Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PPM1

Protein Details
Accession D8PPM1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-161GENWYYFRAWKKTKQPKSLKWKMVIESHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 12, nucl 9.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR007810  Pep3_Vps18  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG scm:SCHCO_02684596  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05131  Pep3_Vps18  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
CDD cd16462  RING-H2_Pep3p-like  
Amino Acid Sequences MFDDFVEHAASPPGVAQAASALPSLQYEGFEPSPYAEDDDRAEIEETAQDAASVNEPIFELGRVQYTFPAPLVSFAVSSDMLVMALANNTLVLIELSHSEQVVQIPIPRKPQDMTIHKVFMDPSGRHIIVSSTQGENWYYFRAWKKTKQPKSLKWKMVIESIAWNRAALLASVNATTTREMLIGARNGTIYEAVLDAEENLFASLERHLASVYSVPGPITGIHFNVFPPQDPRKTWIVVTTPSRMYQFIGSPDRRSDDGSRAFAALFNTYRDNAPNIRELPGNIQHSELHLFTPNSGQAQSLPKTIAWLTGSGIFHGSVNFDSNTDDLVDGVKLPAYPIFSDTPPGQTDVPLSMAVTEFHFVLLYKDRIAAICSLDERLAYEEVMPVKPTEEVKGLAADPVRGTYWVYTDQSLFELGVGNDDRDVWKVFMKQGHFDVALRYVKTASQRDHVLSAQAAAYFAEGKYFQSAQCYAQCSVSFEEVALKFLDVNERDALRSYLISRLERTRKGDLTQRLMLSTWLVEFYLSKLNEMDDLIASESVSQDVENLKTERTILEDDLKHFFETYKTDLDTHTVYELIQGHGRTDMYLFYATTIGDFERVVQHWTLEEEWSRAIDVISRQSNLELYYRFSTVLMRNAPKETVDSWLKQPALDPLRLVPALLQVQHAPRDPLTPNQAVRYLTNLIYEEQNTNPTIHNLLITFYVSPTSSASTSTSAPSAEDDGPLLRYLSTAPTDPMTGKPYYDLDYALRLCKQSGRTQPCVHIYSQMGLWENSVDLALEKGDVELAKINADMPEDDEPLRKKLWLKIAQYVVQDKKDIKTAVQFLESTNILKIEDILPFFPDFVVIDDFKEEITHALEGYSAHIDQLKQEMDDATETADAIKQDIANLKNRFVTIGAGEACAQCGQLLLTRQFYVFPCHHSFHADCLIGLAKEYLPAHALRRMLALQNELVKGNPTANGAVRERQNTAPRTLLSANFANAVPNPARAANLLGRNILNAGDKLRDMIVPDALAAAVTAPVGWIPGMGGPGKKRSGADKVDENAKKARAELEELLASNCPLCESVIVGLDKGFIKEGELDTSWAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.09
5 0.1
6 0.11
7 0.1
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.12
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.16
16 0.17
17 0.18
18 0.18
19 0.17
20 0.19
21 0.19
22 0.22
23 0.18
24 0.19
25 0.2
26 0.23
27 0.22
28 0.22
29 0.22
30 0.18
31 0.18
32 0.18
33 0.16
34 0.13
35 0.13
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.11
41 0.1
42 0.09
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.19
53 0.2
54 0.21
55 0.2
56 0.22
57 0.17
58 0.18
59 0.19
60 0.17
61 0.15
62 0.14
63 0.16
64 0.13
65 0.13
66 0.11
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.07
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.11
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.17
92 0.21
93 0.25
94 0.34
95 0.35
96 0.37
97 0.36
98 0.43
99 0.48
100 0.5
101 0.54
102 0.52
103 0.53
104 0.5
105 0.5
106 0.42
107 0.37
108 0.37
109 0.3
110 0.28
111 0.33
112 0.33
113 0.31
114 0.31
115 0.28
116 0.24
117 0.27
118 0.25
119 0.19
120 0.19
121 0.21
122 0.22
123 0.21
124 0.2
125 0.2
126 0.17
127 0.21
128 0.28
129 0.36
130 0.42
131 0.5
132 0.59
133 0.67
134 0.76
135 0.81
136 0.85
137 0.86
138 0.9
139 0.91
140 0.89
141 0.85
142 0.82
143 0.74
144 0.69
145 0.61
146 0.51
147 0.49
148 0.45
149 0.41
150 0.34
151 0.3
152 0.24
153 0.24
154 0.23
155 0.14
156 0.12
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.14
170 0.16
171 0.17
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.1
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.11
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.22
216 0.28
217 0.32
218 0.34
219 0.38
220 0.37
221 0.38
222 0.37
223 0.37
224 0.34
225 0.35
226 0.37
227 0.38
228 0.35
229 0.35
230 0.36
231 0.3
232 0.27
233 0.24
234 0.22
235 0.24
236 0.31
237 0.31
238 0.33
239 0.35
240 0.37
241 0.35
242 0.37
243 0.33
244 0.33
245 0.36
246 0.36
247 0.34
248 0.32
249 0.31
250 0.28
251 0.26
252 0.21
