Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PNF8

Protein Details
Accession D8PNF8    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-134EDQNADERPRKRRRKDKKPQPPTVVPLBasic
261-285QTGEARSNPGRKKKASKDKAGFYAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-127RPRKRRRKDKKPQ
218-223KRKSKY
268-320NPGRKKKASKDKAGFYAFEKAERQRKELIELKRKWEEDKEKIEKLKASRKFRP
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG scm:SCHCO_02499140  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
CDD cd12950  RRP7_Rrp7p  
Amino Acid Sequences MSAPTHVAGFTVLPVSYSKSATHYIYARAHQPPKKQQDDALPAGRTLFLANIPPDATDREIITFFKPSGTVEKVVLDFDLAQEEAPVSSDSEDESMSEGEEGGQGVGEDQNADERPRKRRRKDKKPQPPTVVPLPEPPLRKLGHTGRSAHVVFLDASSLERALTPPTSPRPWPTDPDAPIGLAHYTALYDALRPPLDVVRAHADTYMDLYEFEQARAKRKSKYRKGEAIVDEDGFTLVTRGGAYGQTLGGGVGVASKRFQQTGEARSNPGRKKKASKDKAGFYAFEKAERQRKELIELKRKWEEDKEKIEKLKASRKFRPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.15
3 0.16
4 0.18
5 0.18
6 0.2
7 0.24
8 0.25
9 0.29
10 0.27
11 0.32
12 0.35
13 0.37
14 0.4
15 0.45
16 0.52
17 0.53
18 0.6
19 0.64
20 0.69
21 0.73
22 0.69
23 0.66
24 0.67
25 0.69
26 0.66
27 0.62
28 0.52
29 0.45
30 0.43
31 0.38
32 0.28
33 0.21
34 0.15
35 0.09
36 0.13
37 0.13
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.17
43 0.17
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.16
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.19
56 0.21
57 0.21
58 0.2
59 0.22
60 0.21
61 0.21
62 0.2
63 0.14
64 0.11
65 0.09
66 0.1
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.07
98 0.08
99 0.1
100 0.16
101 0.21
102 0.31
103 0.42
104 0.52
105 0.6
106 0.7
107 0.8
108 0.85
109 0.91
110 0.93
111 0.93
112 0.94
113 0.94
114 0.91
115 0.85
116 0.78
117 0.74
118 0.66
119 0.55
120 0.48
121 0.42
122 0.38
123 0.35
124 0.32
125 0.29
126 0.26
127 0.26
128 0.29
129 0.31
130 0.34
131 0.35
132 0.37
133 0.33
134 0.38
135 0.37
136 0.31
137 0.24
138 0.18
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.1
153 0.14
154 0.16
155 0.17
156 0.2
157 0.26
158 0.28
159 0.31
160 0.34
161 0.36
162 0.35
163 0.38
164 0.35
165 0.28
166 0.26
167 0.23
168 0.17
169 0.1
170 0.08
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.13
184 0.12
185 0.14
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.16
191 0.14
192 0.15
193 0.13
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.16
201 0.17
202 0.24
203 0.31
204 0.35
205 0.38
206 0.47
207 0.58
208 0.63
209 0.73
210 0.74
211 0.76
212 0.77
213 0.79
214 0.72
215 0.67
216 0.58
217 0.48
218 0.39
219 0.29
220 0.25
221 0.16
222 0.12
223 0.07
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.11
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.19
248 0.25
249 0.33
250 0.41
251 0.4
252 0.43
253 0.49
254 0.58
255 0.58
256 0.61
257 0.62
258 0.6
259 0.69
260 0.76
261 0.8
262 0.81
263 0.84
264 0.83
265 0.83
266 0.84
267 0.77
268 0.68
269 0.59
270 0.59
271 0.48
272 0.44
273 0.4
274 0.39
275 0.44
276 0.46
277 0.47
278 0.45
279 0.46
280 0.5
281 0.54
282 0.57
283 0.59
284 0.6
285 0.65
286 0.66
287 0.66
288 0.63
289 0.66
290 0.65
291 0.63
292 0.69
293 0.69
294 0.68
295 0.72
296 0.72
297 0.68
298 0.67
299 0.68
300 0.67
301 0.68