Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8QKQ6

Protein Details
Accession D8QKQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-82KNNQQEGKPPPAKKRKGNRNKNRQQQQQHQQHWDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-69GKPPPAKKRKGNRNKN
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG scm:SCHCO_02645482  -  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MALRPDPRAGRPVVQYDDISLPYDDAPTSGPSGTSQAHSSGPQTSPPKNNQQEGKPPPAKKRKGNRNKNRQQQQQHQQHWDDPGAAGSGNGNAGVAGFNSGAPAAPSKGGQGGQQAQRAQKNASVQDHSNAQGGPSTTQNHSAPSQKSVSFPSVAPQEVEEVEESRELTYEEIWDDSALIDAWDAANKEYEAYHGKGKSWKTEGARKSVLWYNIPPEPKSASAVGGGGLAGQAIAQAMAMQERQMNGEVSLDGQQEDGEQEEYDAYGEGNEGDAQATMPPDLGAYHGKGVGQDEAFSRAMNAMYWTGYWTAVYHASRNDQAGPRGTKRDALEMQEVEEELDGRTGDDEEAMEEDGFVSSQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.42
3 0.4
4 0.39
5 0.34
6 0.31
7 0.24
8 0.2
9 0.17
10 0.18
11 0.14
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.14
16 0.13
17 0.13
18 0.12
19 0.16
20 0.17
21 0.18
22 0.17
23 0.18
24 0.19
25 0.2
26 0.21
27 0.22
28 0.22
29 0.27
30 0.32
31 0.36
32 0.43
33 0.48
34 0.57
35 0.59
36 0.65
37 0.65
38 0.66
39 0.7
40 0.69
41 0.73
42 0.7
43 0.7
44 0.73
45 0.77
46 0.79
47 0.78
48 0.82
49 0.83
50 0.86
51 0.91
52 0.91
53 0.92
54 0.94
55 0.94
56 0.94
57 0.93
58 0.91
59 0.91
60 0.91
61 0.9
62 0.87
63 0.84
64 0.77
65 0.7
66 0.64
67 0.54
68 0.44
69 0.33
70 0.26
71 0.18
72 0.15
73 0.11
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.07
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.1
96 0.11
97 0.12
98 0.16
99 0.21
100 0.25
101 0.29
102 0.31
103 0.34
104 0.36
105 0.37
106 0.34
107 0.3
108 0.31
109 0.31
110 0.32
111 0.31
112 0.29
113 0.29
114 0.3
115 0.28
116 0.25
117 0.19
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.15
124 0.14
125 0.19
126 0.19
127 0.19
128 0.21
129 0.26
130 0.25
131 0.26
132 0.28
133 0.24
134 0.25
135 0.26
136 0.26
137 0.21
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.18
142 0.17
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.13
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.1
179 0.12
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.22
184 0.24
185 0.27
186 0.27
187 0.3
188 0.3
189 0.38
190 0.39
191 0.41
192 0.42
193 0.37
194 0.38
195 0.37
196 0.35
197 0.29
198 0.27
199 0.24
200 0.26
201 0.28
202 0.24
203 0.22
204 0.22
205 0.2
206 0.21
207 0.19
208 0.15
209 0.14
210 0.13
211 0.11
212 0.09
213 0.08
214 0.06
215 0.05
216 0.04
217 0.03
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.12
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.05
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.13
276 0.15
277 0.16
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.17
282 0.17
283 0.16
284 0.15
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.09
297 0.11
298 0.17
299 0.18
300 0.19
301 0.21
302 0.25
303 0.27
304 0.29
305 0.33
306 0.32
307 0.35
308 0.4
309 0.44
310 0.45
311 0.49
312 0.48
313 0.48
314 0.45
315 0.5
316 0.46
317 0.44
318 0.46
319 0.4
320 0.41
321 0.36
322 0.34
323 0.26
324 0.22
325 0.17
326 0.1
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.1
341 0.09