FuNGI

D8Q7T9

Protein Details

Accession

D8Q7T9

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-39	ASETPATSPHKRTRPPRDKKDRDRDGQRERRDAD	Basic
72-95	QEKADRDREKLERKKERAKAAQAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-36	HKRTRPPRDKKDRDRDGQRERR
67-102	KRDRAQEKADRDREKLERKKERAKAAQAAAEKQKLK
276-327	IKKDKKEKGRAPPPPPPPGSDAKKKKAPPPKAPAAATATQEAKAARRAHKAK
384-385	RK
409-419	PRSKREPTEGK

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	scm:SCHCO_02506351 -
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSDKPASETPATSPHKRTRPPRDKKDRDRDGQRERRDADRDRTQDKSDRAQEKSDRDQEKSDRDQDKRDRAQEKADRDREKLERKKERAKAAQAAAEKQKLKIVVRRLPPNLPESIFWESVQAWVSEETVSWRTYWPGKMRSRPDKENVPSRAYIVFKTDEQVAIFGKEYDGHLFRDKAGNEFQAVVEFAPYQKVPSEKKKVDVRAGTIEKDEDYISFLESLNAPTSSEPVTMESLRAHIAATRPPSPPKTTPLLEYLKFEKENNATRHRDVTGIIKKDKKEKGRAPPPPPPPGSDAKKKKAPPPKAPAAATATQEAKAARRAHKAKPSTSVNTSVPPSAGASSAAPQSSAGPSSSTVSPSDANAPLPTGSTKPPPAGPGAAARKARPALGMSRGFEAALSGAMGGGGPRSKREPTEGKSAAAPKADAAPKEGPPPADAPKVPGLISASALAGVSEAPKFGDSAFNLANVRSACPIRHPRYATRVQGMLLATPIGRTPYRAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.61
3	0.69
4	0.76
5	0.77
6	0.82
7	0.87
8	0.9
9	0.92
10	0.93
11	0.96
12	0.96
13	0.95
14	0.94
15	0.94
16	0.93
17	0.93
18	0.92
19	0.89
20	0.87
21	0.8
22	0.78
23	0.75
24	0.73
25	0.71
26	0.71
27	0.69
28	0.65
29	0.67
30	0.64
31	0.64
32	0.61
33	0.62
34	0.61
35	0.62
36	0.6
37	0.64
38	0.65
39	0.65
40	0.69
41	0.69
42	0.64
43	0.6
44	0.64
45	0.63
46	0.65
47	0.65
48	0.64
49	0.64
50	0.63
51	0.69
52	0.71
53	0.75
54	0.74
55	0.75
56	0.71
57	0.65
58	0.71
59	0.69
60	0.69
61	0.69
62	0.7
63	0.66
64	0.64
65	0.68
66	0.67
67	0.7
68	0.7
69	0.7
70	0.71
71	0.75
72	0.82
73	0.82
74	0.84
75	0.82
76	0.81
77	0.79
78	0.72
79	0.7
80	0.63
81	0.61
82	0.57
83	0.54
84	0.47
85	0.4
86	0.38
87	0.36
88	0.38
89	0.38
90	0.41
91	0.42
92	0.49
93	0.57
94	0.58
95	0.59
96	0.58
97	0.55
98	0.5
99	0.43
100	0.36
101	0.33
102	0.34
103	0.29
104	0.26
105	0.24
106	0.21
107	0.21
108	0.21
109	0.16
110	0.11
111	0.11
112	0.11
113	0.1
114	0.09
115	0.11
116	0.13
117	0.13
118	0.12
119	0.13
120	0.15
121	0.19
122	0.25
123	0.29
124	0.36
125	0.44
126	0.52
127	0.61
128	0.68
129	0.72
130	0.72
131	0.71
132	0.72
133	0.7
134	0.71
135	0.66
136	0.6
137	0.52
138	0.48
139	0.46
140	0.37
141	0.32
142	0.26
143	0.23
144	0.19
145	0.2
146	0.19
147	0.16
148	0.15
149	0.15
150	0.12
151	0.11
152	0.11
153	0.1
154	0.09
155	0.09
156	0.09
157	0.12
158	0.12
159	0.14
160	0.16
161	0.17
162	0.18
163	0.22
164	0.22
165	0.21
166	0.22
167	0.21
168	0.19
169	0.19
170	0.18
171	0.13
172	0.13
173	0.1
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.09
181	0.14
182	0.19
183	0.28
184	0.38
185	0.37
186	0.45
187	0.52
188	0.55
189	0.57
190	0.55
191	0.49
192	0.47
193	0.48
194	0.41
195	0.35
196	0.3
197	0.23
198	0.21
199	0.18
200	0.09
201	0.09
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.09
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.07
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.11
219	0.1
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.08
226	0.08
227	0.09
228	0.11
229	0.14
230	0.17
231	0.18
232	0.21
233	0.24
234	0.27
235	0.28
236	0.29
237	0.31
238	0.29
239	0.29
240	0.32
241	0.34
242	0.3
243	0.3
244	0.29
245	0.27
246	0.27
247	0.25
248	0.23
249	0.23
250	0.31
251	0.33
252	0.38
253	0.38
254	0.38
255	0.4
256	0.37
257	0.33
258	0.26
259	0.3
260	0.29
261	0.31
262	0.35
263	0.36
264	0.38
265	0.46
266	0.51
267	0.5
268	0.53
269	0.56
270	0.62
271	0.68
272	0.76
273	0.74
274	0.76
275	0.75
276	0.73
277	0.66
278	0.58
279	0.52
280	0.51
281	0.5
282	0.51
283	0.53
284	0.52
285	0.58
286	0.6
287	0.64
288	0.66
289	0.69
290	0.69
291	0.69
292	0.72
293	0.7
294	0.67
295	0.62
296	0.56
297	0.5
298	0.41
299	0.35
300	0.27
301	0.21
302	0.22
303	0.19
304	0.15
305	0.19
306	0.23
307	0.26
308	0.34
309	0.39
310	0.45
311	0.53
312	0.57
313	0.53
314	0.56
315	0.58
316	0.53
317	0.52
318	0.5
319	0.42
320	0.4
321	0.38
322	0.31
323	0.25
324	0.2
325	0.18
326	0.13
327	0.12
328	0.1
329	0.09
330	0.1
331	0.11
332	0.11
333	0.1
334	0.09
335	0.1
336	0.11
337	0.11
338	0.1
339	0.09
340	0.1
341	0.13
342	0.14
343	0.14
344	0.13
345	0.14
346	0.14
347	0.14
348	0.18
349	0.16
350	0.16
351	0.15
352	0.15
353	0.13
354	0.14
355	0.14
356	0.12
357	0.14
358	0.18
359	0.2
360	0.21
361	0.22
362	0.23
363	0.24
364	0.24
365	0.22
366	0.26
367	0.3
368	0.34
369	0.35
370	0.34
371	0.37
372	0.36
373	0.36
374	0.29
375	0.25
376	0.23
377	0.29
378	0.33
379	0.29
380	0.3
381	0.3
382	0.28
383	0.24
384	0.2
385	0.12
386	0.08
387	0.07
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.07
395	0.08
396	0.11
397	0.15
398	0.18
399	0.2
400	0.29
401	0.36
402	0.38
403	0.49
404	0.48
405	0.45
406	0.48
407	0.51
408	0.45
409	0.38
410	0.34
411	0.24
412	0.29
413	0.32
414	0.27
415	0.28
416	0.29
417	0.29
418	0.34
419	0.36
420	0.29
421	0.28
422	0.31
423	0.31
424	0.33
425	0.31
426	0.31
427	0.34
428	0.34
429	0.32
430	0.3
431	0.27
432	0.22
433	0.22
434	0.18
435	0.13
436	0.12
437	0.12
438	0.09
439	0.07
440	0.06
441	0.07
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.08
447	0.09
448	0.14
449	0.14
450	0.19
451	0.2
452	0.22
453	0.22
454	0.22
455	0.26
456	0.21
457	0.22
458	0.21
459	0.22
460	0.21
461	0.3
462	0.41
463	0.43
464	0.51
465	0.55
466	0.58
467	0.65
468	0.73
469	0.7
470	0.66
471	0.62
472	0.53
473	0.52
474	0.45
475	0.36
476	0.28
477	0.22
478	0.16
479	0.14
480	0.15
481	0.15
482	0.14

D8Q7T9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer