 0.54
86 0.52
87 0.48
88 0.48
89 0.42
90 0.34
91 0.36
92 0.32
93 0.3
94 0.28
95 0.25
96 0.15
97 0.12
98 0.12
99 0.09
100 0.09
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.17
106 0.17
107 0.19
108 0.19
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.14
113 0.11
114 0.11
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.15
147 0.16
148 0.17
149 0.21
150 0.24
151 0.31
152 0.37
153 0.37
154 0.32
155 0.34
156 0.32
157 0.29
158 0.29
159 0.21
160 0.14
161 0.14
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.12
168 0.16
169 0.21
170 0.25
171 0.26
172 0.28
173 0.32
174 0.35
175 0.41
176 0.47
177 0.5
178 0.54
179 0.6
180 0.61
181 0.66
182 0.69
183 0.63
184 0.63
185 0.64
186 0.62
187 0.64
188 0.66
189 0.66
190 0.67
191 0.67
192 0.64
193 0.6
194 0.57
195 0.58
196 0.56
197 0.52
198 0.5
199 0.5
200 0.5
201 0.55
202 0.62
203 0.64
204 0.7
205 0.74
206 0.75
207 0.8
208 0.83
209 0.83
210 0.84
211 0.82
212 0.79
213 0.79
214 0.74
215 0.73
216 0.74
217 0.75
218 0.73
219 0.72
220 0.73
221 0.7
222 0.76
223 0.77
224 0.78
225 0.78
226 0.72
227 0.67
228 0.62
229 0.56
230 0.5
231 0.43
232 0.37
233 0.3
234 0.32
235 0.31
236 0.31
237 0.34
238 0.32
239 0.3
240 0.3
241 0.35
242 0.35
243 0.42
244 0.49
245 0.49
246 0.54
247 0.6
248 0.63
249 0.66
250 0.71
251 0.73
252 0.76
253 0.81
254 0.82
255 0.83
256 0.82
257 0.78
258 0.78
259 0.77
260 0.77
261 0.77
262 0.75
263 0.71
264 0.67
265 0.62
266 0.54
267 0.49
268 0.47
269 0.49
270 0.51
271 0.5
272 0.51