253 0.16
254 0.15
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.17
259 0.2
260 0.19
261 0.21
262 0.25
263 0.24
264 0.25
265 0.25
266 0.25
267 0.27
268 0.32
269 0.32
270 0.27
271 0.27
272 0.25
273 0.26
274 0.27
275 0.21
276 0.16
277 0.16
278 0.16
279 0.15
280 0.18
281 0.17
282 0.16
283 0.16
284 0.15
285 0.14
286 0.2
287 0.21
288 0.2
289 0.2
290 0.18
291 0.21
292 0.2
293 0.2
294 0.15
295 0.14
296 0.13
297 0.17
298 0.18
299 0.16
300 0.16
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.07
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.11
326 0.13
327 0.13
328 0.16
329 0.16
330 0.18
331 0.17
332 0.19
333 0.16
334 0.14
335 0.15
336 0.13
337 0.14
338 0.11
339 0.1
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.06
349 0.08
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.15
357 0.14
358 0.1
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.09
368 0.08
369 0.1
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.1
374 0.1
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.13
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.08
390 0.09
391 0.07
392 0.09
393 0.12
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.1
401 0.07
402 0.08
403 0.07
404 0.09
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.08
413 0.1
414 0.12
415 0.15
416 0.19
417 0.2
418 0.21
419 0.21
420 0.23
421 0.21
422 0.2
423 0.18
424 0.19
425 0.2
426 0.18
427 0.17
428 0.15
429 0.16
430 0.21
431 0.25
432 0.22
433 0.23
434 0.25
435 0.25
436 0.27
437 0.25
438 0.21
439 0.16
440 0.15
441 0.12
442 0.1
443 0.09
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.11
455 0.13
456 0.14
457 0.17
458 0.19
459 0.18
460 0.19
461 0.2
462 0.19
463 0.19
464 0.18
465 0.14
466 0.11
467 0.15
468 0.13
469 0.14
470 0.12
471 0.1
472 0.09
473 0.1
474 0.14
475 0.1
476 0.12
477 0.13
478 0.13
479 0.14
480 0.14
481 0.15
482 0.11
483 0.11
484 0.09
485 0.12
486 0.14
487 0.15
488 0.16
489 0.23
490 0.28
491 0.32
492 0.35
493 0.35
494 0.35
495 0.36
496 0.41
497 0.39
498 0.4
499 0.39
500 0.35
501 0.31
502 0.29
503 0.27
504 0.2
505 0.15
506 0.09
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.12
513 0.11
514 0.12
515 0.11
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.11
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.05
532 0.06
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.1
538 0.09
539 0.1
540 0.11
541 0.1
542 0.14
543 0.15
544 0.17
545 0.2
546 0.2
547 0.18
548 0.17
549 0.16
550 0.12
551 0.13
552 0.14
553 0.13
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.16
558 0.15
559 0.13
560 0.1
561 0.09
562 0.08
563 0.1
564 0.1
565 0.09
566 0.11
567 0.1
568 0.1
569 0.11
570 0.11
571 0.09
572 0.08
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.07
579 0.07
580 0.06
581 0.07
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.06
586 0.07
587 0.08
588 0.1
589 0.09
590 0.09
591 0.09
592 0.11
593 0.11
594 0.1
595 0.1
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.13
605 0.14
606 0.15
607 0.15
608 0.15
609 0.15
610 0.15
611 0.16
612 0.11
613 0.13
614 0.14
615 0.14
616 0.14
617 0.14
618 0.16
619 0.15
620 0.2
621 0.22
622 0.22
623 0.23
624 0.24
625 0.25
626 0.22
627 0.21
628 0.17
629 0.18
630 0.19
631 0.19
632 0.2
633 0.25
634 0.24
635 0.22
636 0.22
637 0.24
638 0.25
639 0.23
640 0.22
641 0.17
642 0.2
643 0.2
644 0.19
645 0.12
646 0.12
647 0.13
648 0.13
649 0.13
650 0.12
651 0.14
652 0.16
653 0.17
654 0.14
655 0.13
656 0.17
657 0.17
658 0.2
659 0.24
660 0.25
661 0.26
662 0.26
663 0.29
664 0.26
665 0.25
666 0.25
667 0.22
668 0.18
669 0.18
670 0.17
671 0.15
672 0.16
673 0.16
674 0.15
675 0.13
