Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

D8QC45

Protein Details
Accession D8QC45    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-48EMGLRSKKGKGKAADKKRDKGKAKEKAETLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-44RSKKGKGKAADKKRDKGKAKEK
Subcellular Location(s) nucl 10, cysk 8, cyto 5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007198  Ssl1-like  
IPR012170  TFIIH_SSL1/p44  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG scm:SCHCO_02511582  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04056  Ssl1  
CDD cd01453  vWA_transcription_factor_IIH_type  
Amino Acid Sequences MPDEDDFMMAIDSDSDMEEMGLRSKKGKGKAADKKRDKGKAKEKAETLAYTWEASYTRSWDTVQEDESGSLQGAVEDWVVRARRKRLQAPSTAIRRTIIRHLVLLLDLSSAMLDRDMRPTRFDLMLQYAREFVVEWFDQNPLGQIGVVGMRSGIGERICEMTGNPQDVLKSISERHRLEPQGEPSLQNAIEMARSSMSHLPTHSSREILLIFGSLTTCDPGDIHDTLDTCVRQKIRVSVVALAAEMKICREFCDKTGGQFGVALNEGHFRDILFELVPPPAQRALGGAGMGAPGKATAASGPSADLMMMGFPTRLPDTTPPSLCACHGELRSAGFLCPRCQSKVCDVPTDCDVCGLMIVSSPHLARSYHHLFPVRPYAAIQAAEGFPSKKTTLVRSNANI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.06
4 0.06
5 0.08
6 0.08
7 0.14
8 0.16
9 0.17
10 0.2
11 0.27
12 0.33
13 0.4
14 0.47
15 0.5
16 0.58
17 0.69
18 0.77
19 0.81
20 0.84
21 0.85
22 0.87
23 0.88
24 0.86
25 0.86
26 0.85
27 0.85
28 0.83
29 0.82
30 0.75
31 0.71
32 0.66
33 0.57
34 0.48
35 0.43
36 0.36
37 0.29
38 0.26
39 0.22
40 0.18
41 0.18
42 0.18
43 0.16
44 0.17
45 0.18
46 0.18
47 0.2
48 0.24
49 0.25
50 0.25
51 0.24
52 0.22
53 0.22
54 0.22
55 0.18
56 0.14
57 0.11
58 0.09
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.11
66 0.14
67 0.18
68 0.24
69 0.3
70 0.37
71 0.45
72 0.54
73 0.6
74 0.65
75 0.69
76 0.7
77 0.72
78 0.73
79 0.67
80 0.59
81 0.5
82 0.45
83 0.4
84 0.4
85 0.37
86 0.3
87 0.28
88 0.28
89 0.27
90 0.25
91 0.22
92 0.14
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.04
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.15
103 0.2
104 0.21
105 0.23
106 0.25
107 0.28
108 0.28
109 0.28
110 0.23
111 0.25
112 0.29
113 0.27
114 0.26
115 0.23
116 0.22
117 0.21
118 0.19
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.14
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.15
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.11
157 0.11
158 0.13
159 0.19
160 0.26
161 0.28
162 0.3
163 0.35
164 0.36
165 0.37
166 0.39
167 0.36
168 0.34
169 0.33
170 0.31
171 0.25
172 0.26
173 0.23
174 0.18
175 0.14
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.05
181 0.05
182 0.08
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.15
188 0.16
189 0.21
190 0.19
191 0.16
192 0.15
193 0.16
194 0.16
195 0.13
196 0.11
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.14
215 0.13
216 0.11
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.16
221 0.2
222 0.21
223 0.25
224 0.25
225 0.24
226 0.25
227 0.23
228 0.21
229 0.17
230 0.13
231 0.1
232 0.08
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.24
241 0.23
242 0.23
243 0.29
244 0.27
245 0.23
246 0.24
247 0.22
248 0.16
249 0.16
250 0.14
251 0.09
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.09
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.07
300 0.09
301 0.09
302 0.12
303 0.17
304 0.24
305 0.31
306 0.32
307 0.32
308 0.34
309 0.34
310 0.32
311 0.31
312 0.26
313 0.26
314 0.25
315 0.25
316 0.23
317 0.24
318 0.26
319 0.23
320 0.21
321 0.2
322 0.22
323 0.22
324 0.27
325 0.29
326 0.31
327 0.34
328 0.38
329 0.42
330 0.49
331 0.49
332 0.53
333 0.51
334 0.5
335 0.52
336 0.49
337 0.4
338 0.31
339 0.28
340 0.19
341 0.17
342 0.14
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.12
348 0.12
349 0.13
350 0.14
351 0.15
352 0.14
353 0.22
354 0.27
355 0.29
356 0.35
357 0.38
358 0.38
359 0.44
360 0.52
361 0.44
362 0.39
363 0.36
364 0.35
365 0.34
366 0.33
367 0.27
368 0.21
369 0.2
370 0.21
371 0.22
372 0.19
373 0.16
374 0.2
375 0.2
376 0.21
377 0.24
378 0.31
379 0.38
380 0.44