FuNGI

D8PKF2

Protein Details

Accession

D8PKF2

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
261-327	DEEVERSHKKKRKRRSDSQERPSKKRRRKAVFTSDEEDSEDSKDERRKKRKRSKSKSKSREHDSDSE	Basic
330-349	DETSSQKKLKQNGKKRQLSE	Hydrophilic
355-381	SEIERAVSSKKKKKRRSRNSDSEDEDE	Hydrophilic
383-412	SEDEERRRKEKEKQKRKRKLERSPSPDLLL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
267-289	SHKKKRKRRSDSQERPSKKRRRK
305-320	ERRKKRKRSKSKSKSR
363-372	SKKKKKRRSR
388-404	RRRKEKEKQKRKRKLER

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	scm:SCHCO_02667187 -
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSARKANDLEKKLHKAALKAHNKELSVEDVAEIIPDNKARTDALNFLLKVGLFKSLKNEKGKVSFRAVTKEEITVTKDLTAEEGLVLSHIKASKNEGIWTKHLKAKTNLAQALIDKCLKVLTQKKLIKRVQSVQHPTRKIYMLEGVEPSVALTGGPWYTDNELDVAFINTLIRACLKIVRDMSSPRQSADKQGALFPIGYQPEYPTAQKIRSALQRAHLTDTDLSEEHVESLLNVLILDGEIERIPVGISVPRHDDTESSDEEVERSHKKKRKRRSDSQERPSKKRRRKAVFTSDEEDSEDSKDERRKKRKRSKSKSKSREHDSDSEDEDETSSQKKLKQNGKKRQLSESEDSDSEIERAVSSKKKKKRRSRNSDSEDEDEDSEDEERRRKEKEKQKRKRKLERSPSPDLLLGVDLGESEGVYAYRAVRQEQLSLGWSQAPCSICPSFQFCKEGGPVNPTECVYYTDWLAQANVQAVEEGEQA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.54
3	0.58
4	0.61
5	0.62
6	0.59
7	0.64
8	0.64
9	0.61
10	0.58
11	0.51
12	0.45
13	0.37
14	0.32
15	0.24
16	0.19
17	0.18
18	0.16
19	0.14
20	0.1
21	0.1
22	0.11
23	0.13
24	0.13
25	0.14
26	0.15
27	0.18
28	0.2
29	0.22
30	0.24
31	0.3
32	0.29
33	0.28
34	0.29
35	0.26
36	0.23
37	0.2
38	0.24
39	0.18
40	0.19
41	0.27
42	0.34
43	0.42
44	0.47
45	0.5
46	0.49
47	0.57
48	0.62
49	0.59
50	0.58
51	0.56
52	0.52
53	0.56
54	0.52
55	0.47
56	0.43
57	0.4
58	0.34
59	0.31
60	0.32
61	0.26
62	0.24
63	0.21
64	0.2
65	0.18
66	0.17
67	0.15
68	0.12
69	0.1
70	0.09
71	0.07
72	0.07
73	0.08
74	0.06
75	0.08
76	0.11
77	0.12
78	0.13
79	0.19
80	0.24
81	0.25
82	0.3
83	0.33
84	0.35
85	0.4
86	0.46
87	0.45
88	0.45
89	0.46
90	0.48
91	0.46
92	0.52
93	0.54
94	0.56
95	0.53
96	0.49
97	0.47
98	0.43
99	0.41
100	0.35
101	0.28
102	0.19
103	0.18
104	0.17
105	0.16
106	0.21
107	0.26
108	0.3
109	0.39
110	0.45
111	0.52
112	0.61
113	0.65
114	0.65
115	0.64
116	0.65
117	0.63
118	0.67
119	0.71
120	0.7
121	0.74
122	0.69
123	0.63
124	0.59
125	0.54
126	0.44
127	0.37
128	0.34
129	0.27
130	0.26
131	0.25
132	0.21
133	0.19
134	0.18
135	0.15
136	0.09
137	0.07
138	0.05
139	0.04
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.06
144	0.07
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.05
161	0.06
162	0.1
163	0.11
164	0.15
165	0.17
166	0.2
167	0.22
168	0.25
169	0.32
170	0.36
171	0.35
172	0.31
173	0.34
174	0.32
175	0.34
