Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PXD3

Protein Details
Accession D8PXD3    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSLFKKKGPKPAFKPRLSEVHydrophilic
40-63PSAIATKLKKQAKKAKVKTPLSFGHydrophilic
71-92GTEFKVKKSKLSQKLSHGNKSAHydrophilic
435-461AKSDRQSRRTTRLTRRQRRHIRDTSIQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-10KKGPK
48-55KKQAKKAK
242-253GKKSRKAEAAKR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG scm:SCHCO_02491843  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MSLFKKKGPKPAFKPRLSEVAADDTVKTAGDEDGAGAESPSAIATKLKKQAKKAKVKTPLSFGAEEQESEGTEFKVKKSKLSQKLSHGNKSALPPNLDQASITPQSSAPKYDQNYLNELKANTPTARPTFAADVDPEMAMDVDSTDMAVSVIDVDALDEPVEPAPLIPTESTVKAAKERRERSRKTGQPADEDFISLSLVQRETEYQGPHPTSRLMREEDDLGEGDDEFAEYTSAKDRIALGKKSRKAEAAKRREDIQELIADAEEEDEEAMEWEQEQIRRGGQLPTDVPGKPAKAVYKPAPIPPSTPIPTLAPALARLTQQLSQLTASHASTTSALNAVARERDEIEEREKEMREMVERAEAKRAWFDEFREWVESVAGFLDEKYPALERVEEDQLVLLKERSGIIAKRRQEEDIDDLATFLGPIPQTTEEPSAKSDRQSRRTTRLTRRQRRHIRDTSIQNDEEGYSTDSSLPEEDANAYDDAVASLKKSRREVLADVRAEEFRDPGRGRWGSWREHYADTYVGAWGGLGVVSAWEFWVRLEMADWDPVENSRSLDAFKWYKGLYEYARPGEGEVESRDLGPDGDLVSSMITTAVIPRLAKVLEGGAFDAYSEKHVRRVIDLAEEVEASIEPDSIKLQILQKAVITVFQRAVASAEGLLVQYKAHGYSRPFDPEAIPARRRYIARHVKLLQNMLRWRRYTEERFGVGALVERLVEGVILYAAEGGWEVGGADLAGKVRDMLPKELVSAGLRARLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.75
3 0.75
4 0.67
5 0.6
6 0.52
7 0.49
8 0.44
9 0.38
10 0.34
11 0.26
12 0.23
13 0.2
14 0.17
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.1
31 0.15
32 0.23
33 0.32
34 0.41
35 0.46
36 0.56
37 0.66
38 0.73
39 0.8
40 0.81
41 0.82
42 0.84
43 0.88
44 0.83
45 0.8
46 0.77
47 0.7
48 0.63
49 0.53
50 0.48
51 0.41
52 0.35
53 0.29
54 0.22
55 0.18
56 0.17
57 0.18
58 0.12
59 0.17
60 0.18
61 0.19
62 0.28
63 0.28
64 0.35
65 0.44
66 0.54
67 0.59
68 0.67
69 0.72
70 0.73
71 0.82
72 0.83
73 0.81
74 0.75
75 0.67
76 0.61
77 0.6
78 0.57
79 0.52
80 0.47
81 0.39
82 0.41
83 0.4
84 0.35
85 0.3
86 0.24
87 0.26
88 0.24
89 0.23
90 0.19
91 0.18
92 0.24
93 0.25
94 0.27
95 0.23
96 0.28
97 0.31
98 0.38
99 0.43
100 0.41
101 0.47
102 0.46
103 0.46
104 0.42
105 0.4
106 0.34
107 0.31
108 0.31
109 0.26
110 0.26
111 0.29
112 0.28
113 0.3
114 0.28
115 0.28
116 0.28
117 0.27
118 0.27
119 0.22
120 0.22
121 0.2
122 0.19
123 0.15
124 0.12
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.07
155 0.1
156 0.12
157 0.13
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.24
162 0.3
163 0.36
164 0.44
165 0.52
166 0.6
167 0.69
168 0.73
169 0.74
170 0.79
171 0.78
172 0.77
173 0.77
174 0.7
175 0.67
176 0.65
177 0.6
178 0.49
179 0.42
180 0.33
181 0.25
182 0.21
183 0.13
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.11
190 0.13
191 0.17
192 0.18
193 0.18
194 0.24
195 0.27
196 0.27
197 0.27
198 0.28
199 0.27
200 0.3
201 0.32
202 0.29
203 0.28
204 0.29
205 0.3
206 0.26
207 0.25
208 0.2
209 0.16
210 0.13
211 0.11
212 0.09
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.12
225 0.2
226 0.26
227 0.32
228 0.37
229 0.46
230 0.51
231 0.54
232 0.55
233 0.53
234 0.53
235 0.58
236 0.6
237 0.61
238 0.62
239 0.61
240 0.62
241 0.58
242 0.53
243 0.44
244 0.36
245 0.27
246 0.21
247 0.19
248 0.15
249 0.13
250 0.1
251 0.09
252 0.06
253 0.04
254 0.04
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.14
269 0.15
270 0.14
271 0.16
272 0.15
273 0.17
274 0.19
275 0.18
276 0.19
277 0.19
278 0.18
279 0.16
280 0.18
281 0.19
282 0.19
283 0.25
284 0.27
285 0.33
286 0.34
287 0.37
288 0.38
289 0.35
290 0.34
291 0.31
292 0.34
293 0.28
294 0.27
295 0.24
296 0.21
297 0.22
298 0.21
299 0.19
300 0.12
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.11
