FuNGI

D8QE62

Protein Details

Accession

D8QE62

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
187-214	ASSSRAPPPRKPKDKGKKKGKGKATCVI	Basic
351-370	PPPPRPPKTRIPRRSLPPAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
191-209	RAPPPRKPKDKGKKKGKGK
231-250	KEKALKKRKERAAEKAKANK
351-390	PPPPRPPKTRIPRRSLPPATPPPAPAPAAGPSRRPGLRKP

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2

Amino Acid Sequences

MAYSSSCTTTSTGLGSSSTTHQVAQRETWSWRNARALSTIREHLSNDIALELHEYQHASELWEKLVEKFEQTNTSEMAVTELIKIFRAKLADADDGDVSREAMSAHIHRVRQSVTQLATLGYPLNANLVPLILLASLPSSEKWKIVSSGISAGSSKATPLTLSYVEAKLMAQVTSKEDSDDEQAYAASSSRAPPPRKPKDKGKKKGKGKATCVIHGEGHSTEECKTILGQKEKALKKRKERAAEKAKANKVKDSDSDSDSDSDSDVDDTHVTVSRRAYKKISAYWEDFGKYFRLPPKDTPAPGAGSDSEDDDDDDAPAQPPAAGSVGAPRPPTPEPVGDNRPPSPDSDGPPPPPRPPKTRIPRRSLPPATPPPAPAPAAGPSRRPGLRKPEERTANQHKDQGYINDWERQENHRKVSAQQRKQRELSIRVREQQLEDNRRRQEQPPQAEAPPPPPAPAPEPEPAPAPNQGGGDPPDQPDEEGDRYSTSRKTEVLRVLRFFRKTEVLRVLRFFSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.14
3	0.15
4	0.17
5	0.2
6	0.19
7	0.2
8	0.23
9	0.28
10	0.31
11	0.32
12	0.33
13	0.33
14	0.37
15	0.42
16	0.45
17	0.44
18	0.45
19	0.49
20	0.47
21	0.45
22	0.48
23	0.46
24	0.45
25	0.47
26	0.47
27	0.41
28	0.4
29	0.39
30	0.34
31	0.32
32	0.27
33	0.21
34	0.17
35	0.15
36	0.13
37	0.15
38	0.13
39	0.11
40	0.12
41	0.12
42	0.12
43	0.15
44	0.15
45	0.15
46	0.18
47	0.19
48	0.18
49	0.21
50	0.22
51	0.21
52	0.25
53	0.24
54	0.23
55	0.25
56	0.27
57	0.3
58	0.31
59	0.31
60	0.27
61	0.28
62	0.25
63	0.21
64	0.2
65	0.15
66	0.14
67	0.13
68	0.14
69	0.13
70	0.14
71	0.15
72	0.13
73	0.15
74	0.16
75	0.15
76	0.16
77	0.2
78	0.22
79	0.22
80	0.23
81	0.21
82	0.2
83	0.21
84	0.17
85	0.13
86	0.1
87	0.09
88	0.07
89	0.08
90	0.11
91	0.11
92	0.18
93	0.22
94	0.24
95	0.25
96	0.28
97	0.3
98	0.3
99	0.31
100	0.3
101	0.27
102	0.27
103	0.26
104	0.23
105	0.21
106	0.18
107	0.15
108	0.1
109	0.09
110	0.07
111	0.09
112	0.08
113	0.08
114	0.07
115	0.07
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.04
120	0.04
121	0.04
122	0.04
123	0.05
124	0.05
125	0.06
126	0.1
127	0.11
128	0.12
129	0.14
130	0.15
131	0.17
132	0.18
133	0.19
134	0.17
135	0.2
136	0.19
137	0.18
138	0.16
139	0.15
140	0.15
141	0.13
142	0.11
143	0.08
144	0.08
145	0.07
146	0.08
147	0.1
148	0.1
149	0.12
150	0.14
151	0.14
152	0.14
153	0.14
154	0.13
155	0.11
156	0.11
157	0.1
158	0.08
159	0.09
160	0.12
161	0.14
162	0.14
163	0.13
164	0.12
165	0.14
166	0.16
167	0.16
168	0.13
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.11
173	0.09
174	0.07
175	0.06
176	0.08
177	0.14
178	0.22
179	0.25
180	0.33
181	0.43
182	0.54
183	0.62
184	0.67
185	0.72
186	0.76
187	0.84
188	0.87
189	0.87
190	0.87
191	0.87
192	0.9
193	0.89
194	0.87
195	0.82
196	0.79
197	0.72
198	0.65
199	0.58
200	0.51
201	0.41
202	0.32
