Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PWH1

Protein Details
Accession D8PWH1    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-252KLEIAKRHAKWEKNKREREKKRQDDQEAERBasic
473-492DEEKRKKEEEEERQRRKEREAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-244RWRKLEIAKRHAKWEKNKREREKKR
477-490RKKEEEEERQRRKE
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 9, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG scm:SCHCO_02606582  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
PF00240  ubiquitin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
PS50053  UBIQUITIN_2  
Amino Acid Sequences MSVAVQTPPNGLLNGEANGVNGDAEAPHVARFASGLILPPPEIKSVIDRTATFVARSANPPQFEDKIREGQRNDPKFSFLNPADPYHAYYRHKLTKVAQGEIEEVPKTGTATPQAKDVEVKVVDHGLEPPAPDFIMDMPNISAIDLDIMKLTALFTARRGRNFIQALSAREARNFQFEFLRPTHSLFGYFNRLVDQYTKVLHPNKDMLEQLQLDAEPGARWRKLEIAKRHAKWEKNKREREKKRQDDQEAERIAFAEIDWHDYAIVQTIEFTAADATSELPPPMSVQEVENMTLAQKRYAAMILENTAEDVEAHRARQAAAEAEAAAAAAQAQAAQNVAQQQQDTVMQPVGVAETPEDRARREQQERAREIEHAQAMQAGSGPMKIRTDYVPKLGAKSKQTMTTCTVCGQQIPVDELQEHMRIELLDPKWKEQRDMNEARRARASELLSGANVVSSLKNLARTRVDIFGAEADEEKRKKEEEEERQRRKEREKVVWDGHTASMARTVDAYSTNVNFEEQIAAIHRAKGLGPQETSAIGPGLAPASSVPAPLTGASSLPAAPGGSAANPAYSAATVASGPQPASTYPAQPPVMLPPMHYQGQPPAGGYGYPPGQGSPAPPMQAGQVRSADEMDGGADAAPPAKRQRVAKLPGGQLYPEADWIAMHPYPISLQVQLPKDDTKPEWKLDGTTVTLSELPLNLLVSTLRDRILQATGSAAPVSRIRLSYQGKMLTNSTTIASHNLEEEDVLVLSVSAPKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.15
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.11
8 0.08
9 0.07
10 0.06
11 0.07
12 0.08
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.11
23 0.12
24 0.14
25 0.15
26 0.17
27 0.18
28 0.18
29 0.18
30 0.17
31 0.22
32 0.26
33 0.3
34 0.31
35 0.3
36 0.33
37 0.38
38 0.38
39 0.32
40 0.28
41 0.28
42 0.28
43 0.32
44 0.34
45 0.34
46 0.35
47 0.37
48 0.41
49 0.41
50 0.41
51 0.44
52 0.42
53 0.45
54 0.49
55 0.54
56 0.51
57 0.57
58 0.63
59 0.64
60 0.65
61 0.57
62 0.55
63 0.5
64 0.49
65 0.49
66 0.39
67 0.4
68 0.36
69 0.38
70 0.38
71 0.38
72 0.39
73 0.35
74 0.41
75 0.37
76 0.4
77 0.46
78 0.51
79 0.52
80 0.53
81 0.52
82 0.54
83 0.55
84 0.53
85 0.46
86 0.39
87 0.4
88 0.37
89 0.35
90 0.26
91 0.21
92 0.17
93 0.16
94 0.15
95 0.13
96 0.13
97 0.19
98 0.23
99 0.23
100 0.29
101 0.29
102 0.29
103 0.3
104 0.29
105 0.29
106 0.25
107 0.25
108 0.2
109 0.21
110 0.2
111 0.19
112 0.19
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.09
130 0.06
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.12
143 0.22
144 0.25
145 0.28
146 0.34
147 0.34
148 0.41
149 0.43
150 0.4
151 0.39
152 0.39
153 0.4
154 0.39
155 0.42
156 0.33
157 0.32
158 0.35
159 0.28
160 0.32
161 0.28
162 0.25
163 0.26
164 0.27
165 0.31
166 0.29
167 0.34
168 0.28
169 0.3
170 0.32
171 0.26
172 0.27
173 0.23
174 0.26
175 0.27
176 0.27
177 0.24
178 0.23
179 0.23
180 0.22
181 0.22
182 0.21
183 0.16
184 0.17
185 0.19
186 0.23
187 0.29
188 0.3
189 0.31
190 0.33
191 0.33
192 0.34
193 0.33
194 0.28
195 0.27
196 0.25
197 0.22
198 0.18
199 0.16
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.07
204 0.1
205 0.14
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.22
210 0.29
211 0.37
212 0.43
213 0.5
214 0.59
215 0.6
216 0.69
217 0.69
218 0.69
219 0.71
220 0.73
221 0.74
222 0.75
223 0.84
224 0.85
225 0.89
226 0.93
227 0.93
228 0.93
229 0.92
230 0.92
231 0.91
232 0.87
233 0.85
234 0.8
235 0.77
236 0.68
237 0.58
238 0.48
239 0.39
240 0.32
241 0.23
242 0.16
243 0.12
244 0.09
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.1
252 0.1
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.1
275 0.11
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.13
281 0.12
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.13
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.04
