Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PV49

Protein Details
Accession D8PV49    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
380-403AARIRDEMRKEKRREREREMRMNNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-235RYKHKKIPRGPPSPPPPVLRSPPRK
388-396RKEKRRERE
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG scm:SCHCO_02608068  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASLAAALPQPINSGVESDHEEDFRQASTSTTIITRAPIPPYGQRKGWRPTSQADFGDGGAYPECHVAQYPLDMGKKKTAAGNTIALQVDSEGNVRYDAIATQGQREGKTVQSQFKDLVPMLHRQDLDDEARAMERPSEDEVQATTDKTRAALEKLVNGKIKAAQPKNVASGQGKTSYIRYTPGQQNGAAGLKQRIIKMSEVVEDPLEPPRYKHKKIPRGPPSPPPPVLRSPPRKATAAEQKEWMIPPCISNWKNNKGFTIPLDKRLAADGRGLQDVTINDNFAKFSEALFVADRHAREEVRQRAIMQQKLAAKEKAAKEENLRMMAQRAREERGGAPRAAATAQATAAAKASLGAYGSDSESESDRESAAEDSGEDEEAARIRDEMRKEKRREREREMRMNNMGAEQRAKMLARQQNRDISEKVALGIAKPTLSKESMLDSRLFNQESLPGSFGDEESYSLYDRPLFHGSTAAAAIYKARANIGGEDAEQFGGGTEEGIGKALEADRFGLGPTRVGFEGANEQEVREGPVQFEKDTGDVFGLNQFLDEAKTGKKRGLDTEAGGARKRQQLERANERE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.14
4 0.18
5 0.2
6 0.21
7 0.2
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.19
12 0.16
13 0.14
14 0.13
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.16
20 0.15
21 0.17
22 0.19
23 0.2
24 0.23
25 0.24
26 0.27
27 0.34
28 0.42
29 0.45
30 0.48
31 0.52
32 0.57
33 0.62
34 0.69
35 0.67
36 0.64
37 0.65
38 0.66
39 0.67
40 0.59
41 0.54
42 0.45
43 0.38
44 0.34
45 0.27
46 0.2
47 0.14
48 0.14
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.13
57 0.15
58 0.18
59 0.23
60 0.26
61 0.28
62 0.33
63 0.34
64 0.34
65 0.36
66 0.34
67 0.33
68 0.34
69 0.36
70 0.31
71 0.34
72 0.32
73 0.27
74 0.24
75 0.2
76 0.17
77 0.13
78 0.13
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.1
87 0.13
88 0.13
89 0.16
90 0.2
91 0.22
92 0.22
93 0.24
94 0.23
95 0.23
96 0.31
97 0.33
98 0.37
99 0.37
100 0.38
101 0.38
102 0.37
103 0.37
104 0.29
105 0.3
106 0.25
107 0.29
108 0.3
109 0.34
110 0.32
111 0.29
112 0.31
113 0.29
114 0.29
115 0.24
116 0.21
117 0.17
118 0.18
119 0.18
120 0.16
121 0.14
122 0.12
123 0.12
124 0.16
125 0.18
126 0.17
127 0.17
128 0.17
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.14
138 0.16
139 0.2
140 0.2
141 0.25
142 0.29
143 0.34
144 0.34
145 0.32
146 0.31
147 0.31
148 0.34
149 0.37
150 0.37
151 0.38
152 0.39
153 0.42
154 0.45
155 0.41
156 0.39
157 0.32
158 0.32
159 0.28
160 0.27
161 0.25
162 0.22
163 0.22
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.19
168 0.24
169 0.3
170 0.35
171 0.35
172 0.33
173 0.32
174 0.31
175 0.31
176 0.24
177 0.19
178 0.15
179 0.16
180 0.19
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.2
187 0.19
188 0.17
189 0.17
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.16
194 0.18
195 0.16
196 0.16
197 0.27
198 0.35
199 0.38
200 0.46
201 0.52
202 0.59
203 0.68
204 0.77
205 0.77
206 0.77
207 0.78
208 0.78
209 0.75