203	0.28
204	0.2
205	0.17
206	0.14
207	0.12
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.09
212	0.09
213	0.13
214	0.19
215	0.22
216	0.24
217	0.27
218	0.36
219	0.41
220	0.49
221	0.54
222	0.55
223	0.61
224	0.69
225	0.72
226	0.73
227	0.73
228	0.75
229	0.76
230	0.76
231	0.74
232	0.73
233	0.72
234	0.68
235	0.64
236	0.57
237	0.49
238	0.44
239	0.38
240	0.35
241	0.32
242	0.27
243	0.27
244	0.24
245	0.23
246	0.2
247	0.18
248	0.12
249	0.09
250	0.08
251	0.07
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.06
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.13
261	0.21
262	0.23
263	0.25
264	0.27
265	0.28
266	0.32
267	0.35
268	0.39
269	0.35
270	0.36
271	0.35
272	0.35
273	0.32
274	0.28
275	0.24
276	0.19
277	0.15
278	0.16
279	0.2
280	0.23
281	0.25
282	0.29
283	0.36
284	0.4
285	0.4
286	0.39
287	0.36
288	0.32
289	0.29
290	0.27
291	0.19
292	0.15
293	0.14
294	0.12
295	0.1
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.08
300	0.06
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.1
313	0.12
314	0.14
315	0.15
316	0.15
317	0.18
318	0.19
319	0.23
320	0.2
321	0.21
322	0.23
323	0.29
324	0.36
325	0.36
326	0.39
327	0.37
328	0.37
329	0.35
330	0.33
331	0.33
332	0.29
333	0.29
334	0.32
335	0.35
336	0.37
337	0.44
338	0.45
339	0.46
340	0.52
341	0.54
342	0.54
343	0.55
344	0.6
345	0.65
346	0.73
347	0.75
348	0.74
349	0.78
350	0.78
351	0.83
352	0.78
353	0.71
354	0.69
355	0.68
356	0.64
357	0.57
358	0.52
359	0.44
360	0.43
361	0.39
362	0.29
363	0.23
364	0.24
365	0.29
366	0.29
367	0.28
368	0.27
369	0.32
370	0.35
371	0.36
372	0.37
373	0.41
374	0.5
375	0.56
376	0.61
377	0.65
378	0.69
379	0.7
380	0.73
381	0.73
382	0.71
383	0.66
384	0.64
385	0.55
386	0.5
387	0.49
388	0.44
389	0.36
390	0.33
391	0.32
392	0.34
393	0.33
394	0.34
395	0.34
396	0.37
397	0.44
398	0.44
399	0.47
400	0.46
401	0.47
402	0.5
403	0.59
404	0.62
405	0.62
406	0.65
407	0.7
408	0.72
409	0.73
410	0.74
411	0.72
412	0.7
413	0.7
414	0.72
415	0.69
416	0.67
417	0.68
418	0.64
419	0.58
420	0.58
421	0.58
422	0.58
423	0.59
424	0.61
425	0.62
426	0.65
427	0.66
428	0.61
429	0.62
430	0.61
431	0.62
432	0.61
433	0.61
434	0.57
435	0.58
436	0.56
437	0.5
438	0.47
439	0.39
440	0.34
441	0.31
442	0.32
443	0.31
444	0.33
445	0.33
446	0.29
447	0.31
448	0.31
449	0.32
450	0.3
451	0.29
452	0.29
453	0.26
454	0.25
455	0.24
456	0.23
457	0.24
458	0.25
459	0.25
460	0.23
461	0.23
462	0.24
463	0.23
464	0.23
465	0.23
466	0.25
467	0.25
468	0.24
469	0.23
470	0.23
471	0.24
472	0.28
473	0.29
474	0.27
475	0.28
476	0.3
477	0.34
478	0.39
479	0.47
480	0.53
481	0.56
482	0.58
483	0.62
484	0.66
485	0.65
486	0.58
487	0.54
488	0.54
489	0.5
490	0.53
491	0.56
492	0.55
493	0.57
494	0.59

D8QE62

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer