Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D8PTI4

Protein Details
Accession D8PTI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
201-222GYVYRPQRVPKRKTLERRRAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-218KRKTLERR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG scm:SCHCO_02045557  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MPVLRTRDTSSRPLEVTTDAPEVPTVAIVSPTPRAFTFPPDNHLDDSPYSTPSSSPFEPELSPSQRTSSPASFPSASTSATPGPAPAPLTPFGAAPLPSPSRAHQVHRRQVSDSSVDRRPKKGDEDYIKRPENAFILFRRKCVEERAQRDPNGAPLPKKQRQADLSKTISAQWKALSSDERQYWEALAREKKREHEQQYPGYVYRPQRVPKRKTLERRRAAAAAAQAQQAGKHSGDDDEYVPPAAAGSVRRSESSDAALPARYSFVVPMRTHGRSVSAPTPPPYQSITVPRVYARTPDANADAPSLLPLLQGRPGFDYVPPSFGQAATQFGRPPQGFEPQLPQPPHPHQWPQATTYQEPSYTSMPQEYAPPTQEYHHNGWAQDAPMLSPASSTGPATPTSQHHVSDFAEDKRRADLDSRLEQQLTAQAQQQQYAGQTYEPYPFTNPFAPESQQPQQQGFDLAPVSPNEQAPFIQQPTDQFSSPAYSPEEQFNGAESFNAADTSSFNTCDNGQFSNAYPQYDSALFANDGSSFPADGPGYNWWPPSSDVFAPDDFDINAIPGVQLDVSRFDDGQPAFGGEAAQFGDAGFGGGEFNVSGSKATFASEWGQQDMGFGQGQEQYQAEWATEQQYHVQEYATSPVAANAPTTGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.38
3 0.35
4 0.31
5 0.29
6 0.23
7 0.22
8 0.21
9 0.19
10 0.17
11 0.15
12 0.11
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.12
17 0.17
18 0.17
19 0.19
20 0.18
21 0.23
22 0.23
23 0.31
24 0.38
25 0.36
26 0.41
27 0.44
28 0.47
29 0.45
30 0.45
31 0.4
32 0.32
33 0.35
34 0.31
35 0.27
36 0.25
37 0.23
38 0.22
39 0.22
40 0.28
41 0.23
42 0.25
43 0.25
44 0.27
45 0.27
46 0.31
47 0.36
48 0.34
49 0.36
50 0.33
51 0.34
52 0.34
53 0.36
54 0.38
55 0.34
56 0.34
57 0.33
58 0.38
59 0.35
60 0.33
61 0.36
62 0.31
63 0.28
64 0.24
65 0.25
66 0.21
67 0.21
68 0.21
69 0.16
70 0.15
71 0.16
72 0.17
73 0.15
74 0.17
75 0.17
76 0.2
77 0.19
78 0.18
79 0.17
80 0.18
81 0.17
82 0.14
83 0.19
84 0.19
85 0.21
86 0.23
87 0.24
88 0.3
89 0.33
90 0.4
91 0.44
92 0.52
93 0.6
94 0.65
95 0.66
96 0.6
97 0.6
98 0.57
99 0.53
100 0.48
101 0.45
102 0.45
103 0.51
104 0.52
105 0.53
106 0.54
107 0.52
108 0.54
109 0.56
110 0.58
111 0.6
112 0.64
113 0.69
114 0.73
115 0.71
116 0.65
117 0.58
118 0.5
119 0.43
120 0.37
121 0.32
122 0.29
123 0.37
124 0.36
125 0.37
126 0.38
127 0.38
128 0.36
129 0.4
130 0.44
131 0.44
132 0.5
133 0.57
134 0.62
135 0.6
136 0.61
137 0.54
138 0.5
139 0.47
140 0.44
141 0.38
142 0.39
143 0.49
144 0.52
145 0.59
146 0.55
147 0.56
148 0.59
149 0.65
150 0.64
151 0.63
152 0.6
153 0.54
154 0.52
155 0.47
156 0.47
157 0.39
158 0.32
159 0.25
160 0.24
161 0.23
162 0.24
163 0.24
164 0.2
165 0.26
166 0.27
167 0.29
168 0.27
169 0.27
170 0.25
171 0.26
172 0.25
173 0.26
174 0.32
175 0.33
176 0.4
177 0.42
178 0.47
179 0.52
180 0.59
181 0.58
182 0.59
183 0.62
184 0.61
185 0.63
186 0.61
187 0.53
188 0.45
189 0.45
190 0.38
191 0.37
192 0.37
193 0.39
194 0.46
195 0.56
196 0.61
197 0.65
198 0.71
199 0.74
200 0.79
201 0.84
202 0.84
203 0.82
204 0.8
205 0.74
206 0.65
207 0.57
208 0.48
209 0.41
210 0.35
211 0.28
212 0.24
213 0.21
214 0.19
215 0.19
216 0.17
217 0.16
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.09
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.18
242 0.18
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.11
253 0.16
254 0.16
255 0.2
256 0.24
257 0.25
258 0.25
259 0.24
260 0.24
261 0.19
262 0.23
263 0.24
264 0.22
265 0.23
266 0.25
267 0.28
268 0.25
269 0.26
270 0.24
271 0.21
272 0.21
