Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8QD28

Protein Details
Accession D8QD28    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
448-468KEARRHVKEFRDQKRREDFKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-307ERKTKGKGKK
441-463ARNRGEAKEARRHVKEFRDQKRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR041661  ZN622/Rei1/Reh1_Znf-C2H2  
IPR040025  Znf622/Rei1/Reh1  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF12756  zf-C2H2_2  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
Amino Acid Sequences MADSPEAHLFTCMSCSIAFTSPDEQRAHYRSDHHRYNMKRRVAGLPPVSAAAFNEKVLERRKETAIMSSPKGSSCEVCGFSKTYTTENAYRSHINSKKHKENELKAAQRALRPTAAADQPAPIQVEDTVPSSEHAADHFTATPSAAPIASTSKPSPDRMDVDSDDEEALEMTIDQKIAAARTRLSPDSNCLFCTHTSSSLSENLMHMSSVHSFFIPDAEYLVDPAGLITYLGEKIAVGNVCIYCSSSSKEFRSLEAVRKHMIDKTHCKIAYSSENDKLEISDFYDFSTSYPDYAIWKERKTKGKGKKADAGAEGDEEWESDDEEMGDVDEVVEVVEDSATESEDSDTASDEDDEDLPAPTISYGDTPYELVLPSGTRIGHRAKTREYKTRQLAVVYKGKGAETHKERVALMRKMIGDKDSCLVPVRGGFGAFGRGTEVVKARNRGEAKEARRHVKEFRDQKRREDFKTKMGYKGNHQKHYRDPLLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.15
4 0.19
5 0.19
6 0.2
7 0.26
8 0.28
9 0.34
10 0.34
11 0.34
12 0.38
13 0.4
14 0.41
15 0.38
16 0.43
17 0.48
18 0.56
19 0.62
20 0.61
21 0.66
22 0.71
23 0.79
24 0.8
25 0.77
26 0.72
27 0.67
28 0.67
29 0.65
30 0.65
31 0.58
32 0.51
33 0.44
34 0.41
35 0.37
36 0.3
37 0.24
38 0.22
39 0.19
40 0.16
41 0.19
42 0.18
43 0.24
44 0.31
45 0.37
46 0.34
47 0.38
48 0.41
49 0.42
50 0.42
51 0.44
52 0.45
53 0.44
54 0.43
55 0.42
56 0.41
57 0.37
58 0.38
59 0.32
60 0.25
61 0.24
62 0.27
63 0.26
64 0.26
65 0.27
66 0.27
67 0.26
68 0.3
69 0.27
70 0.23
71 0.24
72 0.28
73 0.31
74 0.32
75 0.34
76 0.33
77 0.35
78 0.36
79 0.42
80 0.42
81 0.45
82 0.52
83 0.59
84 0.65
85 0.68
86 0.74
87 0.74
88 0.76
89 0.78
90 0.77
91 0.74
92 0.66
93 0.66
94 0.6
95 0.54
96 0.5
97 0.43
98 0.34
99 0.29
100 0.28
101 0.28
102 0.26
103 0.24
104 0.21
105 0.2
106 0.19
107 0.21
108 0.2
109 0.14
110 0.12
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.11
136 0.11
137 0.15
138 0.15
139 0.21
140 0.23
141 0.26
142 0.28
143 0.29
144 0.31
145 0.3
146 0.35
147 0.29
148 0.31
149 0.29
150 0.26
151 0.22
152 0.18
153 0.16
154 0.1
155 0.09
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.14
169 0.18
170 0.19
171 0.21
172 0.2
173 0.23
174 0.27
175 0.26
176 0.24
177 0.22
178 0.22
179 0.2
180 0.24
181 0.21
182 0.18
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.17
189 0.16
190 0.14
191 0.13
192 0.11
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.02
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.04
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.1
233 0.12
234 0.16
235 0.17
236 0.23
237 0.23
238 0.23
239 0.28
240 0.29
241 0.33
242 0.34
243 0.35
244 0.3
245 0.3
246 0.31
247 0.26
248 0.28
249 0.27
250 0.3
251 0.32
252 0.38
253 0.37
254 0.36
255 0.34
256 0.35
257 0.36
258 0.35
259 0.35
260 0.34
261 0.35
262 0.34
263 0.34
264 0.3
265 0.23
266 0.17
267 0.14
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.09
273 0.08
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.13
281 0.21
282 0.21
283 0.24
284 0.32
285 0.39
286 0.48
287 0.53
288 0.61
289 0.64
290 0.7
291 0.75
292 0.73
293 0.74
294 0.69
295 0.66
296 0.58
297 0.5
298 0.4
299 0.33
300 0.26
301 0.19
302 0.15
303 0.1
304 0.09
305 0.07
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.14
365 0.19
366 0.25
367 0.31
368 0.35
369 0.41
370 0.51
371 0.57
372 0.64
373 0.65
374 0.69
375 0.7
376 0.72
377 0.65
378 0.61
379 0.59
380 0.56
381 0.57
382 0.49
383 0.43
384 0.37
385 0.35
386 0.34
387 0.32
388 0.35
389 0.33
390 0.38
391 0.38
392 0.39
393 0.39
394 0.43
395 0.48
396 0.43
397 0.4
398 0.38
399 0.38
400 0.39
401 0.41
402 0.37
403 0.3
404 0.27
405 0.27
406 0.23
407 0.21
408 0.22
409 0.2
410 0.18
411 0.18
412 0.19
413 0.17
414 0.17
415 0.16
416 0.13
417 0.18
418 0.16
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.17
424 0.2
425 0.22
426 0.28
427 0.33
428 0.33
429 0.41
430 0.43
431 0.42
432 0.48
433 0.5
434 0.52
435 0.57
436 0.64
437 0.64
438 0.67
439 0.68
440 0.67
441 0.68
442 0.7
443 0.71
444 0.74
445 0.76
446 0.74
447 0.8
448 0.83
449 0.81
450 0.79
451 0.79
452 0.73
453 0.72
454 0.79
455 0.73
456 0.7
457 0.71
458 0.67
459 0.67
460 0.73
461 0.73
462 0.72
463 0.74
464 0.72
465 0.73
466 0.79