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.13
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.12
333 0.14
334 0.17
335 0.18
336 0.19
337 0.22
338 0.21
339 0.2
340 0.18
341 0.17
342 0.15
343 0.14
344 0.13
345 0.16
346 0.17
347 0.18
348 0.21
349 0.21
350 0.19
351 0.21
352 0.21
353 0.18
354 0.18
355 0.2
356 0.2
357 0.22
358 0.23
359 0.22
360 0.21
361 0.18
362 0.17
363 0.15
364 0.1
365 0.08
366 0.06
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.11
379 0.13
380 0.12
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.11
393 0.17
394 0.23
395 0.27
396 0.31
397 0.32
398 0.32
399 0.31
400 0.31
401 0.3
402 0.25
403 0.23
404 0.18
405 0.17
406 0.16
407 0.14
408 0.11
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.11
417 0.16
418 0.14
419 0.16
420 0.18
421 0.2
422 0.2
423 0.24
424 0.31
425 0.34
426 0.42
427 0.49
428 0.53
429 0.57
430 0.65
431 0.71
432 0.72
433 0.75
434 0.79
435 0.81
436 0.84
437 0.87
438 0.89
439 0.88
440 0.88
441 0.85
442 0.81
443 0.79
444 0.77
445 0.72
446 0.66
447 0.57
448 0.47
449 0.39
450 0.32
451 0.24
452 0.18
453 0.14
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.07
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.05
474 0.11
475 0.14
476 0.19
477 0.21
478 0.23
479 0.27
480 0.31
481 0.35
482 0.39
483 0.44
484 0.41
485 0.4
486 0.39
487 0.36
488 0.33
489 0.28
490 0.2
491 0.12
492 0.18
493 0.17
494 0.17
495 0.25
496 0.25
497 0.26
498 0.35
499 0.39
500 0.37
501 0.4
502 0.44
503 0.39
504 0.4
505 0.4
506 0.31
507 0.27
508 0.23
509 0.19
510 0.15
511 0.11
512 0.08
513 0.07
514 0.05
515 0.04
516 0.03
517 0.03
518 0.02
519 0.02
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.04
525 0.04
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.07
530 0.1
531 0.11
532 0.14
533 0.14
534 0.12
535 0.12
536 0.13
537 0.14
538 0.12
539 0.12
540 0.1
541 0.11
542 0.12
543 0.12
544 0.18
545 0.19
546 0.19
547 0.22
548 0.2
549 0.22
550 0.22
551 0.25
552 0.22
553 0.26
554 0.31
555 0.3
556 0.3
557 0.29
558 0.27
559 0.25
560 0.22
561 0.18
562 0.14
563 0.15
564 0.15
565 0.15
566 0.15
567 0.13
568 0.12
569 0.1
570 0.09
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.05
578 0.05
579 0.04
580 0.04
581 0.05
582 0.07
583 0.09
584 0.09
585 0.1
586 0.12
587 0.12
588 0.12
589 0.11
590 0.12
591 0.12
592 0.13
593 0.13
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.11
598 0.09
599 0.11
600 0.14
601 0.14
602 0.19
603 0.23
604 0.24
605 0.25
606 0.29
607 0.27
608 0.28
609 0.28
610 0.24
611 0.22
612 0.21
613 0.18
614 0.14
615 0.13
616 0.08
617 0.07
618 0.07
619 0.06
620 0.06
621 0.07
622 0.08
623 0.09
624 0.11
625 0.16
626 0.2
627 0.21
628 0.22
629 0.21
630 0.23
631 0.22
632 0.23
633 0.2
634 0.18
635 0.18
636 0.19
637 0.18
638 0.16
639 0.18
640 0.14
641 0.13
642 0.1
643 0.1
644 0.08
645 0.08
646 0.09
647 0.07
648 0.06
649 0.07
650 0.08
651 0.09
652 0.11
653 0.15
654 0.18
655 0.24
656 0.29
657 0.35
658 0.36
659 0.35
660 0.35
661 0.37
662 0.43
663 0.46
664 0.44
665 0.41
666 0.44
667 0.48
668 0.48
669 0.47
670 0.49
671 0.52
672 0.54
673 0.6
674 0.61
675 0.62
676 0.66
677 0.68
678 0.62
679 0.59
680 0.62
681 0.61
682 0.63
683 0.58
684 0.56
685 0.55
686 0.59
687 0.58
688 0.59
689 0.59
690 0.55
691 0.54
692 0.51
693 0.44
694 0.35
695 0.31
696 0.22
697 0.15
698 0.12
699 0.1
700 0.1
701 0.09
702 0.09
703 0.05
704 0.05
705 0.04
706 0.04
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.04
714 0.04
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.04
719 0.04
720 0.05
721 0.06
722 0.07
723 0.07
724 0.08
725 0.11
726 0.17
727 0.2
728 0.24
729 0.28
730 0.28
731 0.3
732 0.3
733 0.3
734 0.25
735 0.26
736 0.23