Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PPC1

Protein Details
Accession D8PPC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-66VNGPVRKQQKFQKQQHQQKHPKSKHGGRATGHydrophilic
372-391SSRSRSRTPEASSRKRKAEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
376-389RSRTPEASSRKRKA
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045154  PCF11-like  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0006369  P:termination of RNA polymerase II transcription  
Amino Acid Sequences MASYIYGQPAGSAPFQHVAQRGPGHVSKHQRPPGFVNGPVRKQQKFQKQQHQQKHPKSKHGGRATGLNPWMVLNEIEHAIQQTQIHAQYNPFDIKAQNDYHVLCQLRAVVQAGVAPGDLQAIHTQLRTLVAPRVPAPPVWSSQPPPSAPVPVQYPPVVNQPVPAPQSLSLQNALLGLVRSGVIGTSNQQGSSSSVKPESTGTRMDVDDGPEVSESGKYRRKIMRQKVSLRDIGHSSGSPRNVLESLFYDNLPVQCRQCAQRFPDSTEGKQAHQKHLDMHFRQNRQHMSNEGRGFSRSLYVDREDWVTSVDPKGKQRALEQERESKAEAARRKEETEFLEDEEEWVWTNAVKDGETLYHATCHAELHTKTRASSRSRSRTPEASSRKRKAEDGGHDIARPSKRISL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.24
4 0.24
5 0.24
6 0.29
7 0.31
8 0.3
9 0.33
10 0.36
11 0.36
12 0.41
13 0.49
14 0.51
15 0.59
16 0.65
17 0.63
18 0.63
19 0.64
20 0.67
21 0.62
22 0.59
23 0.59
24 0.6
25 0.61
26 0.66
27 0.66
28 0.58
29 0.6
30 0.65
31 0.65
32 0.68
33 0.73
34 0.75
35 0.8
36 0.88
37 0.92
38 0.93
39 0.93
40 0.93
41 0.94
42 0.9
43 0.89
44 0.89
45 0.87
46 0.86
47 0.85
48 0.8
49 0.7
50 0.71
51 0.62
52 0.59
53 0.51
54 0.41
55 0.32
56 0.26
57 0.24
58 0.17
59 0.16
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.1
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.14
71 0.16
72 0.18
73 0.18
74 0.19
75 0.2
76 0.24
77 0.24
78 0.21
79 0.2
80 0.19
81 0.21
82 0.25
83 0.24
84 0.22
85 0.23
86 0.23
87 0.24
88 0.28
89 0.26
90 0.2
91 0.19
92 0.18
93 0.17
94 0.17
95 0.16
96 0.11
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.1
114 0.09
115 0.11
116 0.14
117 0.14
118 0.16
119 0.17
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.21
124 0.19
125 0.2
126 0.22
127 0.23
128 0.23
129 0.27
130 0.31
131 0.28
132 0.29
133 0.28
134 0.28
135 0.25
136 0.24
137 0.24
138 0.21
139 0.23
140 0.2
141 0.2
142 0.18
143 0.24
144 0.24
145 0.19
146 0.19
147 0.18
148 0.22
149 0.22
150 0.21
151 0.16
152 0.15
153 0.18
154 0.18
155 0.19
156 0.15
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.09
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.06
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.12
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.17
185 0.17
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.15
193 0.15
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.13
203 0.19
204 0.19
205 0.26
206 0.32
207 0.41
208 0.5
209 0.59
210 0.64
211 0.67
212 0.75
213 0.76
214 0.75
215 0.7
216 0.61
217 0.53
218 0.44
219 0.37
220 0.29
221 0.22
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.17
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.11
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.14
237 0.16
238 0.17
239 0.17
240 0.14
241 0.15
242 0.17
243 0.21
244 0.25
245 0.29
246 0.31
247 0.39
248 0.4
249 0.43
250 0.5
251 0.49
252 0.45
253 0.47
254 0.45
255 0.37
256 0.42
257 0.42
258 0.4
259 0.41
260 0.41
261 0.39
262 0.45
263 0.53
264 0.48
265 0.55
266 0.55
267 0.55
268 0.59
269 0.6
270 0.58
271 0.51
272 0.52
273 0.47
274 0.46
275 0.49
276 0.47
277 0.42
278 0.37
279 0.35
280 0.32
281 0.27
282 0.24
283 0.18
284 0.17
285 0.19
286 0.21
287 0.21
288 0.21
289 0.23
290 0.19
291 0.18
292 0.18
293 0.16
294 0.15
295 0.18
296 0.22
297 0.24
298 0.28
299 0.35
300 0.36
301 0.36
302 0.4
303 0.47
304 0.48
305 0.53
306 0.54
307 0.56
308 0.56
309 0.57
310 0.53
311 0.45
312 0.42
313 0.4
314 0.42
315 0.4
316 0.43
317 0.44
318 0.46
319 0.45
320 0.46
321 0.43
322 0.42
323 0.37
324 0.32
325 0.31
326 0.28
327 0.27
328 0.22
329 0.18
330 0.13
331 0.12
332 0.1
333 0.08
334 0.1
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.13
340 0.14
341 0.15
342 0.17
343 0.14
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.21
351 0.21
352 0.25
353 0.32
354 0.32
355 0.34
356 0.4
357 0.45
358 0.44
359 0.52
360 0.58
361 0.61
362 0.67
363 0.73
364 0.73
365 0.73
366 0.74
367 0.75
368 0.74
369 0.75
370 0.78
371 0.79
372 0.81
373 0.77
374 0.74
375 0.71
376 0.71
377 0.69
378 0.66
379 0.65
380 0.58
381 0.55
382 0.53
383 0.52
384 0.46
385 0.4