Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PQC4

Protein Details
Accession D8PQC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-148YALKTEYSKEKYKKRKEAKFSKAFTTHydrophilic
400-422AVVLRQRKVKKARTDEPARPRVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-139KKRKE
Subcellular Location(s) cyto 18, cyto_nucl 13.833, cyto_mito 11.165, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG scm:SCHCO_02529524  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MLETRESTIQSGNTVLLRVPNGDIRGIKIEQNTTISLGRFGSFHANELLGEPYGLTYEIKEKKLTVIPPKSFEEIEDTEATNELINDGQFVQPLTAQEIHALRQSGVHASEIIKKQIEQHANYALKTEYSKEKYKKRKEAKFSKAFTTVEPTLFNVCNYWFNKDQNRIRDLRPDSLAQILTHANVRPGGRYIAVDDASGMLVAGILERMGGEGRLITICDVDSPPAYPVIVNMNFKPGVTSVLSSLNWATADEDYSPLIASADADEDAEARSERQKARLNKRKATGEGLLNLREELFTGEFDALIVASAYEPWSILEKLYPYLAGSAPIVFHSPYHQVIVDLAARVRGRSGYLAPTVVEPWLRQYQVLPGRTHPTMNTSGTGGYFFHALKVYDDPNASAAVVLRQRKVKKARTDEPARPRVGVIREDPSVSASTTPGPSVEEGRGTYPSTSTPAPTSQTTLPERNTKEAEVKAEDADSTMADSSHTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.16
4 0.17
5 0.17
6 0.18
7 0.21
8 0.21
9 0.25
10 0.25
11 0.25
12 0.29
13 0.29
14 0.3
15 0.3
16 0.31
17 0.3
18 0.33
19 0.3
20 0.27
21 0.29
22 0.26
23 0.23
24 0.22
25 0.19
26 0.16
27 0.17
28 0.23
29 0.2
30 0.22
31 0.22
32 0.21
33 0.2
34 0.22
35 0.22
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.17
45 0.23
46 0.25
47 0.26
48 0.26
49 0.31
50 0.37
51 0.43
52 0.45
53 0.49
54 0.51
55 0.54
56 0.58
57 0.55
58 0.49
59 0.43
60 0.4
61 0.32
62 0.32
63 0.28
64 0.25
65 0.22
66 0.23
67 0.22
68 0.15
69 0.13
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.13
82 0.14
83 0.13
84 0.17
85 0.18
86 0.18
87 0.2
88 0.2
89 0.16
90 0.17
91 0.18
92 0.16
93 0.16
94 0.15
95 0.14
96 0.15
97 0.22
98 0.23
99 0.25
100 0.23
101 0.23
102 0.27
103 0.34
104 0.39
105 0.34
106 0.35
107 0.41
108 0.42
109 0.41
110 0.38
111 0.3
112 0.25
113 0.23
114 0.23
115 0.23
116 0.27
117 0.36
118 0.42
119 0.52
120 0.61
121 0.71
122 0.78
123 0.8
124 0.85
125 0.87
126 0.9
127 0.9
128 0.89
129 0.82
130 0.77
131 0.72
132 0.63
133 0.53
134 0.5
135 0.41
136 0.32
137 0.29
138 0.25
139 0.23
140 0.22
141 0.21
142 0.15
143 0.14
144 0.19
145 0.2
146 0.24
147 0.24
148 0.29
149 0.36
150 0.44
151 0.49
152 0.49
153 0.54
154 0.52
155 0.5
156 0.55
157 0.51
158 0.46
159 0.43
160 0.37
161 0.32
162 0.32
163 0.31
164 0.22
165 0.2
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.02
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.11
217 0.14
218 0.15
219 0.15
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.12
225 0.11
226 0.1
227 0.11
228 0.09
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.08
259 0.13
260 0.14
261 0.21
262 0.28
263 0.37
264 0.49
265 0.58
266 0.64
267 0.66
268 0.71
269 0.7
270 0.64
271 0.6
272 0.53
273 0.45
274 0.41
275 0.37
276 0.32
277 0.26
278 0.24
279 0.19
280 0.14
281 0.12
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.1
306 0.11
307 0.1
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.12
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.13
326 0.15
327 0.14
328 0.11
329 0.1
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.11
335 0.11
336 0.13
337 0.15
338 0.15
339 0.16
340 0.17
341 0.16
342 0.17
343 0.16
344 0.15
345 0.14
346 0.1
347 0.14
348 0.18
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.25
353 0.32
354 0.37
355 0.33
356 0.32
357 0.37
358 0.38
359 0.38
360 0.3
361 0.28
362 0.28
363 0.28
364 0.25
365 0.21
366 0.21
367 0.2
368 0.2
369 0.15
370 0.11
371 0.11
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.17
378 0.17
379 0.18
380 0.19
381 0.18
382 0.17
383 0.17
384 0.15
385 0.12
386 0.11
387 0.13
388 0.18
389 0.21
390 0.24
391 0.32
392 0.35
393 0.44
394 0.53
395 0.57
396 0.62
397 0.69
398 0.73
399 0.76
400 0.82
401 0.82
402 0.83
403 0.82
404 0.74
405 0.65
406 0.57
407 0.53
408 0.49
409 0.44
410 0.38
411 0.34
412 0.33
413 0.34
414 0.33
415 0.29
416 0.25
417 0.21
418 0.17
419 0.14
420 0.16
421 0.16
422 0.16
423 0.14
424 0.14
425 0.15
426 0.18
427 0.18
428 0.18
429 0.18
430 0.2
431 0.22
432 0.22
433 0.21
434 0.19
435 0.19
436 0.2
437 0.2
438 0.2
439 0.21
440 0.23
441 0.26
442 0.27
443 0.3
444 0.29
445 0.36
446 0.4
447 0.43
448 0.44
449 0.49
450 0.52
451 0.54
452 0.54
453 0.5
454 0.5
455 0.48
456 0.49
457 0.44
458 0.42
459 0.37
460 0.34
461 0.3
462 0.25
463 0.21
464 0.15
465 0.12
466 0.11
467 0.09