Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PLA1

Protein Details
Accession D8PLA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-267ATTVSSKRKKLSNSRKPRKKLHTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
251-266KRKKLSNSRKPRKKLH
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 9.5, nucl 8.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015886  DNA_glyclase/AP_lyase_DNA-bd  
IPR012319  FPG_cat  
IPR035937  MutM-like_N-ter  
IPR010979  Ribosomal_S13-like_H2TH  
Gene Ontology GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0019104  F:DNA N-glycosylase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
KEGG scm:SCHCO_02662471  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01149  Fapy_DNA_glyco  
PF06831  H2TH  
Amino Acid Sequences MTGMIQVKGSAATYYISSKRLVGDEWPPRFMKFILHFFDGTQLAFMDARRLGRIRLCADPLHETPISELGFDPILSMPSRQDFEKLMTRRKCPVKALLLDQSFSAGVGNWVADEILYHARVHPERRCNTLTGEELDGLHRWMGEVCRIAVEADADSEKFPEDWLFNHRWDKGKKNKPQTMTLPSGEPATIKWVTVGGRTSAYVDELQKAPGLPPNAVKTAGDYGEVLNDDAKSVLTELSDEPEPATTVSSKRKKLSNSRKPRKKLHT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.19
4 0.19
5 0.2
6 0.22
7 0.23
8 0.22
9 0.21
10 0.28
11 0.36
12 0.39
13 0.42
14 0.41
15 0.4
16 0.41
17 0.37
18 0.36
19 0.32
20 0.36
21 0.37
22 0.38
23 0.38
24 0.36
25 0.4
26 0.32
27 0.26
28 0.19
29 0.14
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.16
37 0.17
38 0.19
39 0.22
40 0.28
41 0.28
42 0.3
43 0.31
44 0.3
45 0.32
46 0.35
47 0.32
48 0.32
49 0.28
50 0.24
51 0.22
52 0.26
53 0.23
54 0.17
55 0.16
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.07
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.11
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.18
71 0.26
72 0.3
73 0.37
74 0.41
75 0.44
76 0.5
77 0.56
78 0.56
79 0.51
80 0.54
81 0.52
82 0.5
83 0.51
84 0.51
85 0.44
86 0.4
87 0.36
88 0.29
89 0.22
90 0.18
91 0.13
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.12
107 0.14
108 0.19
109 0.23
110 0.3
111 0.31
112 0.37
113 0.38
114 0.36
115 0.36
116 0.34
117 0.3
118 0.23
119 0.22
120 0.17
121 0.15
122 0.15
123 0.13
124 0.09
125 0.08
126 0.06
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.13
151 0.16
152 0.19
153 0.23
154 0.25
155 0.31
156 0.35
157 0.43
158 0.49
159 0.56
160 0.62
161 0.69
162 0.73
163 0.7
164 0.73
165 0.7
166 0.67
167 0.62
168 0.54
169 0.45
170 0.39
171 0.36
172 0.28
173 0.21
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.15
182 0.16
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.16
192 0.15
193 0.16
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.17
198 0.18
199 0.16
200 0.2
201 0.23
202 0.24
203 0.25
204 0.24
205 0.22
206 0.24
207 0.23
208 0.19
209 0.16
210 0.14
211 0.15
212 0.16
213 0.13
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.09
224 0.09
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.13
232 0.14
233 0.13
234 0.18
235 0.28
236 0.36
237 0.42
238 0.47
239 0.53
240 0.61
241 0.7
242 0.76
243 0.76
244 0.79
245 0.84
246 0.9
247 0.92