Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8QDQ0

Protein Details
Accession D8QDQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-53APKLKFVPTLPARRKPQPQDAQVKQEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-84RGRGRGRGRGRGRGDGGPR
200-210EREAKAKVKKE
Subcellular Location(s) mito 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG scm:SCHCO_02637252  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSGQNPPPKAISSLAKPAPSQTTRQGAPKLKFVPTLPARRKPQPQDAQVKQEPSTSAIPADNAGERGRGRGRGRGRGRGDGGPRPPIEMTASGPFAMGPAMTSVRRAAPATTIVPNRPVGALGAGLVPVKQEPTPISLSAKGKGRARESLSETPAPSEASKKEEDDDHEVYSDPDEGVEIVDMDDVKTLDYMAPDSIRREREAKAKVKKEKQEEKETSVTPPIDASNALDLSESEDEEELEDIVEDFTFKADVADGTPAFQDRLYFFQLPHPFPVLVQPTPIDGMDVDEMSAPNSRHVSFAPDVKPAAVPASGVTVKKEPGVKKEPADCVLDGTERLDGVIGTLLVRQSGRIQMELGNGAIYDVTPSTQPSFHQAAVHVVYPEVPKPAAPGQATEGTPPIEPPKPTALTTLGPVTRHFSVTPSIDQLLGALERKDHEQQGALRIRGLPEGAEAGMIRME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.44
3 0.43
4 0.44
5 0.48
6 0.45
7 0.44
8 0.42
9 0.45
10 0.45
11 0.52
12 0.57
13 0.56
14 0.57
15 0.61
16 0.58
17 0.54
18 0.55
19 0.49
20 0.51
21 0.51
22 0.59
23 0.58
24 0.63
25 0.67
26 0.71
27 0.8
28 0.78
29 0.8
30 0.79
31 0.8
32 0.81
33 0.81
34 0.82
35 0.77
36 0.72
37 0.62
38 0.56
39 0.47
40 0.41
41 0.37
42 0.28
43 0.25
44 0.21
45 0.21
46 0.18
47 0.19
48 0.16
49 0.16
50 0.15
51 0.17
52 0.16
53 0.21
54 0.24
55 0.29
56 0.3
57 0.37
58 0.44
59 0.5
60 0.57
61 0.62
62 0.63
63 0.63
64 0.65
65 0.63
66 0.62
67 0.59
68 0.57
69 0.54
70 0.5
71 0.45
72 0.41
73 0.35
74 0.32
75 0.25
76 0.24
77 0.2
78 0.21
79 0.18
80 0.18
81 0.16
82 0.13
83 0.12
84 0.08
85 0.05
86 0.06
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.13
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.18
97 0.19
98 0.24
99 0.26
100 0.25
101 0.27
102 0.27
103 0.26
104 0.22
105 0.2
106 0.14
107 0.12
108 0.1
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.06
118 0.08
119 0.09
120 0.13
121 0.15
122 0.16
123 0.19
124 0.23
125 0.25
126 0.28
127 0.32
128 0.33
129 0.35
130 0.39
131 0.4
132 0.41
133 0.43
134 0.45
135 0.47
136 0.48
137 0.48
138 0.45
139 0.42
140 0.37
141 0.33
142 0.28
143 0.22
144 0.19
145 0.16
146 0.18
147 0.19
148 0.19
149 0.2
150 0.21
151 0.25
152 0.27
153 0.28
154 0.24
155 0.23
156 0.22
157 0.21
158 0.19
159 0.16
160 0.09
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.11
183 0.16
184 0.17
185 0.18
186 0.2
187 0.22
188 0.29
189 0.37
190 0.43
191 0.48
192 0.55
193 0.62
194 0.68
195 0.72
196 0.74
197 0.76
198 0.74
199 0.75
200 0.7
201 0.66
202 0.63
203 0.56
204 0.48
205 0.41
206 0.34
207 0.24
208 0.21
209 0.15
210 0.11
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.1
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.22
255 0.28
256 0.28
257 0.29
258 0.28
259 0.23
260 0.23
261 0.28
262 0.25
263 0.19
264 0.19
265 0.17
266 0.15
267 0.16
268 0.16
269 0.11
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.11
279 0.09
280 0.1
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.19
286 0.17
287 0.24
288 0.24
289 0.24
290 0.24
291 0.23
292 0.23
293 0.18
294 0.17
295 0.11
296 0.09
297 0.07
298 0.11
299 0.13
300 0.13
301 0.15
302 0.15
303 0.16
304 0.19
305 0.25
306 0.23
307 0.29
308 0.35
309 0.37
310 0.41
311 0.46
312 0.47
313 0.44
314 0.44
315 0.36
316 0.31
317 0.29
318 0.25
319 0.19
320 0.16
321 0.13
322 0.1
323 0.1
324 0.08
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.15
337 0.16
338 0.15
339 0.16
340 0.17
341 0.2
342 0.2
343 0.18
344 0.12
345 0.11
346 0.1
347 0.09
348 0.07
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.08
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.17
358 0.21
359 0.21
360 0.23
361 0.22
362 0.25
363 0.26
364 0.27
365 0.21
366 0.17
367 0.18
368 0.18
369 0.19
370 0.16
371 0.14
372 0.13
373 0.16
374 0.2
375 0.24
376 0.23
377 0.23
378 0.25
379 0.31
380 0.31
381 0.28
382 0.26
383 0.22
384 0.21
385 0.21
386 0.22
387 0.22
388 0.22
389 0.25
390 0.31
391 0.32
392 0.33
393 0.35
394 0.33
395 0.3
396 0.32
397 0.34
398 0.29
399 0.27
400 0.28
401 0.29
402 0.27
403 0.28
404 0.25
405 0.21
406 0.24
407 0.27
408 0.29
409 0.28
410 0.27
411 0.25
412 0.24
413 0.22
414 0.19
415 0.17
416 0.16
417 0.13
418 0.14
419 0.15
420 0.2
421 0.25
422 0.25
423 0.25
424 0.29
425 0.32
426 0.4
427 0.46
428 0.42
429 0.4
430 0.39
431 0.39
432 0.35
433 0.32
434 0.23
435 0.17
436 0.18
437 0.15
438 0.14
439 0.13