273 0.25
274 0.27
275 0.24
276 0.25
277 0.23
278 0.23
279 0.22
280 0.21
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.17
285 0.19
286 0.19
287 0.19
288 0.17
289 0.14
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.17
305 0.14
306 0.16
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.14
311 0.14
312 0.1
313 0.13
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.17
319 0.16
320 0.18
321 0.16
322 0.21
323 0.21
324 0.21
325 0.25
326 0.24
327 0.3
328 0.29
329 0.29
330 0.28
331 0.32
332 0.36
333 0.35
334 0.36
335 0.35
336 0.4
337 0.41
338 0.38
339 0.39
340 0.38
341 0.35
342 0.34
343 0.29
344 0.23
345 0.22
346 0.21
347 0.19
348 0.16
349 0.16
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.15
354 0.15
355 0.15
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.17
360 0.22
361 0.24
362 0.25
363 0.28
364 0.28
365 0.27
366 0.28
367 0.28
368 0.23
369 0.19
370 0.16
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.09
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.09
382 0.1
383 0.12
384 0.13
385 0.14
386 0.19
387 0.21
388 0.21
389 0.2
390 0.21
391 0.2
392 0.22
393 0.23
394 0.22
395 0.28
396 0.28
397 0.28
398 0.28
399 0.28
400 0.25
401 0.24
402 0.26
403 0.25
404 0.3
405 0.33
406 0.32
407 0.31
408 0.3
409 0.28
410 0.27
411 0.22
412 0.17
413 0.17
414 0.2
415 0.21
416 0.22
417 0.22
418 0.17
419 0.17
420 0.17
421 0.15
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.15
426 0.15
427 0.15
428 0.16
429 0.17
430 0.2
431 0.22
432 0.22
433 0.21
434 0.22
435 0.23
436 0.24
437 0.29
438 0.31
439 0.32
440 0.32
441 0.31
442 0.3
443 0.29
444 0.27
445 0.2
446 0.17
447 0.13
448 0.12
449 0.12
450 0.11
451 0.13
452 0.13
453 0.14
454 0.12
455 0.13
456 0.13
457 0.14
458 0.18
459 0.17
460 0.17
461 0.17
462 0.19
463 0.25
464 0.27
465 0.24
466 0.2
467 0.2
468 0.22
469 0.22
470 0.22
471 0.19
472 0.18
473 0.19
474 0.22
475 0.23
476 0.2
477 0.2
478 0.19
479 0.17
480 0.15
481 0.14
482 0.11
483 0.1
484 0.09
485 0.09
486 0.07
487 0.06
488 0.07
489 0.11
490 0.12
491 0.12
492 0.12
493 0.13
494 0.14
495 0.17
496 0.19
497 0.16
498 0.16
499 0.17
500 0.18
501 0.26
502 0.27
503 0.25
504 0.23
505 0.22
506 0.24
507 0.23
508 0.23
509 0.13
510 0.15
511 0.14
512 0.13
513 0.13
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.09
519 0.09
520 0.12
521 0.11
522 0.11
523 0.13
524 0.16
525 0.2
526 0.21
527 0.22
528 0.19
529 0.21
530 0.23
531 0.25
532 0.25
533 0.22
534 0.23
535 0.25
536 0.25
537 0.25
538 0.24
539 0.21
540 0.16
541 0.15
542 0.12
543 0.1
544 0.1
545 0.07
546 0.07
547 0.05
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.11
553 0.14
554 0.15
555 0.15
556 0.15
557 0.22
558 0.21
559 0.22
560 0.19
561 0.17
562 0.15
563 0.15
564 0.15
565 0.09
566 0.1
567 0.09
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.06
573 0.06
574 0.05
575 0.04
576 0.05
577 0.04
578 0.05
579 0.04
580 0.05
581 0.05
582 0.06
583 0.06
584 0.07
585 0.09
586 0.09
587 0.1
588 0.1
589 0.12
590 0.14
591 0.19
592 0.21
593 0.21
594 0.21
595 0.2
596 0.2
597 0.19
598 0.18
599 0.13
600 0.11
601 0.11
602 0.14
603 0.15
604 0.16
605 0.16
606 0.14
607 0.16
608 0.17
609 0.15
610 0.13
611 0.14
612 0.17
613 0.18
614 0.19
615 0.22
616 0.24
617 0.26
618 0.25
619 0.25
620 0.21
621 0.22
622 0.25
623 0.21
624 0.19
625 0.16
626 0.18
627 0.19
628 0.18
629 0.17