210 0.72
211 0.67
212 0.6
213 0.54
214 0.5
215 0.53
216 0.53
217 0.54
218 0.53
219 0.56
220 0.56
221 0.53
222 0.49
223 0.5
224 0.51
225 0.48
226 0.44
227 0.38
228 0.36
229 0.36
230 0.36
231 0.29
232 0.21
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.23
237 0.22
238 0.29
239 0.35
240 0.41
241 0.46
242 0.46
243 0.45
244 0.38
245 0.39
246 0.34
247 0.37
248 0.3
249 0.3
250 0.32
251 0.3
252 0.29
253 0.29
254 0.27
255 0.18
256 0.18
257 0.15
258 0.14
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.14
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.07
273 0.06
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.11
285 0.13
286 0.21
287 0.26
288 0.27
289 0.28
290 0.28
291 0.33
292 0.39
293 0.39
294 0.31
295 0.29
296 0.29
297 0.32
298 0.34
299 0.28
300 0.23
301 0.27
302 0.28
303 0.31
304 0.3
305 0.28
306 0.28
307 0.34
308 0.36
309 0.32
310 0.3
311 0.23
312 0.24
313 0.25
314 0.24
315 0.22
316 0.22
317 0.22
318 0.22
319 0.24
320 0.24
321 0.29
322 0.3
323 0.25
324 0.23
325 0.21
326 0.21
327 0.19
328 0.16
329 0.09
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.13
372 0.17
373 0.27
374 0.37
375 0.46
376 0.53
377 0.62
378 0.71
379 0.77
380 0.81
381 0.8
382 0.81
383 0.81
384 0.84
385 0.8
386 0.76
387 0.69
388 0.62
389 0.52
390 0.45
391 0.37
392 0.27
393 0.24
394 0.18
395 0.16
396 0.16
397 0.16
398 0.14
399 0.21
400 0.27
401 0.32
402 0.38
403 0.42
404 0.47
405 0.5
406 0.52
407 0.45
408 0.41
409 0.37
410 0.31
411 0.26
412 0.21
413 0.18
414 0.15
415 0.15
416 0.13
417 0.11
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.14
422 0.14
423 0.13
424 0.18
425 0.21
426 0.23
427 0.23
428 0.22
429 0.24
430 0.28
431 0.28
432 0.23
433 0.2
434 0.22
435 0.23
436 0.23
437 0.21
438 0.16
439 0.16
440 0.17
441 0.16
442 0.14
443 0.11
444 0.1
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.11
449 0.12
450 0.13
451 0.14
452 0.18
453 0.2
454 0.19
455 0.19
456 0.21
457 0.21
458 0.19
459 0.18
460 0.14
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.1
467 0.1
468 0.12
469 0.13
470 0.14
471 0.16
472 0.15
473 0.14
474 0.15
475 0.16
476 0.14
477 0.12
478 0.1
479 0.08
480 0.07
481 0.06
482 0.05
483 0.05
484 0.06
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.08
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.15
498 0.13
499 0.16
500 0.16
501 0.18
502 0.17
503 0.18
504 0.18
505 0.16
506 0.24
507 0.22
508 0.25
509 0.22
510 0.22
511 0.22
512 0.23
513 0.25
514 0.19
515 0.19
516 0.17
517 0.24
518 0.26
519 0.25
520 0.25
521 0.23
522 0.21
523 0.21
524 0.2
525 0.14
526 0.12
527 0.12
528 0.14
529 0.13
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.1
534 0.1
535 0.11
536 0.11
537 0.17
538 0.24
539 0.26
540 0.29
541 0.33
542 0.36
543 0.42
544 0.48
545 0.45
546 0.41
547 0.49
548 0.51
549 0.49
550 0.47
551 0.43
552 0.42
553 0.44
554 0.46
555 0.43
556 0.48
557 0.54
558 0.63