676 0.15
677 0.14
678 0.14
679 0.14
680 0.13
681 0.13
682 0.12
683 0.12
684 0.1
685 0.1
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.07
690 0.08
691 0.07
692 0.08
693 0.08
694 0.09
695 0.08
696 0.09
697 0.11
698 0.12
699 0.12
700 0.13
701 0.13
702 0.11
703 0.11
704 0.11
705 0.13
706 0.12
707 0.11
708 0.1
709 0.1
710 0.11
711 0.11
712 0.1
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.09
717 0.1
718 0.1
719 0.1
720 0.11
721 0.12
722 0.13
723 0.14
724 0.16
725 0.15
726 0.14
727 0.15
728 0.16
729 0.18
730 0.18
731 0.17
732 0.14
733 0.18
734 0.19
735 0.2
736 0.2
737 0.17
738 0.17
739 0.2
740 0.23
741 0.27
742 0.36
743 0.41
744 0.46
745 0.49
746 0.53
747 0.55
748 0.54
749 0.46
750 0.4
751 0.34
752 0.28
753 0.26
754 0.23
755 0.19
756 0.16
757 0.16
758 0.12
759 0.11
760 0.09
761 0.08
762 0.06
763 0.04
764 0.05
765 0.04
766 0.04
767 0.04
768 0.04
769 0.05
770 0.05
771 0.06
772 0.08
773 0.08
774 0.09
775 0.09
776 0.09
777 0.09
778 0.1
779 0.09
780 0.1
781 0.12
782 0.13
783 0.14
784 0.18
785 0.19
786 0.21
787 0.22
788 0.22
789 0.23
790 0.27
791 0.37
792 0.41
793 0.42
794 0.47
795 0.52
796 0.53
797 0.53
798 0.54
799 0.48
800 0.42
801 0.41
802 0.35
803 0.32
804 0.34
805 0.32
806 0.25
807 0.28
808 0.31
809 0.3
810 0.3
811 0.29
812 0.23
813 0.26
814 0.25
815 0.2
816 0.16
817 0.14
818 0.12
819 0.11
820 0.12
821 0.1
822 0.12
823 0.12
824 0.12
825 0.13
826 0.13
827 0.13
828 0.12
829 0.11
830 0.08
831 0.09
832 0.12
833 0.11
834 0.11
835 0.12
836 0.12
837 0.12
838 0.12
839 0.1
840 0.07
841 0.09
842 0.09
843 0.08
844 0.08
845 0.08
846 0.08
847 0.1
848 0.11
849 0.09
850 0.09
851 0.11
852 0.11
853 0.12
854 0.17
855 0.16
856 0.14
857 0.15
858 0.15
859 0.14
860 0.15
861 0.14
862 0.1
863 0.09
864 0.09
865 0.09
866 0.1
867 0.09
868 0.09
869 0.1
870 0.09
871 0.11
872 0.17
873 0.2
874 0.27
875 0.29
876 0.3
877 0.31
878 0.31
879 0.29
880 0.24
881 0.23
882 0.15
883 0.18
884 0.16
885 0.15
886 0.16
887 0.15
888 0.15
889 0.14
890 0.13
891 0.08
892 0.07
893 0.07
894 0.09
895 0.15
896 0.16
897 0.19
898 0.2
899 0.2
900 0.23
901 0.23
902 0.26
903 0.23
904 0.27
905 0.3
906 0.31
907 0.32
908 0.35
909 0.35
910 0.33
911 0.38
912 0.31
913 0.26
914 0.25
915 0.26
916 0.2
917 0.2
918 0.17
919 0.1
920 0.13
921 0.14
922 0.13
923 0.13
924 0.15
925 0.17
926 0.2
927 0.21
928 0.18
929 0.2
930 0.22
931 0.24
932 0.25
933 0.25
934 0.24
935 0.27
936 0.28
937 0.25
938 0.24
939 0.21
940 0.2
941 0.19
942 0.17
943 0.15
944 0.16
945 0.19
946 0.24
947 0.24
948 0.3
949 0.33
950 0.35
951 0.37
952 0.41
953 0.47
954 0.45
955 0.46
956 0.45
957 0.4
958 0.43
959 0.42
960 0.37
961 0.33
962 0.32
963 0.29
964 0.26
965 0.25
966 0.21
967 0.19
968 0.22
969 0.18
970 0.17
971 0.19
972 0.17
973 0.18
974 0.17
975 0.21
976 0.22
977 0.27
978 0.27
979 0.28
980 0.27
981 0.27
982 0.27
983 0.24
984 0.2
985 0.16
986 0.16
987 0.16
988 0.16
989 0.17
990 0.17
991 0.17
992 0.16
993 0.17
994 0.17
995 0.15
996 0.15
997 0.13
998 0.12
999 0.11
1000 0.08
1001 0.06
1002 0.05
1003 0.04
1004 0.04
1005 0.04
1006 0.04
1007 0.04
1008 0.04
1009 0.04
1010 0.04
1011 0.06
1012 0.08
1013 0.1
1014 0.14
1015 0.18
1016 0.24
1017 0.27
1018 0.29
1019 0.3
1020 0.35
1021 0.42
1022 0.44
1023 0.47
1024 0.49
1025 0.51
1026 0.59
1027 0.59
1028 0.57
1029 0.54
1030 0.51
1031 0.46
1032 0.39
1033 0.4
1034 0.33
1035 0.37
1036 0.36
1037 0.34
1038 0.33
1039 0.33
1040 0.32
1041 0.27
1042 0.24
1043 0.19
1044 0.16
1045 0.12
1046 0.1
1047 0.1
1048 0.09
1049 0.1
1050 0.12
1051 0.17
1052 0.17
1053 0.17
1054 0.16
1055 0.18
1056 0.19
1057 0.18
1058 0.18
1059 0.12
1060 0.13
1061 0.17
1062 0.18
1063 0.2
1064 0.21