Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8Q1W6

Protein Details
Accession D8Q1W6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-38NGTRPAKKARIAPKKALKGRARSPPPKGKAPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-55RPAKKARIAPKKALKGRARSPPPKGKAPLAREEKQQPPTKYKGKAK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 7, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG scm:SCHCO_02536868  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MGLLTENGTRPAKKARIAPKKALKGRARSPPPKGKAPLAREEKQQPPTKYKGKAKAMTTDEAAPPPLPTSFKVVAGSYEKLLYGLEGTVSLADSGSSSADPESSTKKYKFDLKPLFIFPAHVSCIKAVAASPQGGKWLATGSADEIIKVWDLRRRKEIGGLMHHEGSVTHLSFPSRSHLLSASEDGTLALFRSRDWVVLRALRGHKGRVNSVAAHPSGKVALSVGKDRTLRMWDLMRGKGRASTKMGKEGEVVRWSIDGKLFIVQSGSDINVYTLDMTLIHTIHHPSRVHDVHFCTRVHGEGEVLLVGAEDKTLSIYSISSNPDSRPKIVAKMVGHANRVKAFQTLALALPDGTQTTVVCTVSSDGKLHAYDLGELPAPSTKSRKDTEDDAVLEIEPSGTYDSKGTRFTCVTVADGDAEGSVAALVGKRKRAEREDEGREGGQDEEESGDSEGAEDKDAEEWAPMEEEGAGWSEEEGESEEEGESEEEEEGEEEVESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.55
3 0.62
4 0.7
5 0.77
6 0.77
7 0.82
8 0.84
9 0.86
10 0.83
11 0.81
12 0.82
13 0.82
14 0.82
15 0.81
16 0.83
17 0.83
18 0.82
19 0.82
20 0.78
21 0.77
22 0.76
23 0.73
24 0.74
25 0.71
26 0.69
27 0.68
28 0.71
29 0.69
30 0.69
31 0.71
32 0.67
33 0.66
34 0.71
35 0.71
36 0.73
37 0.74
38 0.75
39 0.76
40 0.78
41 0.74
42 0.74
43 0.71
44 0.65
45 0.58
46 0.52
47 0.44
48 0.38
49 0.36
50 0.27
51 0.22
52 0.2
53 0.19
54 0.17
55 0.16
56 0.22
57 0.22
58 0.24
59 0.25
60 0.24
61 0.26
62 0.29
63 0.29
64 0.23
65 0.22
66 0.19
67 0.17
68 0.17
69 0.13
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.1
89 0.15
90 0.19
91 0.26
92 0.27
93 0.3
94 0.34
95 0.43
96 0.47
97 0.53
98 0.58
99 0.57
100 0.6
101 0.59
102 0.59
103 0.49
104 0.45
105 0.36
106 0.3
107 0.26
108 0.23
109 0.21
110 0.17
111 0.18
112 0.16
113 0.14
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.14
118 0.15
119 0.13
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.14
138 0.19
139 0.23
140 0.3
141 0.33
142 0.33
143 0.39
144 0.42
145 0.42
146 0.45
147 0.45
148 0.42
149 0.38
150 0.37
151 0.31
152 0.26
153 0.22
154 0.18
155 0.13
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.15
162 0.14
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.17
167 0.18
168 0.19
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.11
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.13
183 0.15
184 0.17
185 0.2
186 0.21
187 0.24
188 0.25
189 0.29
190 0.29
191 0.3
192 0.3
193 0.29
194 0.31
195 0.28
196 0.29
197 0.25
198 0.25
199 0.26
200 0.23
201 0.21
202 0.19
203 0.15
204 0.14
205 0.12
206 0.09
207 0.06
208 0.08
209 0.09
210 0.12
211 0.13
212 0.16
213 0.17
214 0.17
215 0.19
216 0.19
217 0.18
218 0.17
219 0.18
220 0.19
221 0.22
222 0.26
223 0.27
224 0.25
225 0.25
226 0.27
227 0.27
228 0.26
229 0.27
230 0.29
231 0.28
232 0.36
233 0.36
234 0.32
235 0.32
236 0.31
237 0.29
238 0.24
239 0.23
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.12
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.09
270 0.1
271 0.16
272 0.15
273 0.16
274 0.24
275 0.25
276 0.26
277 0.28
278 0.32
279 0.31
280 0.35
281 0.34
282 0.28
283 0.27
284 0.26
285 0.23
286 0.18
287 0.13
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.06
305 0.1
306 0.12
307 0.13
308 0.15
309 0.16
310 0.24
311 0.26
312 0.26
313 0.28
314 0.27
315 0.3
316 0.31
317 0.35
318 0.28
319 0.31
320 0.37
321 0.35
322 0.37
323 0.35
324 0.35
325 0.31
326 0.31
327 0.27
328 0.21
329 0.18
330 0.16
331 0.15
332 0.14
333 0.12
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.09
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.07
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.12
350 0.14
351 0.13
352 0.12
353 0.14
354 0.14
355 0.14
356 0.15
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.14
366 0.14
367 0.18
368 0.21
369 0.26
370 0.29
371 0.33
372 0.34
373 0.37
374 0.41
375 0.43
376 0.4
377 0.36
378 0.33
379 0.29
380 0.25
381 0.19
382 0.14
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.11
389 0.14
390 0.16
391 0.22
392 0.22
393 0.25
394 0.25
395 0.26
396 0.28
397 0.26
398 0.24
399 0.2
400 0.2
401 0.17
402 0.15
403 0.14
404 0.1
405 0.09
406 0.07
407 0.06
408 0.05
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.11
413 0.14
414 0.2
415 0.24
416 0.29
417 0.37
418 0.44
419 0.51
420 0.55
421 0.62
422 0.64
423 0.65
424 0.64
425 0.56
426 0.51
427 0.43
428 0.34
429 0.25
430 0.17
431 0.13
432 0.12
433 0.11
434 0.12
435 0.11
436 0.11
437 0.09
438 0.1
439 0.12
440 0.11
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.11
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.09
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.11
470 0.11
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.08
478 0.08