176	0.36
177	0.32
178	0.25
179	0.26
180	0.26
181	0.22
182	0.21
183	0.17
184	0.15
185	0.12
186	0.12
187	0.1
188	0.11
189	0.13
190	0.15
191	0.15
192	0.15
193	0.17
194	0.17
195	0.19
196	0.2
197	0.22
198	0.26
199	0.3
200	0.28
201	0.32
202	0.36
203	0.35
204	0.37
205	0.32
206	0.28
207	0.25
208	0.24
209	0.19
210	0.14
211	0.13
212	0.1
213	0.1
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.06
236	0.06
237	0.08
238	0.12
239	0.12
240	0.13
241	0.13
242	0.13
243	0.15
244	0.18
245	0.18
246	0.15
247	0.15
248	0.14
249	0.14
250	0.14
251	0.14
252	0.16
253	0.18
254	0.25
255	0.3
256	0.41
257	0.5
258	0.6
259	0.68
260	0.73
261	0.81
262	0.84
263	0.9
264	0.91
265	0.92
266	0.92
267	0.87
268	0.85
269	0.85
270	0.84
271	0.82
272	0.8
273	0.8
274	0.79
275	0.83
276	0.84
277	0.85
278	0.82
279	0.78
280	0.74
281	0.64
282	0.55
283	0.46
284	0.37
285	0.26
286	0.19
287	0.15
288	0.11
289	0.15
290	0.21
291	0.29
292	0.39
293	0.49
294	0.58
295	0.68
296	0.79
297	0.85
298	0.91
299	0.93
300	0.94
301	0.94
302	0.96
303	0.95
304	0.95
305	0.93
306	0.89
307	0.86
308	0.81
309	0.77
310	0.69
311	0.62
312	0.54
313	0.47
314	0.39
315	0.31
316	0.25
317	0.18
318	0.15
319	0.14
320	0.12
321	0.13
322	0.18
323	0.23
324	0.32
325	0.41
326	0.51
327	0.6
328	0.7
329	0.78
330	0.81
331	0.79
332	0.78
333	0.76
334	0.73
335	0.67
336	0.61
337	0.54
338	0.46
339	0.44
340	0.36
341	0.29
342	0.22
343	0.16
344	0.12
345	0.08
346	0.09
347	0.12
348	0.19
349	0.29
350	0.38
351	0.47
352	0.57
353	0.68
354	0.78
355	0.85
356	0.89
357	0.91
358	0.92
359	0.94
360	0.92
361	0.9
362	0.84
363	0.77
364	0.68
365	0.59
366	0.48
367	0.38
368	0.3
369	0.23
370	0.18
371	0.17
372	0.16
373	0.2
374	0.23
375	0.26
376	0.31
377	0.37
378	0.46
379	0.54
380	0.63
381	0.69
382	0.76
383	0.84
384	0.9
385	0.94
386	0.95
387	0.95
388	0.95
389	0.95
390	0.95
391	0.91
392	0.9
393	0.82
394	0.74
395	0.64
396	0.53
397	0.43
398	0.32
399	0.24
400	0.15
401	0.11
402	0.08
403	0.06
404	0.06
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.05
410	0.06
411	0.07
412	0.11
413	0.13
414	0.15
415	0.2
416	0.21
417	0.23
418	0.24
419	0.25
420	0.23
421	0.22
422	0.22
423	0.21
424	0.2
425	0.19
426	0.21
427	0.21
428	0.19
429	0.24
430	0.25
431	0.21
432	0.24
433	0.3
434	0.31
435	0.34
436	0.37
437	0.31
438	0.35
439	0.38
440	0.41
441	0.36
442	0.37
443	0.36
444	0.35
445	0.37
446	0.32
447	0.31
448	0.26
449	0.27
450	0.24
451	0.23
452	0.22
453	0.23
454	0.23
455	0.22
456	0.21
457	0.18
458	0.18
459	0.19
460	0.18
461	0.15
462	0.14
463	0.14

D8PKF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer