Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8QHP4

Protein Details
Accession D8QHP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23QPAGCRRARAPRRLSTHNPPGPHydrophilic
334-356RLYSGKRRMFKGKKHERVAHIVRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
338-381GKRRMFKGKKHERVAHIVRGKRAVRMRDMAKRVREYKEFYRSRR
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 8, nucl 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037507  MrpL25  
IPR040922  MRPL25_dom  
Gene Ontology GO:0005762  C:mitochondrial large ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF18126  Mitoc_mL59  
Amino Acid Sequences MQPAGCRRARAPRRLSTHNPPGPPPTLQVSTSPAPPLGSRCSHKGAPTTADKGGRMGFLLQPGPAGAIGAYCSLVRVGKKRGMRNASYSPFGYRGNLAKRDHRPPNSSALATTPSPGRVLGLPTVMASREAAVRAVRTFRLHEIHGAKMALPRLGVDLTDAKQIDPELARRMNPQLLPNARALKPDVRQAQLQNPFLPNKHPVTGKWKGPKYSLRRQADLVKKAKAAGLLHLLPSGPKNPLPLEPKAVPAVQTKTPAASEAKADAPVEAADAAPTPTPAAAEAAPEEEAEPTPALPAREYRRRQRLALKDLSGEWTGDVHWVGEHRARDAPVARLYSGKRRMFKGKKHERVAHIVRGKRAVRMRDMAKRVREYKEFYRSRRPDPLAVPRNVKGKLPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.8
3 0.79
4 0.81
5 0.78
6 0.73
7 0.68
8 0.66
9 0.61
10 0.54
11 0.47
12 0.43
13 0.39
14 0.36
15 0.35
16 0.34
17 0.33
18 0.33
19 0.31
20 0.26
21 0.24
22 0.24
23 0.26
24 0.26
25 0.3
26 0.32
27 0.35
28 0.41
29 0.42
30 0.45
31 0.47
32 0.45
33 0.45
34 0.47
35 0.46
36 0.45
37 0.45
38 0.42
39 0.38
40 0.35
41 0.29
42 0.23
43 0.21
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.11
52 0.1
53 0.06
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.1
62 0.13
63 0.18
64 0.24
65 0.3
66 0.37
67 0.44
68 0.53
69 0.58
70 0.58
71 0.6
72 0.63
73 0.6
74 0.57
75 0.51
76 0.44
77 0.39
78 0.36
79 0.3
80 0.24
81 0.27
82 0.31
83 0.37
84 0.38
85 0.44
86 0.5
87 0.58
88 0.64
89 0.64
90 0.62
91 0.58
92 0.62
93 0.58
94 0.51
95 0.42
96 0.35
97 0.31
98 0.26
99 0.25
100 0.18
101 0.15
102 0.15
103 0.14
104 0.13
105 0.11
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.11
113 0.1
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.14
123 0.15
124 0.15
125 0.17
126 0.2
127 0.22
128 0.21
129 0.26
130 0.27
131 0.26
132 0.26
133 0.24
134 0.21
135 0.21
136 0.22
137 0.16
138 0.13
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.15
155 0.16
156 0.17
157 0.18
158 0.21
159 0.23
160 0.23
161 0.23
162 0.26
163 0.27
164 0.28
165 0.29
166 0.32
167 0.28
168 0.28
169 0.28
170 0.26
171 0.25
172 0.3
173 0.3
174 0.27
175 0.29
176 0.3
177 0.36
178 0.37
179 0.37
180 0.32
181 0.31
182 0.3
183 0.28
184 0.29
185 0.25
186 0.2
187 0.22
188 0.21
189 0.2
190 0.27
191 0.33
192 0.37
193 0.41
194 0.43
195 0.42
196 0.46
197 0.53
198 0.53
199 0.57
200 0.6
201 0.56
202 0.54
203 0.55
204 0.58
205 0.58
206 0.59
207 0.53
208 0.45
209 0.42
210 0.4
211 0.38
212 0.33
213 0.25
214 0.18
215 0.19
216 0.17
217 0.16
218 0.16
219 0.15
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.1
224 0.1
225 0.12
226 0.13
227 0.19
228 0.24
229 0.24
230 0.28
231 0.27
232 0.29
233 0.29
234 0.27
235 0.24
236 0.23
237 0.25
238 0.22
239 0.24
240 0.22
241 0.21
242 0.21
243 0.21
244 0.18
245 0.16
246 0.15
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.07
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.08
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.17
284 0.23
285 0.33
286 0.4
287 0.49
288 0.58
289 0.62
290 0.66
291 0.7
292 0.72
293 0.71
294 0.72
295 0.64
296 0.56
297 0.52
298 0.51
299 0.41
300 0.32
301 0.23
302 0.15
303 0.13
304 0.12
305 0.11
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.11
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.2
314 0.21
315 0.24
316 0.26
317 0.29
318 0.29
319 0.31
320 0.29
321 0.31
322 0.34
323 0.4
324 0.47
325 0.48
326 0.48
327 0.52
328 0.62
329 0.67
330 0.73
331 0.74
332 0.76
333 0.79
334 0.84
335 0.87
336 0.82
337 0.83
338 0.8
339 0.79
340 0.75
341 0.7
342 0.65
343 0.65
344 0.6
345 0.58
346 0.58
347 0.54
348 0.53
349 0.57
350 0.6
351 0.61
352 0.68
353 0.69
354 0.7
355 0.72
356 0.72
357 0.71
358 0.69
359 0.67
360 0.68
361 0.71
362 0.71
363 0.69
364 0.74
365 0.73
366 0.75
367 0.78
368 0.74
369 0.71
370 0.71
371 0.75
372 0.74
373 0.74
374 0.73
375 0.67
376 0.69
377 0.63