Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PP15

Protein Details
Accession D8PP15    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-247QSPTPGAPPRTKKRKHAPLAPLEDRHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-237PGAPPRTKKRKH
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG scm:SCHCO_02497817  -  
Amino Acid Sequences MDEMLYEDDVADDDGQAAVDPADQDDEEAKEVEERLKREYIQANKMRDGYIDADDDEMPTKISKSAKRMQRMIRQREGNNAYESDDDENPYASSEEEESEEEELLPSQAPLTQPPPGQPPTQPPQAPKLATNGAGPANAPHDSRPGSPVTPTSPSLGGHSIVAMRATSPKFKQTVPSGSGSRAGSPLAGAARGGSPFGGRAGSPVANGQASSNKRKAPEDGQSPTPGAPPRTKKRKHAPLAPLEDRHVIDWLREHDKVTTRECIQHFTPYLKDEGVKAHFTRLVKEVAQLKAGQLVLKAQYREPGSAPPVTPSAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.05
6 0.06
7 0.07
8 0.07
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.11
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.2
20 0.23
21 0.23
22 0.26
23 0.3
24 0.3
25 0.35
26 0.43
27 0.44
28 0.5
29 0.55
30 0.56
31 0.56
32 0.57
33 0.5
34 0.43
35 0.38
36 0.31
37 0.26
38 0.22
39 0.18
40 0.18
41 0.18
42 0.18
43 0.16
44 0.13
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.13
49 0.19
50 0.24
51 0.3
52 0.38
53 0.46
54 0.54
55 0.61
56 0.66
57 0.7
58 0.75
59 0.77
60 0.77
61 0.76
62 0.7
63 0.72
64 0.67
65 0.6
66 0.52
67 0.44
68 0.37
69 0.3
70 0.3
71 0.23
72 0.19
73 0.17
74 0.15
75 0.15
76 0.13
77 0.13
78 0.12
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.09
98 0.11
99 0.14
100 0.15
101 0.17
102 0.22
103 0.23
104 0.24
105 0.24
106 0.29
107 0.31
108 0.37
109 0.38
110 0.34
111 0.37
112 0.41
113 0.4
114 0.34
115 0.32
116 0.27
117 0.26
118 0.24
119 0.21
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.1
124 0.11
125 0.1
126 0.11
127 0.09
128 0.12
129 0.13
130 0.14
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.17
138 0.17
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.16
143 0.16
144 0.13
145 0.1
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.05
151 0.05
152 0.08
153 0.1
154 0.13
155 0.14
156 0.18
157 0.19
158 0.2
159 0.25
160 0.26
161 0.31
162 0.3
163 0.33
164 0.3
165 0.29
166 0.33
167 0.28
168 0.24
169 0.18
170 0.15
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.14
197 0.18
198 0.24
199 0.28
200 0.29
201 0.31
202 0.33
203 0.37
204 0.36
205 0.4
206 0.42
207 0.42
208 0.43
209 0.43
210 0.42
211 0.38
212 0.36
213 0.31
214 0.26
215 0.3
216 0.36
217 0.45
218 0.55
219 0.61
220 0.67
221 0.75
222 0.82
223 0.83
224 0.83
225 0.82
226 0.81
227 0.84
228 0.8
229 0.71
230 0.63
231 0.58
232 0.48
233 0.4
234 0.33
235 0.23
236 0.19
237 0.21
238 0.23
239 0.25
240 0.25
241 0.26
242 0.27
243 0.35
244 0.38
245 0.37
246 0.39
247 0.36
248 0.43
249 0.43
250 0.44
251 0.38
252 0.42
253 0.4
254 0.37
255 0.37
256 0.32
257 0.33
258 0.28
259 0.28
260 0.22
261 0.26
262 0.27
263 0.29
264 0.28
265 0.3
266 0.33
267 0.32
268 0.34
269 0.31
270 0.31
271 0.27
272 0.32
273 0.34
274 0.32
275 0.34
276 0.31
277 0.28
278 0.29
279 0.29
280 0.24
281 0.18
282 0.2
283 0.22
284 0.27
285 0.28
286 0.25
287 0.3
288 0.32
289 0.34
290 0.32
291 0.33
292 0.32
293 0.35
294 0.35
295 0.32