FuNGI

D8QH08

Protein Details

Accession

D8QH08

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
408-437	PDLVLVKKAYPNRRKKNRARNWRLRSIGKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
415-434	KAYPNRRKKNRARNWRLRSI

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, nucl 11, cyto_mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
KEGG	scm:SCHCO_02640420 -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MEFVPAPPVHRVLCADCGTPIVPNSANLCVACLRNTVDITEGIPKQASVAFCRNCERFLNPPQNWTIARPESSELLSICLRKLKGLNKVRLTDAHFIWTEPHSKRLRVSITIQKEVLTNTILEQTFEIEYLVQYGQCPDCARLAAKDTWKALVQVRQKVPHKRTFLYLEQLILKHNAQKDTISVKEVRDGLDFFYSNRAHALKMVEFLNGVVPIRSKSSERLLSSDTHTNTANFKHTYSVEIVPVCKEDLVCIPQKQARSLGNLNPLALCIRVGSSLQLLDVATLQTADIPAQVYWRAPFESLASVPDLVEFTVLDVEPDYSRAKGRLVPADAQVALSGAFRSKASGGHSSSDMDMDFDDAGSTSQIFHTRTHLGGILQPGDAALGYFLTSANFNSDDFAALPAERIPDLVLVKKAYPNRRKKNRARNWRLRSIGKEAGEEGETGAGRGVVGRMGGRDQKKVDEDYELFLRELEEDPELRATVNLYKAGDVKMSDGAARPAGAGKKRAQFAMEVDEAGQDIETEAEDEPDFPDVKLDELLEGFDEMTLNENDVAAVVS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.29
3	0.26
4	0.28
5	0.25
6	0.24
7	0.22
8	0.19
9	0.17
10	0.19
11	0.22
12	0.22
13	0.24
14	0.21
15	0.22
16	0.21
17	0.22
18	0.21
19	0.2
20	0.2
21	0.22
22	0.23
23	0.22
24	0.2
25	0.19
26	0.2
27	0.25
28	0.23
29	0.2
30	0.2
31	0.19
32	0.18
33	0.21
34	0.21
35	0.2
36	0.29
37	0.3
38	0.34
39	0.41
40	0.41
41	0.41
42	0.42
43	0.41
44	0.4
45	0.47
46	0.54
47	0.49
48	0.52
49	0.52
50	0.54
51	0.51
52	0.46
53	0.44
54	0.38
55	0.38
56	0.35
57	0.35
58	0.31
59	0.31
60	0.31
61	0.22
62	0.21
63	0.22
64	0.21
65	0.2
66	0.23
67	0.22
68	0.23
69	0.29
70	0.33
71	0.4
72	0.49
73	0.57
74	0.59
75	0.62
76	0.61
77	0.6
78	0.59
79	0.54
80	0.45
81	0.41
82	0.34
83	0.31
84	0.3
85	0.28
86	0.3
87	0.26
88	0.33
89	0.32
90	0.34
91	0.37
92	0.42
93	0.44
94	0.4
95	0.46
96	0.47
97	0.5
98	0.52
99	0.49
100	0.43
101	0.39
102	0.36
103	0.3
104	0.22
105	0.15
106	0.11
107	0.17
108	0.16
109	0.16
110	0.15
111	0.15
112	0.14
113	0.14
114	0.13
115	0.07
116	0.07
117	0.09
118	0.09
119	0.07
120	0.07
121	0.1
122	0.1
123	0.12
124	0.14
125	0.13
126	0.14
127	0.16
128	0.17
129	0.16
130	0.21
131	0.24
132	0.27
133	0.3
134	0.29
135	0.3
136	0.29
137	0.3
138	0.29
139	0.31
140	0.34
141	0.38
142	0.42
143	0.49
144	0.55
145	0.63
146	0.66
147	0.67
148	0.66
149	0.59
150	0.59
151	0.57
152	0.54
153	0.5
154	0.43
155	0.37
156	0.34
157	0.33
158	0.29
159	0.25
160	0.22
161	0.2
162	0.22
163	0.22
164	0.2
165	0.2
166	0.22
167	0.24
168	0.25
169	0.24
170	0.22
171	0.21
172	0.25
173	0.25
174	0.23
175	0.2
176	0.19
177	0.17
178	0.18
179	0.18
180	0.14
181	0.2
182	0.19
183	0.17
184	0.19
185	0.18
186	0.15
187	0.17
188	0.2
189	0.14
190	0.16
191	0.17
192	0.14
193	0.14
194	0.13
195	0.12
196	0.1
197	0.09
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.1
202	0.11
203	0.11
204	0.14
205	0.2
206	0.25
207	0.26
208	0.28
209	0.28
210	0.28
211	0.3
212	0.34
213	0.28
214	0.24
215	0.23
216	0.21
217	0.22
218	0.21
219	0.22
220	0.17
221	0.17
222	0.18
223	0.18
224	0.19
225	0.2
226	0.19
227	0.17
228	0.17
229	0.17
230	0.15
231	0.15
232	0.13
233	0.1
234	0.09
235	0.07
236	0.09
237	0.12
238	0.14
239	0.15
240	0.17
241	0.19
242	0.21
243	0.21
244	0.23
245	0.21
246	0.23
247	0.26
248	0.27
249	0.31
250	0.31
251	0.29
252	0.25
253	0.23
254	0.18
255	0.15
256	0.12
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.03
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.04
278	0.04
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.1
292	0.09
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.05
297	0.05
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.09
310	0.1
311	0.11
312	0.13
313	0.17
314	0.21
315	0.23
316	0.24
317	0.24
318	0.25
319	0.24
320	0.21
321	0.17
322	0.12
323	0.09
324	0.07
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.07
331	0.09
332	0.12
333	0.17
334	0.18
335	0.19
336	0.2
337	0.2
338	0.2
339	0.19
340	0.15
341	0.1
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.06
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.06
353	0.09
354	0.11
355	0.12
356	0.15
357	0.17
358	0.17
359	0.18
360	0.18
361	0.15
362	0.16
363	0.18
364	0.15
365	0.13
366	0.12
367	0.11
368	0.1
369	0.09
370	0.06
371	0.04
372	0.03
373	0.03
374	0.03
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.07
380	0.08
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.09
388	0.08
389	0.09
390	0.08
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.07
395	0.1
396	0.11
397	0.13
398	0.15
399	0.15
400	0.17
401	0.22
402	0.28
403	0.36
404	0.45
405	0.54
406	0.62
407	0.72
408	0.82
409	0.87
410	0.92
411	0.92
412	0.94
413	0.94
414	0.94
415	0.92
416	0.91
417	0.87
418	0.82
419	0.76
420	0.72
421	0.68
422	0.58
423	0.51
424	0.42
425	0.37
426	0.31
427	0.26
428	0.18
429	0.14
430	0.12
431	0.11
432	0.1
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.05
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.11
442	0.19
443	0.21
444	0.26
445	0.28
446	0.32
447	0.36
448	0.38
449	0.35
450	0.35
451	0.34
452	0.33
453	0.34
454	0.3
455	0.26
456	0.23
457	0.22
458	0.17
459	0.17
460	0.14
461	0.13
462	0.12
463	0.14
464	0.15
465	0.15
466	0.13
467	0.12
468	0.13
469	0.15
470	0.17
471	0.19
472	0.18
473	0.2
474	0.22
475	0.22
476	0.22
477	0.18
478	0.18
479	0.17
480	0.17
481	0.17
482	0.16
483	0.17
484	0.16
485	0.16
486	0.14
487	0.17
488	0.22
489	0.25
490	0.29
491	0.34
492	0.4
493	0.43
494	0.44
495	0.41
496	0.37
497	0.36
498	0.38
499	0.32
500	0.25
501	0.23
502	0.21
503	0.2
504	0.18
505	0.14
506	0.07
507	0.06
508	0.06
509	0.05
510	0.06
511	0.06
512	0.08
513	0.09
514	0.09
515	0.1
516	0.12
517	0.13
518	0.12
519	0.15
520	0.13
521	0.15
522	0.16
523	0.15
524	0.14
525	0.13
526	0.14
527	0.12
528	0.12
529	0.1
530	0.09
531	0.09
532	0.07
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.11
537	0.11
538	0.1

D8QH08

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer