Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8QDQ1

Protein Details
Accession D8QDQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MAPTRSKQPKSQSKGTKAKGAAHydrophilic
73-96YLDARRERSHQRKRSVNHIPRPPNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11, cyto_nucl 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG scm:SCHCO_02058879  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MAPTRSKQPKSQSKGTKAKGAAGGTQTVWKATIVANGPSDFAFTENVTPQSYSSDAAWTQYKFEPYSRDAREYLDARRERSHQRKRSVNHIPRPPNAFIIFRSSFIKAHKVSKAIENSHANLSKIVAAAWKQLPPAERTYWYSRAADATKEHHLRFPDYQFQPRHLPSYIGGKRQVRDMAPIDEERIQKITELIAEGLTDDALDKELQAWESSRVKPAVTRFEPPVTASAFRRSSSAPPEETEHIRRSNEFLQLPDPIRRPSTVEPEDRSAVARFPPVPKPQSFGGQDQPDPQISFAGFSFTNTCAAPKVVEVDPLTPVAPNENVSLSRAPATPYSPRCATASSPISLPSPAEYSPGPPQDMSSPIAPPSPCYDASSPAYDASSPAYAPMAPYPTPSPASYMAPSPAAQPPYNTKMPAGPTYAMPTPVYAAPSPYGQLTIDTSVGAPEYNASGMYYPTPVTASDMNNNGGYQNFNAAPPTNCSDNGAASYPTPCDLPSPADYGSTYMGSPAAYGTEYVHQPAEYGQQPAVYGQGMMVGEGTMAGAGTMGGVSEGGVADDWWNAPTDVPDKTFLSGPDFLGGEAVDMTPMPMGFGAYDQIYANEFQSLVPDQQFDGVKAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.84
3 0.82
4 0.73
5 0.71
6 0.66
7 0.58
8 0.52
9 0.45
10 0.42
11 0.34
12 0.36
13 0.3
14 0.25
15 0.23
16 0.18
17 0.16
18 0.15
19 0.2
20 0.18
21 0.21
22 0.24
23 0.23
24 0.24
25 0.23
26 0.23
27 0.17
28 0.15
29 0.13
30 0.11
31 0.15
32 0.17
33 0.19
34 0.19
35 0.2
36 0.19
37 0.21
38 0.21
39 0.18
40 0.16
41 0.18
42 0.17
43 0.2
44 0.24
45 0.21
46 0.24
47 0.26
48 0.3
49 0.28
50 0.3
51 0.33
52 0.33
53 0.42
54 0.43
55 0.44
56 0.41
57 0.42
58 0.46
59 0.44
60 0.46
61 0.46
62 0.45
63 0.44
64 0.48
65 0.51
66 0.54
67 0.62
68 0.67
69 0.66
70 0.72
71 0.78
72 0.76
73 0.81
74 0.82
75 0.81
76 0.8
77 0.81
78 0.79
79 0.76
80 0.78
81 0.7
82 0.64
83 0.56
84 0.49
85 0.4
86 0.4
87 0.35
88 0.3
89 0.31
90 0.28
91 0.28
92 0.29
93 0.35
94 0.3
95 0.36
96 0.39
97 0.39
98 0.4
99 0.45
100 0.5
101 0.45
102 0.49
103 0.47
104 0.45
105 0.48
106 0.49
107 0.41
108 0.34
109 0.31
110 0.25
111 0.21
112 0.19
113 0.14
114 0.12
115 0.18
116 0.2
117 0.2
118 0.19
119 0.21
120 0.24
121 0.24
122 0.29
123 0.27
124 0.27
125 0.31
126 0.37
127 0.4
128 0.4
129 0.38
130 0.34
131 0.35
132 0.34
133 0.31
134 0.27
135 0.27
136 0.32
137 0.36
138 0.36
139 0.35
140 0.35
141 0.37
142 0.39
143 0.4
144 0.41
145 0.4
146 0.48
147 0.46
148 0.48
149 0.51
150 0.47
151 0.46
152 0.37
153 0.35
154 0.28
155 0.37
156 0.38
157 0.35
158 0.4
159 0.4
160 0.4
161 0.43
162 0.46
163 0.35
164 0.36
165 0.35
166 0.31
167 0.3
168 0.3
169 0.28
170 0.29
171 0.29
172 0.25
173 0.23
174 0.19
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.1
179 0.11
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.13
198 0.18
199 0.19
200 0.22
201 0.22
202 0.22
203 0.24
204 0.28
205 0.33
206 0.31
207 0.33
208 0.32
209 0.34
210 0.34
211 0.31
212 0.29
213 0.22
214 0.22
215 0.2
216 0.23
217 0.23
218 0.23
219 0.24
220 0.23
221 0.24
222 0.28
223 0.3
224 0.25
225 0.25
226 0.28
227 0.29
228 0.32
229 0.32
230 0.3
231 0.29
232 0.29
233 0.28
234 0.29
235 0.29
236 0.31
237 0.27
238 0.24
239 0.23
240 0.26
241 0.27
242 0.28
243 0.26
244 0.23
245 0.23
246 0.22
247 0.25
248 0.25
249 0.32
250 0.32
251 0.34
252 0.35
253 0.37
254 0.37
255 0.33
256 0.31
257 0.23
258 0.18
259 0.15
260 0.15
261 0.13
262 0.16
263 0.22
264 0.26
265 0.29
266 0.29
267 0.31
268 0.3
269 0.35
270 0.34
271 0.31
272 0.32
273 0.3
274 0.3
275 0.29
276 0.29
277 0.24
278 0.21
279 0.19
280 0.13
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.09
285 0.07
286 0.08
287 0.1
288 0.09
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.07
296 0.1
297 0.09
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.13
303 0.13
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.13
320 0.18
321 0.2
322 0.24
323 0.23
324 0.24
325 0.24
326 0.24
327 0.23
328 0.24
329 0.24
330 0.21
331 0.2
332 0.2
333 0.2
334 0.18
335 0.17
336 0.11
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.12
342 0.16
343 0.18
344 0.18
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.19
349 0.18
350 0.14
351 0.13
352 0.13
353 0.16
354 0.15
355 0.15
356 0.16
357 0.17
358 0.17
359 0.19
360 0.2
361 0.21
362 0.23
363 0.24
364 0.21
365 0.19
366 0.18
367 0.15
368 0.14
369 0.12
370 0.1
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.12
380 0.13
381 0.15
382 0.17
383 0.17
384 0.18
385 0.17
386 0.2
387 0.19
388 0.19
389 0.17
390 0.16
391 0.17
392 0.16
393 0.18
394 0.19
395 0.18
396 0.19
397 0.23
398 0.28
399 0.3
400 0.28
401 0.25
402 0.25
403 0.28
404 0.29
405 0.26
406 0.21
407 0.2
408 0.23
409 0.24
410 0.22
411 0.18
412 0.16
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.12
417 0.13
418 0.12
419 0.13
420 0.13
421 0.11
422 0.11
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.11
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.08
447 0.11
448 0.14
449 0.15
450 0.19
451 0.21
452 0.22
453 0.22
454 0.22
455 0.19
456 0.16
457 0.15
458 0.12
459 0.13
460 0.12
461 0.12
462 0.14
463 0.15
464 0.16
465 0.19
466 0.22
467 0.21
468 0.2
469 0.23
470 0.22
471 0.21
472 0.22
473 0.19
474 0.16
475 0.15
476 0.16
477 0.14
478 0.14
479 0.13
480 0.11
481 0.11
482 0.12
483 0.16
484 0.17
485 0.19
486 0.19
487 0.2
488 0.2
489 0.19
490 0.19
491 0.16
492 0.13
493 0.1
494 0.11
495 0.09
496 0.09
497 0.08
498 0.07
499 0.06
500 0.07
501 0.08
502 0.12
503 0.13
504 0.14
505 0.15
506 0.14
507 0.14
508 0.15
509 0.19
510 0.17
511 0.18
512 0.17
513 0.17
514 0.18
515 0.17
516 0.17
517 0.12
518 0.09
519 0.07
520 0.1
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.02
533 0.03
534 0.03
535 0.02
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.05
544 0.05
545 0.06
546 0.07
547 0.07
548 0.09
549 0.09
550 0.09
551 0.12
552 0.15
553 0.17
554 0.19
555 0.22
556 0.22
557 0.23
558 0.26
559 0.23
560 0.26
561 0.26
562 0.24
563 0.23
564 0.22
565 0.2
566 0.18
567 0.17
568 0.12
569 0.1
570 0.09
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.07
575 0.07
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.09
582 0.08
583 0.1
584 0.1
585 0.11
586 0.12
587 0.13
588 0.13
589 0.12
590 0.12
591 0.1
592 0.14
593 0.16
594 0.18
595 0.18
596 0.19
597 0.18
598 0.23
599 0.25