315 0.03
316 0.02
317 0.02
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.05
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.04
341 0.05
342 0.07
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.15
347 0.2
348 0.27
349 0.31
350 0.36
351 0.41
352 0.5
353 0.51
354 0.5
355 0.46
356 0.4
357 0.36
358 0.34
359 0.27
360 0.18
361 0.15
362 0.14
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.06
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.11
375 0.16
376 0.17
377 0.19
378 0.23
379 0.23
380 0.25
381 0.28
382 0.3
383 0.27
384 0.31
385 0.3
386 0.32
387 0.32
388 0.32
389 0.32
390 0.3
391 0.29
392 0.25
393 0.25
394 0.19
395 0.18
396 0.16
397 0.13
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.1
402 0.1
403 0.11
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.09
411 0.15
412 0.14
413 0.18
414 0.19
415 0.23
416 0.28
417 0.29
418 0.3
419 0.28
420 0.34
421 0.37
422 0.46
423 0.47
424 0.51
425 0.51
426 0.51
427 0.49
428 0.43
429 0.35
430 0.32
431 0.28
432 0.21
433 0.22
434 0.2
435 0.18
436 0.17
437 0.15
438 0.09
439 0.08
440 0.06
441 0.04
442 0.04
443 0.06
444 0.07
445 0.13
446 0.14
447 0.18
448 0.19
449 0.21
450 0.23
451 0.24
452 0.24
453 0.17
454 0.17
455 0.15
456 0.14
457 0.12
458 0.1
459 0.09
460 0.14
461 0.15
462 0.15
463 0.16
464 0.16
465 0.17
466 0.24
467 0.33
468 0.38
469 0.5
470 0.59
471 0.67
472 0.75
473 0.8
474 0.79
475 0.76
476 0.74
477 0.71
478 0.7
479 0.68
480 0.67
481 0.66
482 0.62
483 0.56
484 0.5
485 0.41
486 0.33
487 0.26
488 0.19
489 0.18
490 0.15
491 0.14
492 0.12
493 0.12
494 0.11
495 0.12
496 0.13
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.11
502 0.11
503 0.1
504 0.09
505 0.07
506 0.07
507 0.09
508 0.12
509 0.13
510 0.14
511 0.13
512 0.13
513 0.13
514 0.17
515 0.18
516 0.18
517 0.18
518 0.18
519 0.19
520 0.19
521 0.19
522 0.15
523 0.12
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.05
529 0.05
530 0.04
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.07
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.08
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.05
560 0.06
561 0.06
562 0.07
563 0.08
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.09
569 0.14
570 0.14
571 0.17
572 0.18
573 0.25
574 0.25
575 0.24
576 0.25
577 0.26
578 0.3
579 0.26
580 0.26
581 0.24
582 0.28
583 0.3
584 0.29
585 0.25
586 0.25
587 0.29
588 0.27
589 0.23
590 0.19
591 0.18
592 0.17
593 0.16
594 0.15
595 0.13
596 0.13
597 0.13
598 0.12
599 0.13
600 0.13
601 0.15
602 0.17
603 0.18
604 0.18
605 0.18
606 0.18
607 0.21
608 0.25
609 0.25
610 0.23
611 0.23
612 0.23
613 0.24
614 0.24
615 0.2
616 0.15
617 0.14
618 0.1
619 0.07
620 0.06
621 0.06
622 0.05
623 0.05
624 0.08
625 0.08
626 0.11
627 0.15
628 0.2
629 0.25
630 0.29
631 0.38
632 0.45
633 0.51
634 0.57
635 0.6
636 0.6
637 0.61
638 0.58
639 0.49
640 0.41
641 0.38
642 0.3
643 0.23
644 0.18
645 0.13
646 0.11
647 0.12
648 0.15
649 0.13
650 0.12
651 0.11
652 0.11
653 0.12
654 0.15
655 0.16
656 0.13
657 0.16
658 0.22
659 0.26
660 0.28
661 0.3
662 0.3
663 0.3
664 0.34
665 0.34
666 0.37
667 0.39
668 0.4
669 0.42
670 0.4
671 0.4
672 0.38
673 0.38
674 0.31
675 0.27
676 0.25
677 0.22
678 0.22
679 0.2
680 0.18
681 0.14
682 0.12
683 0.12
684 0.12
685 0.1
686 0.1
687 0.09
688 0.11
689 0.14
690 0.15
691 0.15
692 0.15
693 0.16
694 0.18
695 0.21
696 0.19
697 0.16
698 0.18
699 0.18
700 0.18
701 0.17
702 0.15
703 0.14
704 0.16
705 0.19
706 0.19
707 0.19
708 0.2
709 0.29
710 0.34
711 0.38
712 0.43
713 0.46
714 0.45
715 0.47
716 0.47
717 0.4
718 0.36
719 0.31
720 0.26
721 0.2
722 0.19
723 0.2
724 0.21
725 0.19
726 0.19
727 0.19
728 0.17
729 0.16
730 0.16
731 0.13
732 0.1
733 0.09
734 0.07
735 0.06
736 0.07
737 0.13