Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8Q8H0

Protein Details
Accession D8Q8H0    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-42PATDKKRKHAAENTSPHKKAKKDEPPKKDKGKARATPADSBasic
299-335ADKVAAKAAKKEKRKKDGESKKEKKRRRETEAAPEAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-36KKRKHAAENTSPHKKAKKDEPPKKDKGKAR
301-350KVAAKAAKKEKRKKDGESKKEKKRRRETEAAPEAAPQPVEGKKKRRKGSA
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG scm:SCHCO_016308  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MAPATDKKRKHAAENTSPHKKAKKDEPPKKDKGKARATPADSEFQVVKASLVISIPPAFTADPSRGALEMLDSMVMRYIPAFQGVVLSHSHLEFLSRAAQIRNECPFLVCKIGFSATVWHPHIGQKLVGKINLSSPDHISLLLHRTFNVSIPRRHIPEGQWEFEYGAAENDPEFGPAAADVEADEDEKPVESDTGGRWVHHLTREPLGGDAKYLSFTVIGLTIANDMLSLIGSIQPDPFDPRHDAAPSRSQEVEDEEEDISAAPLRASPSDDEDAGVAKVDREEEEDAEGLLQKLGREADKVAAKAAKKEKRKKDGESKKEKKRRRETEAAPEAAPQPVEGKKKRRKGSAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.8
3 0.8
4 0.79
5 0.76
6 0.74
7 0.69
8 0.67
9 0.68
10 0.7
11 0.71
12 0.78
13 0.82
14 0.86
15 0.9
16 0.91
17 0.89
18 0.87
19 0.86
20 0.86
21 0.83
22 0.82
23 0.81
24 0.75
25 0.73
26 0.68
27 0.63
28 0.52
29 0.47
30 0.38
31 0.29
32 0.26
33 0.19
34 0.16
35 0.11
36 0.11
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.14
48 0.14
49 0.16
50 0.17
51 0.18
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.13
56 0.11
57 0.09
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.09
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.12
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.18
87 0.2
88 0.24
89 0.26
90 0.24
91 0.23
92 0.23
93 0.24
94 0.22
95 0.24
96 0.19
97 0.16
98 0.15
99 0.16
100 0.15
101 0.14
102 0.17
103 0.14
104 0.2
105 0.21
106 0.2
107 0.2
108 0.23
109 0.25
110 0.22
111 0.22
112 0.19
113 0.23
114 0.24
115 0.24
116 0.22
117 0.2
118 0.22
119 0.25
120 0.24
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.2
125 0.19
126 0.16
127 0.12
128 0.15
129 0.16
130 0.15
131 0.13
132 0.15
133 0.15
134 0.18
135 0.25
136 0.25
137 0.25
138 0.3
139 0.34
140 0.34
141 0.36
142 0.36
143 0.29
144 0.36
145 0.38
146 0.34
147 0.31
148 0.29
149 0.27
150 0.24
151 0.23
152 0.12
153 0.08
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.06
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.18
187 0.2
188 0.23
189 0.18
190 0.2
191 0.21
192 0.2
193 0.2
194 0.19
195 0.16
196 0.13
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.18
228 0.19
229 0.21
230 0.23
231 0.25
232 0.25
233 0.32
234 0.31
235 0.31
236 0.3
237 0.27
238 0.26
239 0.28
240 0.28
241 0.2
242 0.2
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.1
248 0.08
249 0.07
250 0.05
251 0.06
252 0.08
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.16
257 0.18
258 0.18
259 0.17
260 0.16
261 0.16
262 0.14
263 0.14
264 0.09
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.11
270 0.13
271 0.13
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.08
281 0.1
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.2
287 0.24
288 0.24
289 0.26
290 0.29
291 0.29
292 0.36
293 0.45
294 0.47
295 0.53
296 0.63
297 0.7
298 0.76
299 0.83
300 0.85
301 0.86
302 0.89
303 0.89
304 0.9
305 0.9
306 0.91
307 0.93
308 0.92
309 0.91
310 0.91
311 0.91
312 0.89
313 0.89
314 0.86
315 0.87
316 0.88
317 0.8
318 0.69
319 0.61
320 0.53
321 0.44
322 0.36
323 0.25
324 0.2
325 0.23
326 0.32
327 0.38
328 0.48
329 0.56
330 0.66
331 0.74